RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470271.5

CTPS1-206, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 801 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-206ENST00000470271 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
CTPS1-206ENST00000470271 FAM126BQ8IXS8 530 aa22.81■■□□□ 1.24
CTPS1-206ENST00000470271 TRIM22Q8IYM9 498 aa22.81■■□□□ 1.24
CTPS1-206ENST00000470271 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
CTPS1-206ENST00000470271 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
CTPS1-206ENST00000470271 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa22.8■■□□□ 1.24
CTPS1-206ENST00000470271 KIAA0355O15063 1070 aa22.8■■□□□ 1.24
CTPS1-206ENST00000470271 TLR3O15455 904 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
CTPS1-206ENST00000470271 FIBPO43427 364 aa22.8■■□□□ 1.24
CTPS1-206ENST00000470271 GGPS1O95749 300 aa22.8■■□□□ 1.24
CTPS1-206ENST00000470271 FOSP01100 380 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
CTPS1-206ENST00000470271 SP2Q02086 613 aa22.8■■□□□ 1.24
CTPS1-206ENST00000470271 MYSM1Q5VVJ2 828 aa22.8■■□□□ 1.24
CTPS1-206ENST00000470271 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
CTPS1-206ENST00000470271 NLRX1Q86UT6 975 aa22.8■■□□□ 1.24
CTPS1-206ENST00000470271 PPTC7Q8NI37 304 aa22.8■■□□□ 1.24
CTPS1-206ENST00000470271 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa22.8■■□□□ 1.24
CTPS1-206ENST00000470271 ESYT2A0FGR8 921 aa22.79■■□□□ 1.24
CTPS1-206ENST00000470271 AK2P54819 239 aa22.79■■□□□ 1.24
CTPS1-206ENST00000470271 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
CTPS1-206ENST00000470271 AP3B2Q13367 1082 aa22.79■■□□□ 1.24
CTPS1-206ENST00000470271 DGKDQ16760 1214 aa22.79■■□□□ 1.24
CTPS1-206ENST00000470271 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
CTPS1-206ENST00000470271 ZMYND12Q9H0C1 365 aa22.79■■□□□ 1.24
CTPS1-206ENST00000470271 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
CTPS1-206ENST00000470271 MLXIPQ9HAP2 919 aa22.79■■□□□ 1.24
CTPS1-206ENST00000470271 TPCN1Q9ULQ1 816 aa22.79■■□□□ 1.24
CTPS1-206ENST00000470271 LTBP2Q14767 1821 aa22.79■■□□□ 1.24
CTPS1-206ENST00000470271 A0A1W2PPC1 479 aa22.78■■□□□ 1.24
CTPS1-206ENST00000470271 SORBS3O60504 671 aa22.78■■□□□ 1.24
CTPS1-206ENST00000470271 RAG1P15918 1043 aa22.78■■□□□ 1.24
CTPS1-206ENST00000470271 CLK2P49760 499 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
CTPS1-206ENST00000470271 SEMA3FQ13275 785 aa22.78■■□□□ 1.24
CTPS1-206ENST00000470271 NEDD9Q14511 834 aa22.78■■□□□ 1.24
CTPS1-206ENST00000470271 SPATA33Q96N06 139 aa22.78■■□□□ 1.24
CTPS1-206ENST00000470271 ANO3Q9BYT9 981 aa22.78■■□□□ 1.24
CTPS1-206ENST00000470271 C6orf50Q9HD87 102 aa22.78■■□□□ 1.24
CTPS1-206ENST00000470271 TBX21Q9UL17 535 aa22.78■■□□□ 1.24
CTPS1-206ENST00000470271 LAMA3Q16787 3333 aa22.77■■□□□ 1.24
CTPS1-206ENST00000470271 CD4P01730 458 aa22.77■■□□□ 1.24
CTPS1-206ENST00000470271 GNA11P29992 359 aa22.77■■□□□ 1.24
CTPS1-206ENST00000470271 NEK4P51957 841 aa22.77■■□□□ 1.24
CTPS1-206ENST00000470271 SCRN1Q12765 414 aa22.77■■□□□ 1.24
CTPS1-206ENST00000470271 CCDC148Q8NFR7 591 aa22.77■■□□□ 1.24
CTPS1-206ENST00000470271 BADQ92934 168 aa22.77■■□□□ 1.24
CTPS1-206ENST00000470271 GPRASP2Q96D09 838 aa22.77■■□□□ 1.24
CTPS1-206ENST00000470271 CDHR1Q96JP9 859 aa22.77■■□□□ 1.24
CTPS1-206ENST00000470271 PGBD1Q96JS3 809 aa22.77■■□□□ 1.24
CTPS1-206ENST00000470271 TMEM260Q9NX78 707 aa22.77■■□□□ 1.24
CTPS1-206ENST00000470271 PFKFB2O60825 505 aa22.76■■□□□ 1.23
CTPS1-206ENST00000470271 PPFIA4O75335 1185 aa22.76■■□□□ 1.23
CTPS1-206ENST00000470271 ITGB5P18084 799 aa22.76■■□□□ 1.23
CTPS1-206ENST00000470271 ITGB8P26012 769 aa22.76■■□□□ 1.23
CTPS1-206ENST00000470271 NBPF20Q3BBV1 942 aa22.76■■□□□ 1.23
CTPS1-206ENST00000470271 HSDL1Q3SXM5 330 aa22.76■■□□□ 1.23
CTPS1-206ENST00000470271 NFRKBQ6P4R8 1299 aa22.76■■□□□ 1.23
CTPS1-206ENST00000470271 METTL7BQ6UX53 244 aa22.76■■□□□ 1.23
CTPS1-206ENST00000470271 SENP7Q9BQF6 1050 aa22.76■■□□□ 1.23
CTPS1-206ENST00000470271 VPS54Q9P1Q0 977 aa22.76■■□□□ 1.23
CTPS1-206ENST00000470271 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa22.76■■□□□ 1.23
CTPS1-206ENST00000470271 B4GALT4O60513 344 aa22.75■■□□□ 1.23
CTPS1-206ENST00000470271 CDKL5O76039 1030 aa22.75■■□□□ 1.23
CTPS1-206ENST00000470271 DEXIO95424 95 aa22.75■■□□□ 1.23
CTPS1-206ENST00000470271 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
CTPS1-206ENST00000470271 MTMR1Q13613 665 aa22.75■■□□□ 1.23
CTPS1-206ENST00000470271 FAM47CQ5HY64 1035 aa22.75■■□□□ 1.23
CTPS1-206ENST00000470271 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa22.75■■□□□ 1.23
CTPS1-206ENST00000470271 MCTP2Q6DN12 878 aa22.75■■□□□ 1.23
CTPS1-206ENST00000470271 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
CTPS1-206ENST00000470271 TRPV6Q9H1D0 765 aa22.75■■□□□ 1.23
CTPS1-206ENST00000470271 BCAS3Q9H6U6 928 aa22.75■■□□□ 1.23
CTPS1-206ENST00000470271 JADE2Q9NQC1 790 aa22.75■■□□□ 1.23
CTPS1-206ENST00000470271 SH3GLB2Q9NR46 395 aa22.75■■□□□ 1.23
CTPS1-206ENST00000470271 NOP56O00567 594 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
CTPS1-206ENST00000470271 TIMP1P01033 207 aa22.74■■□□□ 1.23
CTPS1-206ENST00000470271 SREBF1P36956 1147 aa22.74■■□□□ 1.23
CTPS1-206ENST00000470271 CHMP4BP1P59074 171 aa22.74■■□□□ 1.23
CTPS1-206ENST00000470271 CYFIP1Q7L576 1253 aa22.74■■□□□ 1.23
CTPS1-206ENST00000470271 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
CTPS1-206ENST00000470271 BICD2Q8TD16 824 aa22.74■■□□□ 1.23
CTPS1-206ENST00000470271 KAT2BQ92831 832 aa22.74■■□□□ 1.23
CTPS1-206ENST00000470271 MAFGO15525 162 aa22.73■■□□□ 1.23
CTPS1-206ENST00000470271 F2P00734 622 aa22.73■■□□□ 1.23
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF286BP0CG31 522 aa22.73■■□□□ 1.23
CTPS1-206ENST00000470271 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
CTPS1-206ENST00000470271 TDHQ8IZJ6 230 aa22.73■■□□□ 1.23
CTPS1-206ENST00000470271 MXRA8Q9BRK3 442 aa22.73■■□□□ 1.23
CTPS1-206ENST00000470271 KATNAL1Q9BW62 490 aa22.73■■□□□ 1.23
CTPS1-206ENST00000470271 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
CTPS1-206ENST00000470271 DOCK5Q9H7D0 1870 aa22.73■■□□□ 1.23
CTPS1-206ENST00000470271 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
CTPS1-206ENST00000470271 ADAMTS3O15072 1205 aa22.72■■□□□ 1.23
CTPS1-206ENST00000470271 ATP9AO75110 1047 aa22.72■■□□□ 1.23
CTPS1-206ENST00000470271 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa22.72■■□□□ 1.23
CTPS1-206ENST00000470271 KCNA2P16389 499 aa22.72■■□□□ 1.23
CTPS1-206ENST00000470271 NLRP5P59047 1200 aa22.72■■□□□ 1.23
CTPS1-206ENST00000470271 ARHGAP4P98171 946 aa22.72■■□□□ 1.23
CTPS1-206ENST00000470271 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa22.72■■□□□ 1.23
CTPS1-206ENST00000470271 C22orf23Q9BZE7 217 aa22.72■■□□□ 1.23
CTPS1-206ENST00000470271 PSEN2P49810 448 aa22.71■■□□□ 1.23
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