RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418548.3

SFTA3-201, Transcript of surfactant associated 3, humanhuman

TSL 3

Gene SFTA3, Length 870 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3-201ENST00000418548 PDE4DQ08499 809 aa16.27■□□□□ 0.2
SFTA3-201ENST00000418548 CALCRLQ16602 461 aa16.27■□□□□ 0.2
SFTA3-201ENST00000418548 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
SFTA3-201ENST00000418548 ETNPPLQ8TBG4 499 aa16.27■□□□□ 0.2
SFTA3-201ENST00000418548 FERMT2Q96AC1 680 aa16.27■□□□□ 0.2
SFTA3-201ENST00000418548 GPRASP2Q96D09 838 aa16.27■□□□□ 0.2
SFTA3-201ENST00000418548 MAML3Q96JK9 1138 aa16.27■□□□□ 0.2
SFTA3-201ENST00000418548 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
SFTA3-201ENST00000418548 PCDHA7Q9UN72 937 aa16.27■□□□□ 0.2
SFTA3-201ENST00000418548 MRVI1Q9Y6F6 885 aa16.27■□□□□ 0.2
SFTA3-201ENST00000418548 MSH4O15457 936 aa16.26■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 FKTNO75072 461 aa16.26■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 GNRH1P01148 92 aa16.26■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 ARP10275 920 aa16.26■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 ICAM3P32942 547 aa16.26■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 IL17AQ16552 155 aa16.26■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 ADALQ6DHV7 355 aa16.26■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 NLRX1Q86UT6 975 aa16.26■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 WDR11Q9BZH6 1224 aa16.26■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 KCNH7Q9NS40 1196 aa16.26■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 LMBRD1Q9NUN5 540 aa16.26■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa16.26■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa16.25■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa16.25■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 CUTAO60888 179 aa16.25■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 ME1P48163 572 aa16.25■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 MTMR1Q13613 665 aa16.25■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 GNPTABQ3T906 1256 aa16.25■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 OLFML2BQ68BL8 750 aa16.25■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 DTHD1Q6ZMT9 781 aa16.25■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 ARMCX2Q7L311 632 aa16.25■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 SLFN12Q8IYM2 578 aa16.25■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 SLC5A5Q92911 643 aa16.25■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 ERO1AQ96HE7 468 aa16.25■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 CDHR1Q96JP9 859 aa16.25■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 APBA2Q99767 749 aa16.25■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 TINF2Q9BSI4 451 aa16.25■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 LRRC37A2A6NM11 1700 aa16.25■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 PCNTO95613 3336 aa16.24■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa16.24■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 A0A1W2PQ27 194 aa16.24■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 A0A1W2PQ64 194 aa16.24■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 A0A1W2PQD8 194 aa16.24■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 TGFB3P10600 412 aa16.24■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 CYP2B6P20813 491 aa16.24■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 HOXD10P28358 340 aa16.24■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 SEMA3FQ13275 785 aa16.24■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 IRF5Q13568 498 aa16.24■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 PDIA5Q14554 519 aa16.24■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 ARHGEF6Q15052 776 aa16.24■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 CD99L2Q8TCZ2 262 aa16.24■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 RIT2Q99578 217 aa16.24■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 GABRQQ9UN88 632 aa16.24■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 DDX11L8A8MPP1 907 aa16.23■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 DHX15O43143 795 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 PSMD10O75832 226 aa16.23■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 LONP1P36776 959 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 TXKP42681 527 aa16.23■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 FLT3LGP49771 235 aa16.23■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 GRIN1Q05586 938 aa16.23■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 KCNV1Q6PIU1 500 aa16.23■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 IGSF22Q8N9C0 903 aa16.23■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 CLIC6Q96NY7 704 aa16.23■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 SENP7Q9BQF6 1050 aa16.23■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 ZNF577Q9BSK1 485 aa16.23■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 KATNBL1Q9H079 304 aa16.23■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 VTA1Q9NP79 307 aa16.23■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 SRRDQ9UH36 339 aa16.23■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 PCDHA12Q9UN75 941 aa16.23■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 VWA3AA6NCI4 1184 aa16.22■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 MARCH6O60337 910 aa16.22■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 ATP9AO75110 1047 aa16.22■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 CMA1P23946 247 aa16.22■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 UBE2HP62256 183 aa16.22■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 PRKCZQ05513 592 aa16.22■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 NFKBIBQ15653 356 aa16.22■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 B3GNT9Q6UX72 402 aa16.22■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 SEPT14Q6ZU15 432 aa16.22■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 AK8Q96MA6 479 aa16.22■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 CSRNP2Q9H175 543 aa16.22■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa16.22■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 TBC1D22BQ9NU19 505 aa16.22■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 FLRT1Q9NZU1 646 aa16.22■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa16.21■□□□□ 0.19
SFTA3-201ENST00000418548 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.4 ms