RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498804.1

TRBVA-201, Transcript of T cell receptor beta variable A (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene TRBVA, Length 316 nt, Biotype TR V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBVA-201ENST00000498804 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 WASF3Q9UPY6 502 aa4.58□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 ZNF652Q9Y2D9 606 aa4.58□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 MAFKO60675 156 aa4.57□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 ATP2B1P20020 1258 aa4.57□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 SARSP49591 514 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 LSAMPQ13449 338 aa4.57□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 NT5DC1Q5TFE4 455 aa4.57□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 USP53Q70EK8 1073 aa4.57□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 FAM126BQ8IXS8 530 aa4.57□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 TTLL6Q8N841 843 aa4.57□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 KYQ8NBH2 561 aa4.57□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 KCTD13Q8WZ19 329 aa4.57□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 SGSM3Q96HU1 749 aa4.57□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 EXOC2Q96KP1 924 aa4.57□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 SPATA25Q9BR10 227 aa4.57□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 YIPF4Q9BSR8 244 aa4.57□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 PHF20Q9BVI0 1012 aa4.57□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 TRIM55Q9BYV6 548 aa4.57□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 PALD1Q9ULE6 856 aa4.57□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 IQCA1LA6NCM1 817 aa4.56□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 PDPK1O15530 556 aa4.56□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 CYP7B1O75881 506 aa4.56□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 FGFR1P11362 822 aa4.56□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 STAT5AP42229 794 aa4.56□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 EMC4Q5J8M3 183 aa4.56□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 CD300LDQ6UXZ3 194 aa4.56□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 MILR1Q7Z6M3 343 aa4.56□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 STK32CQ86UX6 486 aa4.56□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 CKAP2LQ8IYA6 745 aa4.56□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 ARRDC4Q8NCT1 418 aa4.56□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 SPATA9Q9BWV2 254 aa4.56□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 JAM3Q9BX67 310 aa4.56□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 ADAM7Q9H2U9 754 aa4.56□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 SNTG2Q9NY99 539 aa4.56□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 TRAF6Q9Y4K3 522 aa4.56□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 HGSO14964 777 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 DGKIO75912 1065 aa4.55□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 FAM153BP0C7A2 387 aa4.55□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 RPL13P26373 211 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 THBS2P35442 1172 aa4.55□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 NKX3-2P78367 333 aa4.55□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 PLP2Q04941 152 aa4.55□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 RBL2Q08999 1139 aa4.55□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 KIAA2012Q0VF49 1180 aa4.55□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 RASGRF1Q13972 1273 aa4.55□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 RTP5Q14D33 572 aa4.55□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 FAM209AQ5JX71 171 aa4.55□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 FAM26FQ5R3K3 315 aa4.55□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 UBXN11Q5T124 520 aa4.55□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 CYP4F22Q6NT55 531 aa4.55□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 FAM124AQ86V42 546 aa4.55□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa4.55□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP4.55□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 CHAMP1Q96JM3 812 aa4.55□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 WRNIP1Q96S55 665 aa4.55□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 GORASP1Q9BQQ3 440 aa4.55□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 EPB41L1Q9H4G0 881 aa4.55□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 CLDND1Q9NY35 253 aa4.55□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 RBPJLQ9UBG7 517 aa4.55□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 TELO2Q9Y4R8 837 aa4.55□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 TRAV20A0A0B4J274 112 aa4.54□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 KRIT1O00522 736 aa4.54□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 NOBOXO60393 691 aa4.54□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 TADA3O75528 432 aa4.54□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 CR1LQ2VPA4 569 aa4.54□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 SPATS1Q496A3 300 aa4.54□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 STEAP3Q658P3 488 aa4.54□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 NSMFQ6X4W1 530 aa4.54□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 DBX2Q6ZNG2 339 aa4.54□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 DPH6Q7L8W6 267 aa4.54□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa4.54□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 BDH2Q9BUT1 245 aa4.54□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 LNPKQ9C0E8 428 aa4.54□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 GPR27Q9NS67 375 aa4.54□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 DTLQ9NZJ0 730 aa4.54□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 NUB1Q9Y5A7 615 aa4.54□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa4.54□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 TCRBV5S2A0A599 114 aa4.53□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 LTFP02788 710 aa4.53□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 MTERF2Q49AM1 385 aa4.53□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 STYK1Q6J9G0 422 aa4.53□□□□□ -1.68
TRBVA-201ENST00000498804 BORAQ6PGQ7 559 aa4.53□□□□□ -1.68
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