RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392011.6

SH3BP4-202, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,194 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-202ENST00000392011 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
SH3BP4-202ENST00000392011 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
SH3BP4-202ENST00000392011 THAP9Q9H5L6 903 aa18.77■□□□□ 0.6
SH3BP4-202ENST00000392011 CD209Q9NNX6 404 aa18.77■□□□□ 0.6
SH3BP4-202ENST00000392011 PTPN22Q9Y2R2 807 aa18.77■□□□□ 0.6
SH3BP4-202ENST00000392011 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa18.77■□□□□ 0.6
SH3BP4-202ENST00000392011 CDHR2Q9BYE9 1310 aa18.77■□□□□ 0.6
SH3BP4-202ENST00000392011 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa18.77■□□□□ 0.6
SH3BP4-202ENST00000392011 THAP12O43422 761 aa18.77■□□□□ 0.6
SH3BP4-202ENST00000392011 MOCS3O95396 460 aa18.77■□□□□ 0.6
SH3BP4-202ENST00000392011 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
SH3BP4-202ENST00000392011 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa18.77■□□□□ 0.6
SH3BP4-202ENST00000392011 SEPT14Q6ZU15 432 aa18.77■□□□□ 0.6
SH3BP4-202ENST00000392011 TBC1D31Q96DN5 1066 aa18.77■□□□□ 0.6
SH3BP4-202ENST00000392011 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
SH3BP4-202ENST00000392011 EPB41L5Q9HCM4 733 aa18.77■□□□□ 0.6
SH3BP4-202ENST00000392011 MED4Q9NPJ6 270 aa18.77■□□□□ 0.6
SH3BP4-202ENST00000392011 GCNT4Q9P109 453 aa18.77■□□□□ 0.6
SH3BP4-202ENST00000392011 CHD1O14646 1710 aa18.77■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 KCTD2Q14681 263 aa18.77■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 CAPS2Q9BXY5 557 aa18.77■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 PARVGQ9HBI0 331 aa18.77■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 SFI1A8K8P3 1242 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 RNF40O75150 1001 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 RNF8O76064 485 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 NPR1P16066 1061 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 STOX1Q6ZVD7 989 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 SESTD1Q86VW0 696 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 ACCSQ96QU6 501 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 I3L4J1 428 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 BFSP1Q12934 665 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 GRK7Q8WTQ7 553 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 POTEMA6NI47 508 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 GOLGA8KD6RF30 607 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF653Q96CK0 615 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 KCNQ2O43526 872 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 CRCPO75575 148 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 NAA25Q14CX7 972 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 EEPD1Q7L9B9 569 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 CCT6BQ92526 530 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 P3H4Q92791 437 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 CAPN9O14815 690 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 BPIFB4P59827 614 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 ATG9AQ7Z3C6 839 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 CCDC62Q6P9F0 684 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 SPATA24Q86W54 205 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 HACE1Q8IYU2 909 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 FAM71BQ8TC56 605 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 PANX2Q96RD6 677 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 TRIM49BA6NDI0 452 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 FAM160B1Q5W0V3 765 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 USP17L15C9J2P7 530 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 USP17L13C9JLJ4 530 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 USP17L11C9JVI0 530 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 USP17L18D6R9N7 530 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 USP17L22D6RA61 530 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 USP17L17D6RBQ6 530 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 USP17L19D6RCP7 530 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 USP17L20D6RJB6 530 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 USP17L24Q0WX57 530 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 USP17L6PQ6QN14 398 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 CCDC13Q8IYE1 715 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 CCDC170Q8IYT3 715 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 MB21D1Q8N884 522 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 ATF2P15336 505 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 PSMD2Q13200 908 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 PPP2R5AQ15172 486 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 GPR162Q16538 588 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 SARM1Q6SZW1 724 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 PLCD3Q8N3E9 789 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 MED10Q9BTT4 135 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 PARD6BQ9BYG5 372 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 POLD4Q9HCU8 107 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 UBN2Q6ZU65 1347 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 KIF11P52732 1056 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 C2orf54Q08AI8 447 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 APOL6Q9BWW8 343 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 MFAP3LO75121 409 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 PCK1P35558 622 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 CEP95Q96GE4 821 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC5A4Q9NY91 659 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 STK36Q9NRP7 1315 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 CPDO75976 1380 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 USP31Q70CQ4 1352 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 ALX1Q15699 326 aa18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.9 ms