RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-201ENST00000441222 FMO2Q99518 471 aa7.21□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa7.21□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 MAGEB5Q9BZ81 275 aa7.21□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 SUGCTQ9HAC7 445 aa7.21□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 KIF9Q9HAQ2 790 aa7.21□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 BTG4Q9NY30 223 aa7.21□□□□□ -1.25
USP46-201ENST00000441222 SYCE1LA8MT33 242 aa7.21□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 H3BRJ5 948 aa7.21□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 BUB1O43683 1085 aa7.21□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 PPP6R2O75170 966 aa7.21□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 KRT8P05787 483 aa7.21□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 OCRLQ01968 901 aa7.21□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 IFT88Q13099 833 aa7.21□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 CUL1Q13616 776 aa7.21□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 TMC4Q7Z404 712 aa7.21□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 TRIM59Q8IWR1 403 aa7.21□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa7.21□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 AMNQ9BXJ7 453 aa7.21□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa7.21□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 SEMA3EO15041 775 aa7.21□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 C1orf228Q6PIY5 440 aa7.21□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 MORC4Q8TE76 937 aa7.21□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 CCDC127Q96BQ5 260 aa7.21□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 LRFN2Q9ULH4 789 aa7.21□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 KRT4P19013 534 aa7.21□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 COPB1P53618 953 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 NR1H3Q13133 447 aa7.21□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 TBCCQ15814 346 aa7.21□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 MAN2A1Q16706 1144 aa7.21□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 CENPUQ71F23 418 aa7.21□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 PTPN22Q9Y2R2 807 aa7.21□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 OSBPP22059 807 aa7.21□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 ANXA13P27216 316 aa7.21□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 USP14P54578 494 aa7.21□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 EHHADHQ08426 723 aa7.21□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 GOLGA8FQ08AF8 430 aa7.21□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa7.21□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 PTGDRQ13258 359 aa7.21□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 DNAJC24Q6P3W2 148 aa7.21□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 GADL1Q6ZQY3 521 aa7.21□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 ARHGEF25Q86VW2 580 aa7.21□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa7.21□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 AKT3Q9Y243 479 aa7.21□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 MYH10P35580 1976 aa7.21□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa7.2□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 POTEB3A0JP26 581 aa7.2□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 MCF2P10911 925 aa7.2□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 KCNA4P22459 653 aa7.2□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 POTEBQ6S5H4 581 aa7.2□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 PDIK1LQ8N165 341 aa7.2□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 CCNYQ8ND76 341 aa7.2□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa7.2□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 ZNF653Q96CK0 615 aa7.2□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa7.2□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 BCL2L12Q9HB09 334 aa7.2□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 LMBRD1Q9NUN5 540 aa7.2□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 USP17L12C9JPN9 530 aa7.2□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 USP17L21D6R901 530 aa7.2□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 GOLGA8MH3BSY2 632 aa7.2□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 PRPSAP2O60256 369 aa7.2□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 PRDM1O75626 825 aa7.2□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 PEX19P40855 299 aa7.2□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 EPHB1P54762 984 aa7.2□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 MCUQ8NE86 351 aa7.2□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 PAGR1Q9BTK6 254 aa7.2□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 CFAP74Q9C0B2 1584 aa7.2□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 LMTK3Q96Q04 1460 aa7.2□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 TJP3O95049 919 aa7.2□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 DRP2Q13474 957 aa7.2□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 GCC2Q8IWJ2 1684 aa7.2□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 A0A1B0GW55 424 aa7.2□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 CCDC151A5D8V7 595 aa7.2□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 RASGRF2O14827 1237 aa7.2□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 PFKFB2O60825 505 aa7.2□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 DUX4L2P0CJ85 424 aa7.2□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 DUX4L3P0CJ86 424 aa7.2□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 DUX4L4P0CJ87 422 aa7.2□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 DUX4L5P0CJ88 424 aa7.2□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 DUX4L6P0CJ89 424 aa7.2□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 DUX4L7P0CJ90 424 aa7.2□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 CA4P22748 312 aa7.2□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 LIG3P49916 1009 aa7.2□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 CAV1Q03135 178 aa7.2□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 MED21Q13503 144 aa7.2□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa7.2□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 TRIM67Q6ZTA4 783 aa7.2□□□□□ -1.26
USP46-201ENST00000441222 DPP9Q86TI2 863 aa7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms