RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 FAAP100Q0VG06 881 aa24■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 TRIM22Q8IYM9 498 aa24■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 KIF2CQ99661 725 aa24■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 GDF15Q99988 308 aa24■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 BCAS3Q9H6U6 928 aa24■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 C6orf50Q9HD87 102 aa24■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 DCDC2CA8MYV0 355 aa23.99■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 FIBPO43427 364 aa23.99■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 GGPS1O95749 300 aa23.99■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 CLTBP09497 229 aa23.99■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 AP3B2Q13367 1082 aa23.99■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 ME3Q16798 604 aa23.99■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 ANO3Q9BYT9 981 aa23.99■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 C22orf23Q9BZE7 217 aa23.99■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 EHMT1Q9H9B1 1298 aa23.99■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 VPS54Q9P1Q0 977 aa23.99■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa23.99■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa23.99■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 SORBS3O60504 671 aa23.98■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 DEXIO95424 95 aa23.98■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 LARGE1O95461 756 aa23.98■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 ITGB5P18084 799 aa23.98■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa23.98■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 NLRX1Q86UT6 975 aa23.98■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 FAM126BQ8IXS8 530 aa23.98■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 PPTC7Q8NI37 304 aa23.98■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 GPRASP2Q96D09 838 aa23.98■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa23.98■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 SH3GLB2Q9NR46 395 aa23.98■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 MROH7Q68CQ1 1323 aa23.98■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 CTDNEP1O95476 244 aa23.97■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 GNA11P29992 359 aa23.97■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 RBM25P49756 843 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 CCDC148Q8NFR7 591 aa23.97■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 KIAA0355O15063 1070 aa23.96■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 CDKL5O76039 1030 aa23.96■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 CD4P01730 458 aa23.96■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 ITGB8P26012 769 aa23.96■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 NEDD9Q14511 834 aa23.96■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 DGKDQ16760 1214 aa23.96■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 NBPF20Q3BBV1 942 aa23.96■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 HSDL1Q3SXM5 330 aa23.96■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 NECAB1Q8N987 351 aa23.96■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 KAT2BQ92831 832 aa23.96■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 SPATA33Q96N06 139 aa23.96■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 AIFM3Q96NN9 605 aa23.96■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 SENP7Q9BQF6 1050 aa23.96■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 MLXIPQ9HAP2 919 aa23.96■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 JADE2Q9NQC1 790 aa23.96■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 TMEM39AQ9NV64 488 aa23.96■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.96■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 DTNBO60941 627 aa23.95■■□□□ 1.42
ACTB-211ENST00000480301 BMP8BP34820 402 aa23.95■■□□□ 1.42
ACTB-211ENST00000480301 SREBF1P36956 1147 aa23.95■■□□□ 1.42
ACTB-211ENST00000480301 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
ACTB-211ENST00000480301 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
ACTB-211ENST00000480301 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
ACTB-211ENST00000480301 MXRA8Q9BRK3 442 aa23.95■■□□□ 1.42
ACTB-211ENST00000480301 TBX21Q9UL17 535 aa23.95■■□□□ 1.42
ACTB-211ENST00000480301 DNAH12Q6ZR08 3092 aa23.95■■□□□ 1.42
ACTB-211ENST00000480301 ATP9AO75110 1047 aa23.94■■□□□ 1.42
ACTB-211ENST00000480301 PPFIA4O75335 1185 aa23.94■■□□□ 1.42
ACTB-211ENST00000480301 MCTP2Q6DN12 878 aa23.94■■□□□ 1.42
ACTB-211ENST00000480301 METTL7BQ6UX53 244 aa23.94■■□□□ 1.42
ACTB-211ENST00000480301 CYFIP1Q7L576 1253 aa23.94■■□□□ 1.42
ACTB-211ENST00000480301 CYP2W1Q8TAV3 490 aa23.94■■□□□ 1.42
ACTB-211ENST00000480301 RASGRP4Q8TDF6 673 aa23.94■■□□□ 1.42
ACTB-211ENST00000480301 CRYGNQ8WXF5 182 aa23.94■■□□□ 1.42
ACTB-211ENST00000480301 GTF3C6Q969F1 213 aa23.94■■□□□ 1.42
ACTB-211ENST00000480301 CDHR1Q96JP9 859 aa23.94■■□□□ 1.42
ACTB-211ENST00000480301 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa23.94■■□□□ 1.42
ACTB-211ENST00000480301 STK36Q9NRP7 1315 aa23.93■■□□□ 1.42
ACTB-211ENST00000480301 TLR3O15455 904 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
ACTB-211ENST00000480301 MAFGO15525 162 aa23.93■■□□□ 1.42
ACTB-211ENST00000480301 KCNA2P16389 499 aa23.93■■□□□ 1.42
ACTB-211ENST00000480301 NLRP5P59047 1200 aa23.93■■□□□ 1.42
ACTB-211ENST00000480301 BICD2Q8TD16 824 aa23.93■■□□□ 1.42
ACTB-211ENST00000480301 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa23.93■■□□□ 1.42
ACTB-211ENST00000480301 BADQ92934 168 aa23.93■■□□□ 1.42
ACTB-211ENST00000480301 TRPV6Q9H1D0 765 aa23.93■■□□□ 1.42
ACTB-211ENST00000480301 TELO2Q9Y4R8 837 aa23.93■■□□□ 1.42
ACTB-211ENST00000480301 MYH7BA7E2Y1 1941 aa23.92■■□□□ 1.42
ACTB-211ENST00000480301 CYP3A4P08684 503 aa23.92■■□□□ 1.42
ACTB-211ENST00000480301 ARHGAP4P98171 946 aa23.92■■□□□ 1.42
ACTB-211ENST00000480301 MTMR1Q13613 665 aa23.92■■□□□ 1.42
ACTB-211ENST00000480301 CEP55Q53EZ4 464 aa23.92■■□□□ 1.42
ACTB-211ENST00000480301 NFRKBQ6P4R8 1299 aa23.92■■□□□ 1.42
ACTB-211ENST00000480301 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
ACTB-211ENST00000480301 MEIS1O00470 390 aa23.91■■□□□ 1.42
ACTB-211ENST00000480301 B4GALT4O60513 344 aa23.91■■□□□ 1.42
ACTB-211ENST00000480301 ZNF286BP0CG31 522 aa23.91■■□□□ 1.42
ACTB-211ENST00000480301 FDPSP14324 419 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
ACTB-211ENST00000480301 ST3GAL1Q11201 340 aa23.91■■□□□ 1.42
ACTB-211ENST00000480301 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms