RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393537.4

ANKRD39-201, Transcript of ankyrin repeat domain 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD39, Length 976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39-201ENST00000393537 SPATA33Q96N06 139 aa23.25■■□□□ 1.31
ANKRD39-201ENST00000393537 AGXT2Q9BYV1 514 aa23.25■■□□□ 1.31
ANKRD39-201ENST00000393537 SPDYE3A6NKU9 549 aa23.24■■□□□ 1.31
ANKRD39-201ENST00000393537 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa23.24■■□□□ 1.31
ANKRD39-201ENST00000393537 CYP2C9P11712 490 aa23.24■■□□□ 1.31
ANKRD39-201ENST00000393537 ICAM3P32942 547 aa23.24■■□□□ 1.31
ANKRD39-201ENST00000393537 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
ANKRD39-201ENST00000393537 RUFY3Q7L099 469 aa23.24■■□□□ 1.31
ANKRD39-201ENST00000393537 KAT2BQ92831 832 aa23.24■■□□□ 1.31
ANKRD39-201ENST00000393537 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
ANKRD39-201ENST00000393537 MLXIPQ9HAP2 919 aa23.24■■□□□ 1.31
ANKRD39-201ENST00000393537 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa23.24■■□□□ 1.31
ANKRD39-201ENST00000393537 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa23.23■■□□□ 1.31
ANKRD39-201ENST00000393537 STXBP3O00186 592 aa23.23■■□□□ 1.31
ANKRD39-201ENST00000393537 FIBPO43427 364 aa23.23■■□□□ 1.31
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF286BP0CG31 522 aa23.23■■□□□ 1.31
ANKRD39-201ENST00000393537 SEMA3FQ13275 785 aa23.23■■□□□ 1.31
ANKRD39-201ENST00000393537 HSDL1Q3SXM5 330 aa23.23■■□□□ 1.31
ANKRD39-201ENST00000393537 GPR153Q6NV75 609 aa23.23■■□□□ 1.31
ANKRD39-201ENST00000393537 PPP1R18Q6NYC8 613 aa23.23■■□□□ 1.31
ANKRD39-201ENST00000393537 BCAS3Q9H6U6 928 aa23.23■■□□□ 1.31
ANKRD39-201ENST00000393537 NID2Q14112 1375 aa23.23■■□□□ 1.31
ANKRD39-201ENST00000393537 hCG_1984214I3L0E3 225 aa23.22■■□□□ 1.31
ANKRD39-201ENST00000393537 CCL23P55773 120 aa23.22■■□□□ 1.31
ANKRD39-201ENST00000393537 NLRX1Q86UT6 975 aa23.22■■□□□ 1.31
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
ANKRD39-201ENST00000393537 RIC8AQ9NPQ8 531 aa23.22■■□□□ 1.31
ANKRD39-201ENST00000393537 PCDHA6Q9UN73 950 aa23.22■■□□□ 1.31
ANKRD39-201ENST00000393537 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa23.22■■□□□ 1.31
ANKRD39-201ENST00000393537 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa23.22■■□□□ 1.31
ANKRD39-201ENST00000393537 PPFIA4O75335 1185 aa23.21■■□□□ 1.31
ANKRD39-201ENST00000393537 ACRP10323 421 aa23.21■■□□□ 1.31
ANKRD39-201ENST00000393537 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
ANKRD39-201ENST00000393537 PSEN2P49810 448 aa23.21■■□□□ 1.31
ANKRD39-201ENST00000393537 ADCY7P51828 1080 aa23.21■■□□□ 1.31
ANKRD39-201ENST00000393537 NEDD9Q14511 834 aa23.21■■□□□ 1.31
ANKRD39-201ENST00000393537 C16orf59Q7L2K0 433 aa23.21■■□□□ 1.31
ANKRD39-201ENST00000393537 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP23.21■■□□□ 1.31
ANKRD39-201ENST00000393537 ALG1Q9BT22 464 aa23.21■■□□□ 1.31
ANKRD39-201ENST00000393537 KATNAL1Q9BW62 490 aa23.21■■□□□ 1.31
ANKRD39-201ENST00000393537 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
ANKRD39-201ENST00000393537 TM6SF1Q9BZW5 370 aa23.21■■□□□ 1.31
ANKRD39-201ENST00000393537 WNT8AQ9H1J5 351 aa23.21■■□□□ 1.31
ANKRD39-201ENST00000393537 BARHL2Q9NY43 387 aa23.21■■□□□ 1.31
ANKRD39-201ENST00000393537 SMCO2A6NFE2 343 aa23.2■■□□□ 1.3
ANKRD39-201ENST00000393537 F2P00734 622 aa23.2■■□□□ 1.3
ANKRD39-201ENST00000393537 EVCP57679 992 aa23.2■■□□□ 1.3
ANKRD39-201ENST00000393537 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
ANKRD39-201ENST00000393537 MFSD10Q14728 455 aa23.2■■□□□ 1.3
ANKRD39-201ENST00000393537 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
ANKRD39-201ENST00000393537 Q7L0L9 218 aa23.2■■□□□ 1.3
ANKRD39-201ENST00000393537 EHMT1Q9H9B1 1298 aa23.2■■□□□ 1.3
ANKRD39-201ENST00000393537 IL23AQ9NPF7 189 aa23.2■■□□□ 1.3
ANKRD39-201ENST00000393537 NOD1Q9Y239 953 aa23.2■■□□□ 1.3
ANKRD39-201ENST00000393537 NOP56O00567 594 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
ANKRD39-201ENST00000393537 SCG2P13521 617 aa23.19■■□□□ 1.3
ANKRD39-201ENST00000393537 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
ANKRD39-201ENST00000393537 PTGISQ16647 500 aa23.19■■□□□ 1.3
ANKRD39-201ENST00000393537 KIAA0753Q2KHM9 967 aa23.19■■□□□ 1.3
ANKRD39-201ENST00000393537 TMEM240Q5SV17 173 aa23.19■■□□□ 1.3
ANKRD39-201ENST00000393537 CYFIP1Q7L576 1253 aa23.19■■□□□ 1.3
ANKRD39-201ENST00000393537 SESTD1Q86VW0 696 aa23.19■■□□□ 1.3
ANKRD39-201ENST00000393537 HDAC6Q9UBN7 1215 aa23.19■■□□□ 1.3
ANKRD39-201ENST00000393537 HAS3O00219 553 aa23.18■■□□□ 1.3
ANKRD39-201ENST00000393537 ITGB5P18084 799 aa23.18■■□□□ 1.3
ANKRD39-201ENST00000393537 CCT2P78371 535 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
ANKRD39-201ENST00000393537 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
ANKRD39-201ENST00000393537 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
ANKRD39-201ENST00000393537 METTL7BQ6UX53 244 aa23.18■■□□□ 1.3
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF365Q70YC5 407 aa23.18■■□□□ 1.3
ANKRD39-201ENST00000393537 TEX2Q8IWB9 1127 aa23.18■■□□□ 1.3
ANKRD39-201ENST00000393537 DEFB123Q8N688 67 aa23.18■■□□□ 1.3
ANKRD39-201ENST00000393537 C7orf31Q8N865 590 aa23.18■■□□□ 1.3
ANKRD39-201ENST00000393537 PHKBQ93100 1093 aa23.18■■□□□ 1.3
ANKRD39-201ENST00000393537 GPRASP2Q96D09 838 aa23.18■■□□□ 1.3
ANKRD39-201ENST00000393537 SCLYQ96I15 445 aa23.18■■□□□ 1.3
ANKRD39-201ENST00000393537 PGBD1Q96JS3 809 aa23.18■■□□□ 1.3
ANKRD39-201ENST00000393537 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
ANKRD39-201ENST00000393537 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa23.18■■□□□ 1.3
ANKRD39-201ENST00000393537 SCN5AQ14524 2016 aa23.17■■□□□ 1.3
ANKRD39-201ENST00000393537 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
ANKRD39-201ENST00000393537 PPFIA3O75145 1194 aa23.17■■□□□ 1.3
ANKRD39-201ENST00000393537 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
ANKRD39-201ENST00000393537 NTRK3Q16288 839 aa23.17■■□□□ 1.3
ANKRD39-201ENST00000393537 SENP7Q9BQF6 1050 aa23.17■■□□□ 1.3
ANKRD39-201ENST00000393537 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
ANKRD39-201ENST00000393537 C16orf70Q9BSU1 422 aa23.17■■□□□ 1.3
ANKRD39-201ENST00000393537 ANO3Q9BYT9 981 aa23.17■■□□□ 1.3
ANKRD39-201ENST00000393537 GLT8D2Q9H1C3 349 aa23.17■■□□□ 1.3
ANKRD39-201ENST00000393537 TMEM260Q9NX78 707 aa23.17■■□□□ 1.3
ANKRD39-201ENST00000393537 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa23.17■■□□□ 1.3
ANKRD39-201ENST00000393537 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
ANKRD39-201ENST00000393537 LAMA3Q16787 3333 aa23.16■■□□□ 1.3
ANKRD39-201ENST00000393537 TANC1Q9C0D5 1861 aa23.16■■□□□ 1.3
ANKRD39-201ENST00000393537 FOSP01100 380 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
ANKRD39-201ENST00000393537 LGALS2P05162 132 aa23.16■■□□□ 1.3
ANKRD39-201ENST00000393537 SP4Q02446 784 aa23.16■■□□□ 1.3
ANKRD39-201ENST00000393537 PKN1Q16512 942 aa23.16■■□□□ 1.3
ANKRD39-201ENST00000393537 CDHR1Q96JP9 859 aa23.16■■□□□ 1.3
ANKRD39-201ENST00000393537 CTAGE1Q96RT6 745 aa23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.7 ms