RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 SALL4Q9UJQ4 1053 aa20.26■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 IRS2Q9Y4H2 1338 aa20.26■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 LRRC53A6NM62 1247 aa20.26■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 MYO1FO00160 1098 aa20.26■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 AKR1B10O60218 316 aa20.26■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 PAFAH1B1P43034 410 aa20.26■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 CNNM4Q6P4Q7 775 aa20.26■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 KDM7AQ6ZMT4 941 aa20.26■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 LCA5LO95447 670 aa20.25■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 KRT14P02533 472 aa20.25■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 DDR1Q08345 913 aa20.25■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 CENPPQ6IPU0 288 aa20.25■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 RRAGAQ7L523 313 aa20.25■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 CABS1Q96KC9 395 aa20.25■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 ZMYND12Q9H0C1 365 aa20.25■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 ZEB2O60315 1214 aa20.24■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP20.24■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 IQCKQ8N0W5 287 aa20.24■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 ANKS1AQ92625 1134 aa20.24■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM47Q9BQJ4 181 aa20.24■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 EPN3Q9H201 632 aa20.24■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 KLRF2D3W0D1 207 aa20.24■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 LSP1P33241 339 aa20.24■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 MAP2K2P36507 400 aa20.24■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 PAGR1Q9BTK6 254 aa20.24■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 CXorf56Q9H5V9 222 aa20.24■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF233A6NK53 670 aa20.23■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 AMPD3Q01432 767 aa20.23■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 CFAP58Q5T655 872 aa20.23■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 DYMQ7RTS9 669 aa20.23■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 IFT20Q8IY31 132 aa20.23■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 IQCDQ96DY2 449 aa20.23■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 SMCO2A6NFE2 343 aa20.23■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 H0YHG0 523 aa20.23■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 APBA1Q02410 837 aa20.23■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 EMC10Q5UCC4 262 aa20.23■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 NAA35Q5VZE5 725 aa20.23■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 NEK8Q86SG6 692 aa20.23■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC155Q8N6L0 562 aa20.23■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 TLR10Q9BXR5 811 aa20.23■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 GDF3Q9NR23 364 aa20.23■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa20.23■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 MYMKA6NI61 221 aa20.22■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 BUB1O43683 1085 aa20.22■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 GLI1P08151 1106 aa20.22■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM153BP0C7A2 387 aa20.22■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 PPP1R2P41236 205 aa20.22■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 TXKP42681 527 aa20.22■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 CARSP49589 748 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 SETQ01105 290 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 GUCY1A3Q02108 690 aa20.22■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM153CQ494X1 144 aa20.22■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 MICALCLQ6ZW33 695 aa20.22■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 KRT25Q7Z3Z0 450 aa20.22■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 TBCKQ8TEA7 893 aa20.22■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 MTMR8Q96EF0 704 aa20.22■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM153AQ9UHL3 310 aa20.22■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 MAGEA1P43355 309 aa20.22■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 RASSF7Q02833 373 aa20.22■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 PIK3R5Q8WYR1 880 aa20.22■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 CALML4Q96GE6 196 aa20.22■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 MS4A14Q96JA4 679 aa20.22■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 POLD4Q9HCU8 107 aa20.22■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa20.22■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 NFU1Q9UMS0 254 aa20.22■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 PJA2O43164 708 aa20.21■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 GRB10Q13322 594 aa20.21■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 DIXDC1Q155Q3 683 aa20.21■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 MAN2A1Q16706 1144 aa20.21■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 SV2BQ7L1I2 683 aa20.21■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 BAP1Q92560 729 aa20.21■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC1A4P43007 532 aa20.21■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 PTGISQ16647 500 aa20.21■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 COBLL1Q53SF7 1204 aa20.21■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa20.21■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 CD302Q8IX05 232 aa20.21■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 GLIS3Q8NEA6 775 aa20.21■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 VAT1LQ9HCJ6 419 aa20.21■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
RALGPS1-208ENST00000424082 CLSTN1O94985 981 aa20.2■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 GPSM2P81274 684 aa20.2■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 CRY2Q49AN0 593 aa20.2■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 CFAP221Q4G0U5 840 aa20.2■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 USP17L2Q6R6M4 530 aa20.2■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 TMC4Q7Z404 712 aa20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms