RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533025.1

YPEL4-208, Transcript of yippee like 4, human

TSL 4

Gene YPEL4, Length 563 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
YPEL4-208	ENST00000533025	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	PKN1	Q16512	942 aa		13.64	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	DGKD	Q16760	1214 aa		13.64	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	C8orf34	Q49A92	452 aa		13.64	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		13.64	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		13.64	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		13.64	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	IL17RA	Q96F46	866 aa		13.64	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		13.64	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025		A0A1W2PPC1	479 aa		13.63	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		13.63	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	KIAA0355	O15063	1070 aa		13.63	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	RAG1	P15918	1043 aa		13.63	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	AK2	P54819	239 aa		13.63	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	CHMP4BP1	P59074	171 aa		13.63	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	PPTC7	Q8NI37	304 aa		13.63	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	BAD	Q92934	168 aa		13.63	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	SPATA33	Q96N06	139 aa		13.63	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		13.63	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	C6orf50	Q9HD87	102 aa		13.63	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		13.63	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		13.62	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	ESYT2	A0FGR8	921 aa		13.62	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	B4GALT4	O60513	344 aa		13.62	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	CD4	P01730	458 aa		13.62	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	GNA11	P29992	359 aa		13.62	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	NEK4	P51957	841 aa		13.62	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	AP3B2	Q13367	1082 aa		13.62	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	NEDD9	Q14511	834 aa		13.62	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		13.62	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		13.62	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		13.62	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		13.62	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	GPRASP2	Q96D09	838 aa		13.62	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	CDHR1	Q96JP9	859 aa		13.62	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	PGBD1	Q96JS3	809 aa		13.62	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	ANO3	Q9BYT9	981 aa		13.62	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	TMEM260	Q9NX78	707 aa		13.62	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	LTBP2	Q14767	1821 aa		13.62	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	PPFIA4	O75335	1185 aa		13.61	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	CDKL5	O76039	1030 aa		13.61	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	DEXI	O95424	95 aa		13.61	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	TIMP1	P01033	207 aa		13.61	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	ITGB5	P18084	799 aa		13.61	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	ITGB8	P26012	769 aa		13.61	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	SCRN1	Q12765	414 aa		13.61	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	SEMA3F	Q13275	785 aa		13.61	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	MTMR1	Q13613	665 aa		13.61	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		13.61	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	MCTP2	Q6DN12	878 aa		13.61	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		13.61	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		13.61	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		13.61	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		13.61	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		13.61	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		13.61	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		13.61	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		13.61	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	TBX21	Q9UL17	535 aa		13.61	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		13.61	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	MAFG	O15525	162 aa		13.6	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	PFKFB2	O60825	505 aa		13.6	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		13.6	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	NLRP5	P59047	1200 aa		13.6	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	METTL7B	Q6UX53	244 aa		13.6	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	TDH	Q8IZJ6	230 aa		13.6	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	BICD2	Q8TD16	824 aa		13.6	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		13.6	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	KAT2B	Q92831	832 aa		13.6	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		13.6	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		13.6	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	JADE2	Q9NQC1	790 aa		13.6	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	ATP9A	O75110	1047 aa		13.59	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	ZNF286B	P0CG31	522 aa		13.59	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	ZNF76	P36508	570 aa		13.59	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	SREBF1	P36956	1147 aa		13.59	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	PSEN2	P49810	448 aa		13.59	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	ARHGAP4	P98171	946 aa		13.59	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	FPGS	Q05932	587 aa		13.59	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	ALG1	Q9BT22	464 aa		13.59	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	HIPK3	Q9H422	1215 aa		13.59	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		13.59	□□□□□ -0.23
YPEL4-208	ENST00000533025	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		13.58	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	ADAMTS3	O15072	1205 aa		13.58	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	F2	P00734	622 aa		13.58	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	KCNA2	P16389	499 aa		13.58	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	SP4	Q02446	784 aa		13.58	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	MFSD10	Q14728	455 aa		13.58	□□□□□ -0.24

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