RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514141.5

POLK-215, Transcript of DNA polymerase kappa, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene POLK, Length 4,345 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLK-215ENST00000514141 F8W031 263 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 PDXKO00764 312 aa6.42□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 MAPK13O15264 365 aa6.42□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 EZRP15311 586 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 TXKP42681 527 aa6.42□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 MFAP3P55082 362 aa6.42□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 KIAA0753Q2KHM9 967 aa6.42□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 TCERG1LQ5VWI1 586 aa6.42□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 FAM178BQ8IXR5 827 aa6.42□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 PDLIM2Q96JY6 352 aa6.42□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 RAB17Q9H0T7 212 aa6.42□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 PARVGQ9HBI0 331 aa6.42□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 ARFGAP3Q9NP61 516 aa6.42□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 PLCB1Q9NQ66 1216 aa6.42□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 SERTAD1Q9UHV2 236 aa6.42□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 NEDD4P46934 1319 aa6.42□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa6.42□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 SMAPO00193 183 aa6.42□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 GGPS1O95749 300 aa6.42□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 TNNC2P02585 160 aa6.42□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 GTF2H1P32780 548 aa6.42□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 STXBP2Q15833 593 aa6.42□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 C2orf69Q8N8R5 385 aa6.42□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 HAUS1Q96CS2 278 aa6.42□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 KATNAL1Q9BW62 490 aa6.42□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 TMEM63CQ9P1W3 806 aa6.42□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 UQCRHLA0A096LP55 91 aa6.42□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 UQCRHP07919 91 aa6.42□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 CYP3A4P08684 503 aa6.42□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 TNFAIP3P21580 790 aa6.42□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 COPB1P53618 953 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 GNG11P61952 73 aa6.42□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 CDK17Q00537 523 aa6.42□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 SEC23AQ15436 765 aa6.42□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 Q4G0T1 1027 aa6.42□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 NCAPH2Q6IBW4 605 aa6.42□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 MAATS1Q7Z4T9 603 aa6.42□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 DNERQ8NFT8 737 aa6.42□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 SLC7A3Q8WY07 619 aa6.42□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 PBKQ96KB5 322 aa6.42□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa6.42□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 UBA5Q9GZZ9 404 aa6.42□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 CTNND2Q9UQB3 1225 aa6.42□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 STRCQ7RTU9 1775 aa6.42□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP6.41□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 RASA1P20936 1047 aa6.41□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 PSMC5P62195 406 aa6.41□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 BTNL9Q6UXG8 535 aa6.41□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 RHOT2Q8IXI1 618 aa6.41□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 TBCKQ8TEA7 893 aa6.41□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 DOT1LQ8TEK3 1739 aa6.41□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 RAD54LQ92698 747 aa6.41□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 PHKBQ93100 1093 aa6.41□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 TCEANC2Q96MN5 208 aa6.41□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 ZNF577Q9BSK1 485 aa6.41□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa6.41□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 MROH8Q9H579 483 aa6.41□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 PPCSQ9HAB8 311 aa6.41□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 MAST2Q6P0Q8 1798 aa6.41□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 GOLGA6CA6NDK9 693 aa6.41□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 GOLGA6BA6NDN3 693 aa6.41□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 NR1I2O75469 434 aa6.41□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 STK10O94804 968 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 RHOBTB3O94955 611 aa6.41□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 ALDH1A1P00352 501 aa6.41□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 AFPP02771 609 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 GOLGA6DP0CG33 693 aa6.41□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 MAPK6Q16659 721 aa6.41□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 MIGA2Q7L4E1 593 aa6.41□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 KIAA0825Q8IV33 1275 aa6.41□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 VSTM4Q8IW00 320 aa6.41□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 FAXDC2Q96IV6 333 aa6.41□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 PLCD4Q9BRC7 762 aa6.41□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa6.41□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 TEX13BQ9BXU2 312 aa6.41□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa6.41□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 MRVI1Q9Y6F6 885 aa6.41□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 PIK3CDO00329 1044 aa6.41□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 URI1O94763 535 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 TGFB3P10600 412 aa6.41□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 INHBEP58166 350 aa6.41□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 TRPC3Q13507 836 aa6.41□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 SPDYE2Q495Y8 402 aa6.41□□□□□ -1.38
POLK-215ENST00000514141 SLFNL1Q499Z3 407 aa6.41□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.6 ms