RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546023.1

TCP1-217, Transcript of t-complex 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TCP1, Length 1,135 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1-217ENST00000546023 SEC24BO95487 1268 aa29.08■■■□□ 2.25
TCP1-217ENST00000546023 ICAM3P32942 547 aa29.08■■■□□ 2.25
TCP1-217ENST00000546023 PPTC7Q8NI37 304 aa29.08■■■□□ 2.25
TCP1-217ENST00000546023 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
TCP1-217ENST00000546023 RTEL1Q9NZ71 1219 aa29.08■■■□□ 2.25
TCP1-217ENST00000546023 RAG1P15918 1043 aa29.07■■■□□ 2.24
TCP1-217ENST00000546023 STK3Q13188 491 aa29.07■■■□□ 2.24
TCP1-217ENST00000546023 PKN1Q16512 942 aa29.07■■■□□ 2.24
TCP1-217ENST00000546023 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
TCP1-217ENST00000546023 CPLX1O14810 134 aa29.06■■■□□ 2.24
TCP1-217ENST00000546023 SORBS3O60504 671 aa29.06■■■□□ 2.24
TCP1-217ENST00000546023 PPFIA3O75145 1194 aa29.06■■■□□ 2.24
TCP1-217ENST00000546023 AP3B2Q13367 1082 aa29.06■■■□□ 2.24
TCP1-217ENST00000546023 DGKDQ16760 1214 aa29.06■■■□□ 2.24
TCP1-217ENST00000546023 C8orf34Q49A92 452 aa29.06■■■□□ 2.24
TCP1-217ENST00000546023 MYSM1Q5VVJ2 828 aa29.06■■■□□ 2.24
TCP1-217ENST00000546023 NLRX1Q86UT6 975 aa29.06■■■□□ 2.24
TCP1-217ENST00000546023 BADQ92934 168 aa29.06■■■□□ 2.24
TCP1-217ENST00000546023 ESYT2A0FGR8 921 aa29.05■■■□□ 2.24
TCP1-217ENST00000546023 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa29.05■■■□□ 2.24
TCP1-217ENST00000546023 FOSP01100 380 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
TCP1-217ENST00000546023 CD4P01730 458 aa29.05■■■□□ 2.24
TCP1-217ENST00000546023 ITGB8P26012 769 aa29.05■■■□□ 2.24
TCP1-217ENST00000546023 SP2Q02086 613 aa29.05■■■□□ 2.24
TCP1-217ENST00000546023 SEMA3FQ13275 785 aa29.05■■■□□ 2.24
TCP1-217ENST00000546023 TRIM22Q8IYM9 498 aa29.05■■■□□ 2.24
TCP1-217ENST00000546023 TDHQ8IZJ6 230 aa29.05■■■□□ 2.24
TCP1-217ENST00000546023 SPATA33Q96N06 139 aa29.05■■■□□ 2.24
TCP1-217ENST00000546023 ANO3Q9BYT9 981 aa29.05■■■□□ 2.24
TCP1-217ENST00000546023 MLXIPQ9HAP2 919 aa29.05■■■□□ 2.24
TCP1-217ENST00000546023 B4GALT4O60513 344 aa29.04■■■□□ 2.24
TCP1-217ENST00000546023 ANKRD1Q15327 319 aa29.04■■■□□ 2.24
TCP1-217ENST00000546023 FAM47CQ5HY64 1035 aa29.04■■■□□ 2.24
TCP1-217ENST00000546023 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
TCP1-217ENST00000546023 CCDC148Q8NFR7 591 aa29.04■■■□□ 2.24
TCP1-217ENST00000546023 GPRASP2Q96D09 838 aa29.04■■■□□ 2.24
TCP1-217ENST00000546023 PGBD1Q96JS3 809 aa29.04■■■□□ 2.24
TCP1-217ENST00000546023 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
TCP1-217ENST00000546023 MYH7BA7E2Y1 1941 aa29.04■■■□□ 2.24
TCP1-217ENST00000546023 CLK2P49760 499 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
TCP1-217ENST00000546023 AK2P54819 239 aa29.03■■■□□ 2.24
TCP1-217ENST00000546023 NEDD9Q14511 834 aa29.03■■■□□ 2.24
TCP1-217ENST00000546023 NBPF20Q3BBV1 942 aa29.03■■■□□ 2.24
TCP1-217ENST00000546023 HSDL1Q3SXM5 330 aa29.03■■■□□ 2.24
TCP1-217ENST00000546023 ZMYND12Q9H0C1 365 aa29.03■■■□□ 2.24
TCP1-217ENST00000546023 ZNF286BP0CG31 522 aa29.02■■■□□ 2.24
TCP1-217ENST00000546023 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
TCP1-217ENST00000546023 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP29.02■■■□□ 2.24
TCP1-217ENST00000546023 CHMP4BP1P59074 171 aa29.02■■■□□ 2.24
TCP1-217ENST00000546023 NFRKBQ6P4R8 1299 aa29.02■■■□□ 2.24
TCP1-217ENST00000546023 CDHR1Q96JP9 859 aa29.02■■■□□ 2.24
TCP1-217ENST00000546023 TRPV6Q9H1D0 765 aa29.02■■■□□ 2.24
TCP1-217ENST00000546023 C6orf50Q9HD87 102 aa29.02■■■□□ 2.24
TCP1-217ENST00000546023 TMEM260Q9NX78 707 aa29.02■■■□□ 2.24
TCP1-217ENST00000546023 F2P00734 622 aa29.01■■■□□ 2.23
TCP1-217ENST00000546023 TIMP1P01033 207 aa29.01■■■□□ 2.23
TCP1-217ENST00000546023 ITGB5P18084 799 aa29.01■■■□□ 2.23
TCP1-217ENST00000546023 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
TCP1-217ENST00000546023 MTMR1Q13613 665 aa29.01■■■□□ 2.23
TCP1-217ENST00000546023 METTL7BQ6UX53 244 aa29.01■■■□□ 2.23
TCP1-217ENST00000546023 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
TCP1-217ENST00000546023 KATNAL1Q9BW62 490 aa29.01■■■□□ 2.23
TCP1-217ENST00000546023 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa29.01■■■□□ 2.23
TCP1-217ENST00000546023 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
TCP1-217ENST00000546023 TPCN1Q9ULQ1 816 aa29.01■■■□□ 2.23
TCP1-217ENST00000546023 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa29.01■■■□□ 2.23
TCP1-217ENST00000546023 DOCK5Q9H7D0 1870 aa29.01■■■□□ 2.23
TCP1-217ENST00000546023 NOP56O00567 594 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
TCP1-217ENST00000546023 SREBF1P36956 1147 aa29■■■□□ 2.23
TCP1-217ENST00000546023 FPGSQ05932 587 aa29■■■□□ 2.23
TCP1-217ENST00000546023 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
TCP1-217ENST00000546023 SCRN1Q12765 414 aa29■■■□□ 2.23
TCP1-217ENST00000546023 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa29■■■□□ 2.23
TCP1-217ENST00000546023 KAT2BQ92831 832 aa29■■■□□ 2.23
TCP1-217ENST00000546023 SENP7Q9BQF6 1050 aa29■■■□□ 2.23
TCP1-217ENST00000546023 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
TCP1-217ENST00000546023 VPS54Q9P1Q0 977 aa29■■■□□ 2.23
TCP1-217ENST00000546023 CDKL5O76039 1030 aa28.99■■■□□ 2.23
TCP1-217ENST00000546023 DEXIO95424 95 aa28.99■■■□□ 2.23
TCP1-217ENST00000546023 GNA11P29992 359 aa28.99■■■□□ 2.23
TCP1-217ENST00000546023 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa28.99■■■□□ 2.23
TCP1-217ENST00000546023 CYFIP1Q7L576 1253 aa28.99■■■□□ 2.23
TCP1-217ENST00000546023 HIPK3Q9H422 1215 aa28.99■■■□□ 2.23
TCP1-217ENST00000546023 PFKFB2O60825 505 aa28.98■■■□□ 2.23
TCP1-217ENST00000546023 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa28.98■■■□□ 2.23
TCP1-217ENST00000546023 MCTP2Q6DN12 878 aa28.98■■■□□ 2.23
TCP1-217ENST00000546023 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
TCP1-217ENST00000546023 BICD2Q8TD16 824 aa28.98■■■□□ 2.23
TCP1-217ENST00000546023 BCAS3Q9H6U6 928 aa28.98■■■□□ 2.23
TCP1-217ENST00000546023 JADE2Q9NQC1 790 aa28.98■■■□□ 2.23
TCP1-217ENST00000546023 LAMA3Q16787 3333 aa28.97■■■□□ 2.23
TCP1-217ENST00000546023 PPFIA4O75335 1185 aa28.97■■■□□ 2.23
TCP1-217ENST00000546023 KCNA2P16389 499 aa28.97■■■□□ 2.23
TCP1-217ENST00000546023 PSEN2P49810 448 aa28.97■■■□□ 2.23
TCP1-217ENST00000546023 NEK4P51957 841 aa28.97■■■□□ 2.23
TCP1-217ENST00000546023 MFSD10Q14728 455 aa28.97■■■□□ 2.23
TCP1-217ENST00000546023 MFSD5Q6N075 450 aa28.97■■■□□ 2.23
TCP1-217ENST00000546023 SH3GLB2Q9NR46 395 aa28.97■■■□□ 2.23
TCP1-217ENST00000546023 ARHGAP4P98171 946 aa28.96■■■□□ 2.23
TCP1-217ENST00000546023 SP4Q02446 784 aa28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms