RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518877.1

PCM1-208, Transcript of pericentriolar material 1, human

TSL 3

Gene PCM1, Length 316 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCM1-208	ENST00000518877	SOX9	P48436	509 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	PAK2	Q13177	524 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	VHLL	Q6RSH7	139 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	C19orf47	Q8N9M1	422 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	BVES	Q8NE79	360 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	OR6P1	Q8NGX9	317 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	TOE1	Q96GM8	510 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	WRNIP1	Q96S55	665 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	DTL	Q9NZJ0	730 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	EMC9	Q9Y3B6	208 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	GIPR	P48546	466 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	GTF2A2	P52657	109 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	CHRNA2	Q15822	529 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	IQCE	Q6IPM2	695 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	TMEM169	Q96HH4	297 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	APBA2	Q99767	749 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	PATE3	B3GLJ2	98 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	NAT2	P11245	290 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	BCL6	P41182	706 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	TGFB2	P61812	414 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	NFATC3	Q12968	1075 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	FHL2	Q14192	279 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	HS1BP3	Q53T59	392 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	GTF2IRD2B	Q6EKJ0	949 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	GTF2IRD2	Q86UP8	949 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	DIO2	Q92813	273 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	TMEM209	Q96SK2	561 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877		X6R8D5	127 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	TEPP	Q6URK8	271 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	NLRP10	Q86W26	655 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877		Q8TCH9	128 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	FRS2	Q8WU20	508 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	TCRBV5S2	A0A599	114 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	NPIPB8	E9PQR5	432 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	SCAMP3	O14828	347 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	RECK	O95980	971 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	VAMP1	P23763	118 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	STEAP3	Q658P3	488 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	SPATA32	Q96LK8	384 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	ECI1	P42126	302 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	KCNAB2	Q13303	367 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	NRN1L	Q496H8	165 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877		Q8N1Y9	231 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	SHD	Q96IW2	340 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	GNRHR2	Q96P88	292 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	LGR4	Q9BXB1	951 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	CSRNP2	Q9H175	543 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	LRG1	P02750	347 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	CASP7	P55210	303 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	FOXE3	Q13461	319 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	CCDC103	Q8IW40	242 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	BTN2A2	Q8WVV5	523 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	GPRASP2	Q96D09	838 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	NUDT11	Q96G61	164 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	ADO	Q96SZ5	270 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	ADAM29	Q9UKF5	820 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877		H7BY64	318 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PCM1-208	ENST00000518877	DGKI	O75912	1065 aa		4.72	□□□□□ -1.65

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