RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa5.1□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 M0R2C6 588 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 LSM1O15116 133 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 SART1O43290 800 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 NDUFB5O43674 189 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 EVI5O60447 810 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 ENTPD3O75355 529 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 TXNRD3Q86VQ6 643 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 APPBP2Q92624 585 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 PDLIM2Q96JY6 352 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 SPAG5Q96R06 1193 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP5.09□□□□□ -1.593e-30■□□□□ 9
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM39BQ9GZU3 492 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 ANTXR1Q9H6X2 564 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 SRRDQ9UH36 339 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 INTUQ9ULD6 942 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 DLG5Q8TDM6 1919 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 PDHXO00330 501 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 MBD4O95243 580 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 CCNA1P78396 465 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 FOXO4P98177 505 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 LBRQ14739 615 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 TEX35Q5T0J7 233 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 VPS53Q5VIR6 699 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 FBXO33Q7Z6M2 555 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC51AQ86UW1 340 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 C11orf74Q86VG3 221 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 JAZF1Q86VZ6 243 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 TMC2Q8TDI7 906 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 JAKMIP2Q96AA8 810 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 SYNCQ9H7C4 482 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 PPCSQ9HAB8 311 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 TIMM22Q9Y584 194 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 SPDYE3A6NKU9 549 aa5.09□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 ERC2O15083 957 aa5.09□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 NEK2P51955 445 aa5.09□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 PDXDC2PQ6P474 469 aa5.09□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 TNIP2Q8NFZ5 429 aa5.09□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP5.09□□□□□ -1.65e-18■□□□□ 11.2
RABGGTB-213ENST00000496055 BRI3BPQ8WY22 251 aa5.09□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 CROTQ9UKG9 612 aa5.09□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 USTQ9Y2C2 406 aa5.09□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 SQORQ9Y6N5 450 aa5.09□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 DUOX1Q9NRD9 1551 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 RASA4O43374 803 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 CEP104O60308 925 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 STAM2O75886 525 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 CIAO1O76071 339 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 TCP10Q12799 353 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 NECAB2Q7Z6G3 386 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 CERS5Q8N5B7 392 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 WHAMMQ8TF30 809 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 SUCLG2Q96I99 432 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF333Q96JL9 665 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 CEP295NLQ96MC4 621 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 TANGO6Q9C0B7 1094 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 MRGBPQ9NV56 204 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC5A4Q9NY91 659 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 LRP2BPQ9P2M1 347 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 TPCN1Q9ULQ1 816 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 C2CD2Q9Y426 696 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 LRRC37AA6NMS7 1700 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 hCG_1984214I3L0E3 225 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 KDM1AO60341 852 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 GJB1P08034 283 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 KLRK1P26718 216 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 SCYL3Q8IZE3 742 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 LINC00469Q8N7U9 141 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 IQUBQ8NA54 791 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF280CQ8ND82 737 aa5.08□□□□□ -1.6
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