RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469521.5

TRAPPC10-208, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 5

Gene TRAPPC10, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-208ENST00000469521 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC10-208ENST00000469521 FIBPO43427 364 aa21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC10-208ENST00000469521 F2P00734 622 aa21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC10-208ENST00000469521 CSF2RAP15509 400 aa21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC10-208ENST00000469521 CDC27P30260 824 aa21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC10-208ENST00000469521 CYP2C18P33260 490 aa21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC10-208ENST00000469521 SP2Q02086 613 aa21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC10-208ENST00000469521 KAT2BQ92831 832 aa21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC10-208ENST00000469521 SPATA33Q96N06 139 aa21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC10-208ENST00000469521 USP26Q9BXU7 913 aa21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC10-208ENST00000469521 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC10-208ENST00000469521 UMODL1Q5DID0 1318 aa21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC10-208ENST00000469521 SPDYE3A6NKU9 549 aa21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC10-208ENST00000469521 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC10-208ENST00000469521 NAPAP54920 295 aa21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC10-208ENST00000469521 UBE2SQ16763 222 aa21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC10-208ENST00000469521 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC10-208ENST00000469521 WNT8AQ9H1J5 351 aa21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC10-208ENST00000469521 V9GY48 417 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC10-208ENST00000469521 STXBP3O00186 592 aa21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 PPFIA4O75335 1185 aa21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZNF286BP0CG31 522 aa21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 SEMA3FQ13275 785 aa21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 NEDD9Q14511 834 aa21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 HSDL1Q3SXM5 330 aa21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 TYW1BQ6NUM6 668 aa21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 RUFY3Q7L099 469 aa21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP21.64■■□□□ 1.054e-7■□□□□ 9
TRAPPC10-208ENST00000469521 EHMT1Q9H9B1 1298 aa21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 MLXIPQ9HAP2 919 aa21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 IL23AQ9NPF7 189 aa21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 RIC8AQ9NPQ8 531 aa21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 BARHL2Q9NY43 387 aa21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 CYP2C9P11712 490 aa21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 ADCY7P51828 1080 aa21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 EVCP57679 992 aa21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 METTL7BQ6UX53 244 aa21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 NLRX1Q86UT6 975 aa21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 DEFB123Q8N688 67 aa21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 TM6SF1Q9BZW5 370 aa21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 GLT8D2Q9H1C3 349 aa21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 RTEL1Q9NZ71 1219 aa21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 HAS3O00219 553 aa21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 PITPNM1O00562 1244 aa21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 ADD1P35611 737 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 PSEN2P49810 448 aa21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 MFSD10Q14728 455 aa21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 TMEM240Q5SV17 173 aa21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 C16orf59Q7L2K0 433 aa21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 GPRASP2Q96D09 838 aa21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 CDHR1Q96JP9 859 aa21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 SENP7Q9BQF6 1050 aa21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 PCDHA6Q9UN73 950 aa21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 NOD1Q9Y239 953 aa21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 NOP56O00567 594 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 SORBS3O60504 671 aa21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 CCL23P55773 120 aa21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 CHMP4BP1P59074 171 aa21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 PTGISQ16647 500 aa21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 KIAA0753Q2KHM9 967 aa21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 RASIP1Q5U651 963 aa21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 C7orf31Q8N865 590 aa21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 SCN5AQ14524 2016 aa21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 FOSP01100 380 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 PFKMP08237 780 aa21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 SCG2P13521 617 aa21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 AP3B2Q13367 1082 aa21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 BFSP2Q13515 415 aa21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 CCDC155Q8N6L0 562 aa21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 C16orf70Q9BSU1 422 aa21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 ACRP10323 421 aa21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 ITGB5P18084 799 aa21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 RFC2P35250 354 aa21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 MTMR1Q13613 665 aa21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZNF365Q70YC5 407 aa21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 Q7L0L9 218 aa21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 CYFIP1Q7L576 1253 aa21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 CAGE1Q8TC20 777 aa21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 HERVK_113Q902F9 699 aa21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 CTAGE1Q96RT6 745 aa21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 GPR20Q99678 358 aa21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 HDAC6Q9UBN7 1215 aa21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 ESYT2A0FGR8 921 aa21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.7 ms