RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394202.8

CNN3-202, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CNN3, Length 1,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-202ENST00000394202 IWS1Q96ST2 819 aa26.27■■□□□ 1.8
CNN3-202ENST00000394202 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
CNN3-202ENST00000394202 MTMR1Q13613 665 aa26.26■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 LONRF3Q496Y0 759 aa26.26■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 XRRA1Q6P2D8 792 aa26.26■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 NIPA1Q7RTP0 329 aa26.26■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 SLC5A5Q92911 643 aa26.26■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 ZNF577Q9BSK1 485 aa26.26■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 LRWD1Q9UFC0 647 aa26.26■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 EDNRBP24530 442 aa26.26■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 MAPK4P31152 587 aa26.26■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 SETQ01105 290 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 SEMA3FQ13275 785 aa26.26■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 PDIA5Q14554 519 aa26.26■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 TMEM266Q2M3C6 531 aa26.26■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 PLEKHH3Q7Z736 793 aa26.26■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 NUDT12Q9BQG2 462 aa26.26■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 VAV3Q9UKW4 847 aa26.26■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa26.26■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 STRNO43815 780 aa26.25■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 ATP9AO75110 1047 aa26.25■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 PSMD10O75832 226 aa26.25■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 KARSQ15046 597 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 AK8Q96MA6 479 aa26.25■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 GRB14Q14449 540 aa26.24■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 ZNF792Q3KQV3 632 aa26.24■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa26.24■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 CCDC183Q5T5S1 534 aa26.24■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 ABRAQ8N0Z2 381 aa26.24■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 CLSTN2Q9H4D0 955 aa26.24■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 CEP350Q5VT06 3117 aa26.24■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 KINO60870 393 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 UBA7P41226 1012 aa26.24■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 STXBP2Q15833 593 aa26.24■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 LRRC15Q8TF66 581 aa26.24■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 PLIN2Q99541 437 aa26.24■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 PLXNB2O15031 1838 aa26.23■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 DHX15O43143 795 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 CTGFP29279 349 aa26.23■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 LRCH2Q5VUJ6 765 aa26.23■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 OTOP1Q7RTM1 612 aa26.23■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 NUP62CLQ9H1M0 184 aa26.23■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 ALDH1A1P00352 501 aa26.22■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 EEPD1Q7L9B9 569 aa26.22■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 CABP7Q86V35 215 aa26.22■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 DHX58Q96C10 678 aa26.22■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 CCSER1Q9C0I3 900 aa26.22■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 BCAS3Q9H6U6 928 aa26.22■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 SERTAD1Q9UHV2 236 aa26.22■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 DOCK3Q8IZD9 2030 aa26.22■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 EML1O00423 815 aa26.22■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 TBC1D8O95759 1140 aa26.22■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 PDE4DQ08499 809 aa26.22■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 E2F4Q16254 413 aa26.22■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 GAS7O60861 476 aa26.21■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 ECM1Q16610 540 aa26.21■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 GPRASP2Q96D09 838 aa26.21■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 RAB34Q9BZG1 259 aa26.21■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 NCAPH2Q6IBW4 605 aa26.2■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 KRBA2Q6ZNG9 492 aa26.2■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 SEPT14Q6ZU15 432 aa26.2■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.79
CNN3-202ENST00000394202 SYCE3A1L190 88 aa26.2■■□□□ 1.78
CNN3-202ENST00000394202 FOXN1O15353 648 aa26.2■■□□□ 1.78
CNN3-202ENST00000394202 CHMP2AO43633 222 aa26.2■■□□□ 1.78
CNN3-202ENST00000394202 MORN1Q5T089 497 aa26.2■■□□□ 1.78
CNN3-202ENST00000394202 B3GNT9Q6UX72 402 aa26.2■■□□□ 1.78
CNN3-202ENST00000394202 DPP9Q86TI2 863 aa26.2■■□□□ 1.78
CNN3-202ENST00000394202 NLRX1Q86UT6 975 aa26.2■■□□□ 1.78
CNN3-202ENST00000394202 CKAP2LQ8IYA6 745 aa26.2■■□□□ 1.78
CNN3-202ENST00000394202 TNMDQ9H2S6 317 aa26.2■■□□□ 1.78
CNN3-202ENST00000394202 UNC45AQ9H3U1 944 aa26.2■■□□□ 1.78
CNN3-202ENST00000394202 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa26.19■■□□□ 1.78
CNN3-202ENST00000394202 STAM2O75886 525 aa26.19■■□□□ 1.78
CNN3-202ENST00000394202 MAP2K2P36507 400 aa26.19■■□□□ 1.78
CNN3-202ENST00000394202 SP2Q02086 613 aa26.19■■□□□ 1.78
CNN3-202ENST00000394202 NAALADL2Q58DX5 795 aa26.19■■□□□ 1.78
CNN3-202ENST00000394202 SNX29Q8TEQ0 813 aa26.19■■□□□ 1.78
CNN3-202ENST00000394202 RIT2Q99578 217 aa26.19■■□□□ 1.78
CNN3-202ENST00000394202 SDF4Q9BRK5 362 aa26.19■■□□□ 1.78
CNN3-202ENST00000394202 DISC1Q9NRI5 854 aa26.19■■□□□ 1.78
CNN3-202ENST00000394202 SLC15A5A6NIM6 579 aa26.18■■□□□ 1.78
CNN3-202ENST00000394202 TRPA1O75762 1119 aa26.18■■□□□ 1.78
CNN3-202ENST00000394202 TXLNAP40222 546 aa26.18■■□□□ 1.78
CNN3-202ENST00000394202 GRB10Q13322 594 aa26.18■■□□□ 1.78
CNN3-202ENST00000394202 PPP2R5CQ13362 524 aa26.18■■□□□ 1.78
CNN3-202ENST00000394202 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
CNN3-202ENST00000394202 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms