RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490566.1

TNS1-217, Transcript of tensin 1, human

TSL 2

Gene TNS1, Length 1,652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TNS1-217	ENST00000490566	ECE1	P42892	770 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	KCNJ6	P48051	423 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	SNAP25	P60880	206 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	USP17L24	Q0WX57	530 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	ADGRD1	Q6QNK2	874 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	ADSSL1	Q8N142	457 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	NELFB	Q8WX92	580 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	HAS1	Q92839	578 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	TRIM9	Q9C026	710 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	SHTN1	A0MZ66	631 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	POTEM	A6NI47	508 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	WNT10B	O00744	389 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	CYP3A7	P24462	503 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	PRCP	P42785	496 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	USP11	P51784	963 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	MAP3K10	Q02779	954 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	NR1I3	Q14994	352 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	TNIP1	Q15025	636 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	JDP2	Q8WYK2	163 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	ZFR	Q96KR1	1074 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	OPLAH	O14841	1288 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	CAP2	P40123	477 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	STAT2	P52630	851 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	SPAG1	Q07617	926 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	USH1G	Q495M9	461 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	SH2D4A	Q9H788	454 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	VCPKMT	Q9H867	229 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	WDR90	Q96KV7	1748 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	SLC26A4	O43511	780 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	NRDC	O43847	1150 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	PLA2G6	O60733	806 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	PBX1	P40424	430 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	RFC5	P40937	340 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	ASIC1	P78348	528 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	AMPD3	Q01432	767 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	STIM1	Q13586	685 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	PTPN21	Q16825	1174 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	HYI	Q5T013	277 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	KRT79	Q5XKE5	535 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	SPECC1L	Q69YQ0	1117 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	RAD54L	Q92698	747 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	TMX1	Q9H3N1	280 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	EXOC1	Q9NV70	894 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	RLF	Q13129	1914 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	USP27X	A6NNY8	438 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	COBL	O75128	1261 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	SREBF1	P36956	1147 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	ARHGAP4	P98171	946 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	TRAF1	Q13077	416 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	MCM6	Q14566	821 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	QPCT	Q16769	361 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	SV2B	Q7L1I2	683 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	HLA-C	Q95604	372 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	MYH11	P35749	1972 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	MYMK	A6NI61	221 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	PIK3CD	O00329	1044 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TNS1-217	ENST00000490566	TEX33	O43247	280 aa		11.59	□□□□□ -0.55

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.6 ms