RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439487.5

SEMA3B-206, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 3

Gene SEMA3B, Length 594 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-206ENST00000439487 GH1P01241 217 aa22.24■■□□□ 1.15
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SEMA3B-206ENST00000439487 ICAM3P32942 547 aa22.24■■□□□ 1.15
SEMA3B-206ENST00000439487 MCM2P49736 904 aa22.24■■□□□ 1.15
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SEMA3B-206ENST00000439487 OXER1Q8TDS5 423 aa22.2■■□□□ 1.14
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SEMA3B-206ENST00000439487 SPATA33Q96N06 139 aa22.18■■□□□ 1.14
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SEMA3B-206ENST00000439487 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SEMA3B-206ENST00000439487 WDR81Q562E7 1941 aa22.18■■□□□ 1.14
SEMA3B-206ENST00000439487 ELP1O95163 1332 aa22.17■■□□□ 1.14
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SEMA3B-206ENST00000439487 KRT25Q7Z3Z0 450 aa22.17■■□□□ 1.14
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SEMA3B-206ENST00000439487 C8orf76Q96K31 380 aa22.17■■□□□ 1.14
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SEMA3B-206ENST00000439487 MMP1P03956 469 aa22.16■■□□□ 1.14
SEMA3B-206ENST00000439487 PSMC6P62333 389 aa22.16■■□□□ 1.14
SEMA3B-206ENST00000439487 NR5A1Q13285 461 aa22.16■■□□□ 1.14
SEMA3B-206ENST00000439487 SNX17Q15036 470 aa22.16■■□□□ 1.14
SEMA3B-206ENST00000439487 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
SEMA3B-206ENST00000439487 TRIM60Q495X7 471 aa22.16■■□□□ 1.14
SEMA3B-206ENST00000439487 METTL7BQ6UX53 244 aa22.16■■□□□ 1.14
SEMA3B-206ENST00000439487 NIPA1Q7RTP0 329 aa22.16■■□□□ 1.14
SEMA3B-206ENST00000439487 C7orf61Q8IZ16 206 aa22.16■■□□□ 1.14
SEMA3B-206ENST00000439487 BRMS1Q9HCU9 246 aa22.16■■□□□ 1.14
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