RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526550.1

PTPRJ-203, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRJ, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-203ENST00000526550 ZNF618Q5T7W0 954 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 KCNV1Q6PIU1 500 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 SPRED2Q7Z698 418 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 IL31RAQ8NI17 732 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 CTAGE1Q96RT6 745 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 PIGSQ96S52 555 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 IL25Q9H293 177 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 MAD2L2Q9UI95 211 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 GBF1Q92538 1859 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 C17orf102A2RUQ5 167 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 NOP56O00567 594 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 PARNO95453 639 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 BMP1P13497 986 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 SP4Q02446 784 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 TRAF1Q13077 416 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 GRM4Q14833 912 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 GPNMBQ14956 572 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 WTAPQ15007 396 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 SART3Q15020 963 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 SEC23AQ15436 765 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 TCTN1Q2MV58 587 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 HSDL1Q3SXM5 330 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 TTC22Q5TAA0 569 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 CATIPQ7Z7H3 387 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 MYOCDQ8IZQ8 938 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 RUFY2Q8WXA3 655 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP8.49□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 WNT8BQ93098 351 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 HLA-CQ95604 372 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 COG5Q9UP83 839 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 SCN5AQ14524 2016 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 CHD9Q3L8U1 2897 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 RSPH10B2B2RC85 870 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 HAS3O00219 553 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 EFCAB14O75071 495 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 PPFIA4O75335 1185 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 LGR5O75473 907 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 RGS20O76081 388 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 GJB5O95377 273 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 CXCL10P02778 98 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 AMHP03971 560 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 CYP21A2P08686 494 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 CTSHP09668 335 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 RSPH10BP0C881 870 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 SP2Q02086 613 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 PTH1RQ03431 593 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 RBL2Q08999 1139 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 GNPTABQ3T906 1256 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 MYSM1Q5VVJ2 828 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP8.48□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 STOX1Q6ZVD7 989 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 VSIG10LQ86VR7 867 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 ATP6V0A1Q93050 837 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 MTMR8Q96EF0 704 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 RAD9AQ99638 391 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 SENP2Q9HC62 589 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 RTEL1Q9NZ71 1219 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 TANC1Q9C0D5 1861 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 EMSYQ7Z589 1322 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 VCANP13611 3396 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 MYO9BQ13459 2157 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 LAMA4Q16363 1823 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 LINC01553A4QN01 128 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 H3BRB1 525 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 LGALS2P05162 132 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 PDE4AP27815 886 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 GHRHRQ02643 423 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 HIC1Q14526 733 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 MBTPS1Q14703 1052 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 SLC35G1Q2M3R5 365 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 TRAF7Q6Q0C0 670 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 NFXL1Q6ZNB6 911 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 CYFIP1Q7L576 1253 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 SERINC5Q86VE9 423 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 SAMD3Q8N6K7 520 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 DBF4BQ8NFT6 615 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 NCOA7Q8NI08 942 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 SEPT8Q92599 483 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 CUL5Q93034 780 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 MYL10Q9BUA6 226 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRJ-203ENST00000526550 RIOX1Q9H6W3 641 aa8.47□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.5 ms