RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520389.5

ITGB2-216, Transcript of integrin subunit beta 2, humanhuman

TSL 5

Gene ITGB2, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2-216ENST00000520389 VTI1AQ96AJ9 217 aa16.02■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 GLT1D1Q96MS3 346 aa16.02■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 SLC26A6Q9BXS9 759 aa16.02■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 GLT8D2Q9H1C3 349 aa16.02■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 PRDM6Q9NQX0 595 aa16.02■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 TPCN1Q9ULQ1 816 aa16.02■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 PCDHA6Q9UN73 950 aa16.02■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa16.02■□□□□ 0.16
ITGB2-216ENST00000520389 MYO9BQ13459 2157 aa16.02■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 SPDYE3A6NKU9 549 aa16.01■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 PFKFB2O60825 505 aa16.01■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 STAM2O75886 525 aa16.01■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 CABYRO75952 493 aa16.01■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 FOSP01100 380 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 GH1P01241 217 aa16.01■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 ADCY7P51828 1080 aa16.01■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 PCNX4Q63HM2 1172 aa16.01■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 CXCL17Q6UXB2 119 aa16.01■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 TRIM22Q8IYM9 498 aa16.01■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 C22orf23Q9BZE7 217 aa16.01■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 STARD7Q9NQZ5 370 aa16.01■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 RTEL1Q9NZ71 1219 aa16.01■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 MRVI1Q9Y6F6 885 aa16.01■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 ESYT2A0FGR8 921 aa16■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 A6NJR5 290 aa16■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 RBM25P49756 843 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 CPT1AP50416 773 aa16■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 SCRN1Q12765 414 aa16■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 KIF2CQ99661 725 aa16■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 ZMYND12Q9H0C1 365 aa16■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 LRRC37A2A6NM11 1700 aa15.99■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa15.99■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 KIAA0355O15063 1070 aa15.99■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 GNA11P29992 359 aa15.99■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 ICAM3P32942 547 aa15.99■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 CLK2P49760 499 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 CDK7P50613 346 aa15.99■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 SP2Q02086 613 aa15.99■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 LAMC2Q13753 1193 aa15.99■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 GRIN2CQ14957 1233 aa15.99■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 GNPTABQ3T906 1256 aa15.99■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 EHMT1Q9H9B1 1298 aa15.99■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 C6orf50Q9HD87 102 aa15.99■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 SH3GLB2Q9NR46 395 aa15.99■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 POLR3EQ9NVU0 708 aa15.99■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 ARVCFO00192 962 aa15.98■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 KPNA6O60684 536 aa15.98■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 CDKL5O76039 1030 aa15.98■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 DEXIO95424 95 aa15.98■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 FOSL2P15408 326 aa15.98■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 PURAQ00577 322 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 ARHGAP1Q07960 439 aa15.98■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 AP3B2Q13367 1082 aa15.98■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 ME3Q16798 604 aa15.98■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 NLRX1Q86UT6 975 aa15.98■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 AFG1LQ8WV93 481 aa15.98■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 TOX2Q96NM4 488 aa15.98■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 FIBPO43427 364 aa15.97■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 MYL3P08590 195 aa15.97■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 CLTBP09497 229 aa15.97■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 FAAP100Q0VG06 881 aa15.97■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 SEMA3FQ13275 785 aa15.97■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 MYSM1Q5VVJ2 828 aa15.97■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa15.97■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 MCTP2Q6DN12 878 aa15.97■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa15.97■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 NECAB1Q8N987 351 aa15.97■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 SLC43A3Q8NBI5 491 aa15.97■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 CCDC148Q8NFR7 591 aa15.97■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 TMEM260Q9NX78 707 aa15.97■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 VPS54Q9P1Q0 977 aa15.97■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa15.97■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa15.97■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 GRIN2DO15399 1336 aa15.96■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 TMEM265A0A087WTH1 108 aa15.96■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 DCDC2CA8MYV0 355 aa15.96■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 GGPS1O95749 300 aa15.96■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 ITGB5P18084 799 aa15.96■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 NLRP5P59047 1200 aa15.96■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 ITGA7Q13683 1181 aa15.96■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 C16orf59Q7L2K0 433 aa15.96■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 PPTC7Q8NI37 304 aa15.96■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 BICD2Q8TD16 824 aa15.96■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 GPRASP2Q96D09 838 aa15.96■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 PGBD1Q96JS3 809 aa15.96■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 SENP7Q9BQF6 1050 aa15.96■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa15.96■□□□□ 0.15
ITGB2-216ENST00000520389 ANO3Q9BYT9 981 aa15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45 ms