RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370287.7

CSAG1-202, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSAG1, Length 875 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-202ENST00000370287 PFKFB2O60825 505 aa17.11■□□□□ 0.33
CSAG1-202ENST00000370287 STAM2O75886 525 aa17.11■□□□□ 0.33
CSAG1-202ENST00000370287 NEK4P51957 841 aa17.11■□□□□ 0.33
CSAG1-202ENST00000370287 GNPTABQ3T906 1256 aa17.11■□□□□ 0.33
CSAG1-202ENST00000370287 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
CSAG1-202ENST00000370287 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
CSAG1-202ENST00000370287 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
CSAG1-202ENST00000370287 MYSM1Q5VVJ2 828 aa17.11■□□□□ 0.33
CSAG1-202ENST00000370287 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa17.11■□□□□ 0.33
CSAG1-202ENST00000370287 XRRA1Q6P2D8 792 aa17.11■□□□□ 0.33
CSAG1-202ENST00000370287 KCNV1Q6PIU1 500 aa17.11■□□□□ 0.33
CSAG1-202ENST00000370287 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
CSAG1-202ENST00000370287 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
CSAG1-202ENST00000370287 ZMYND12Q9H0C1 365 aa17.11■□□□□ 0.33
CSAG1-202ENST00000370287 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
CSAG1-202ENST00000370287 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa17.11■□□□□ 0.33
CSAG1-202ENST00000370287 MYH7BA7E2Y1 1941 aa17.1■□□□□ 0.33
CSAG1-202ENST00000370287 DCDC2CA8MYV0 355 aa17.1■□□□□ 0.33
CSAG1-202ENST00000370287 FIBPO43427 364 aa17.1■□□□□ 0.33
CSAG1-202ENST00000370287 TGFB3P10600 412 aa17.1■□□□□ 0.33
CSAG1-202ENST00000370287 ITGB5P18084 799 aa17.1■□□□□ 0.33
CSAG1-202ENST00000370287 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
CSAG1-202ENST00000370287 LAMC2Q13753 1193 aa17.1■□□□□ 0.33
CSAG1-202ENST00000370287 ME3Q16798 604 aa17.1■□□□□ 0.33
CSAG1-202ENST00000370287 HSDL1Q3SXM5 330 aa17.1■□□□□ 0.33
CSAG1-202ENST00000370287 PPTC7Q8NI37 304 aa17.1■□□□□ 0.33
CSAG1-202ENST00000370287 AIFM3Q96NN9 605 aa17.1■□□□□ 0.33
CSAG1-202ENST00000370287 KIF2CQ99661 725 aa17.1■□□□□ 0.33
CSAG1-202ENST00000370287 TMEM39AQ9NV64 488 aa17.1■□□□□ 0.33
CSAG1-202ENST00000370287 TELO2Q9Y4R8 837 aa17.1■□□□□ 0.33
CSAG1-202ENST00000370287 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa17.1■□□□□ 0.33
CSAG1-202ENST00000370287 MROH7Q68CQ1 1323 aa17.1■□□□□ 0.33
CSAG1-202ENST00000370287 DOCK5Q9H7D0 1870 aa17.1■□□□□ 0.33
CSAG1-202ENST00000370287 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa17.09■□□□□ 0.33
CSAG1-202ENST00000370287 KIAA0355O15063 1070 aa17.09■□□□□ 0.33
CSAG1-202ENST00000370287 B4GALT4O60513 344 aa17.09■□□□□ 0.33
CSAG1-202ENST00000370287 CTDNEP1O95476 244 aa17.09■□□□□ 0.33
CSAG1-202ENST00000370287 CD4P01730 458 aa17.09■□□□□ 0.33
CSAG1-202ENST00000370287 AP3B2Q13367 1082 aa17.09■□□□□ 0.33
CSAG1-202ENST00000370287 ANKRD1Q15327 319 aa17.09■□□□□ 0.33
CSAG1-202ENST00000370287 NBPF20Q3BBV1 942 aa17.09■□□□□ 0.33
CSAG1-202ENST00000370287 TRIM22Q8IYM9 498 aa17.09■□□□□ 0.33
CSAG1-202ENST00000370287 NECAB1Q8N987 351 aa17.09■□□□□ 0.33
CSAG1-202ENST00000370287 RASGRP4Q8TDF6 673 aa17.09■□□□□ 0.33
CSAG1-202ENST00000370287 KAT2BQ92831 832 aa17.09■□□□□ 0.33
CSAG1-202ENST00000370287 BADQ92934 168 aa17.09■□□□□ 0.33
CSAG1-202ENST00000370287 SPATA33Q96N06 139 aa17.09■□□□□ 0.33
CSAG1-202ENST00000370287 GLT8D2Q9H1C3 349 aa17.09■□□□□ 0.33
CSAG1-202ENST00000370287 EHMT1Q9H9B1 1298 aa17.09■□□□□ 0.33
CSAG1-202ENST00000370287 TBX21Q9UL17 535 aa17.09■□□□□ 0.33
CSAG1-202ENST00000370287 ATP9AO75110 1047 aa17.08■□□□□ 0.32
CSAG1-202ENST00000370287 DEXIO95424 95 aa17.08■□□□□ 0.32
CSAG1-202ENST00000370287 FOSP01100 380 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF286BP0CG31 522 aa17.08■□□□□ 0.32
CSAG1-202ENST00000370287 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
CSAG1-202ENST00000370287 BMP8BP34820 402 aa17.08■□□□□ 0.32
CSAG1-202ENST00000370287 SREBF1P36956 1147 aa17.08■□□□□ 0.32
CSAG1-202ENST00000370287 DGKDQ16760 1214 aa17.08■□□□□ 0.32
CSAG1-202ENST00000370287 CYFIP1Q7L576 1253 aa17.08■□□□□ 0.32
CSAG1-202ENST00000370287 NLRX1Q86UT6 975 aa17.08■□□□□ 0.32
CSAG1-202ENST00000370287 TEX2Q8IWB9 1127 aa17.08■□□□□ 0.32
CSAG1-202ENST00000370287 CYP2W1Q8TAV3 490 aa17.08■□□□□ 0.32
CSAG1-202ENST00000370287 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
CSAG1-202ENST00000370287 GPRASP2Q96D09 838 aa17.08■□□□□ 0.32
CSAG1-202ENST00000370287 C22orf23Q9BZE7 217 aa17.08■□□□□ 0.32
CSAG1-202ENST00000370287 TRPV6Q9H1D0 765 aa17.08■□□□□ 0.32
CSAG1-202ENST00000370287 MLXIPQ9HAP2 919 aa17.08■□□□□ 0.32
CSAG1-202ENST00000370287 C6orf50Q9HD87 102 aa17.08■□□□□ 0.32
CSAG1-202ENST00000370287 TLR3O15455 904 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
CSAG1-202ENST00000370287 KPNA6O60684 536 aa17.07■□□□□ 0.32
CSAG1-202ENST00000370287 KCNA2P16389 499 aa17.07■□□□□ 0.32
CSAG1-202ENST00000370287 CHMP4BP1P59074 171 aa17.07■□□□□ 0.32
CSAG1-202ENST00000370287 ST3GAL1Q11201 340 aa17.07■□□□□ 0.32
CSAG1-202ENST00000370287 NEDD9Q14511 834 aa17.07■□□□□ 0.32
CSAG1-202ENST00000370287 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
CSAG1-202ENST00000370287 METTL7BQ6UX53 244 aa17.07■□□□□ 0.32
CSAG1-202ENST00000370287 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
CSAG1-202ENST00000370287 CCDC148Q8NFR7 591 aa17.07■□□□□ 0.32
CSAG1-202ENST00000370287 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
CSAG1-202ENST00000370287 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
CSAG1-202ENST00000370287 JADE2Q9NQC1 790 aa17.07■□□□□ 0.32
CSAG1-202ENST00000370287 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
CSAG1-202ENST00000370287 PKD2L1Q9P0L9 805 aa17.07■□□□□ 0.32
CSAG1-202ENST00000370287 UMODL1Q5DID0 1318 aa17.06■□□□□ 0.32
CSAG1-202ENST00000370287 RAG1P15918 1043 aa17.06■□□□□ 0.32
CSAG1-202ENST00000370287 GNA11P29992 359 aa17.06■□□□□ 0.32
CSAG1-202ENST00000370287 RBM25P49756 843 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
CSAG1-202ENST00000370287 ARHGAP4P98171 946 aa17.06■□□□□ 0.32
CSAG1-202ENST00000370287 SP4Q02446 784 aa17.06■□□□□ 0.32
CSAG1-202ENST00000370287 MTMR1Q13613 665 aa17.06■□□□□ 0.32
CSAG1-202ENST00000370287 FAM47CQ5HY64 1035 aa17.06■□□□□ 0.32
CSAG1-202ENST00000370287 CRYGNQ8WXF5 182 aa17.06■□□□□ 0.32
CSAG1-202ENST00000370287 GTF3C6Q969F1 213 aa17.06■□□□□ 0.32
CSAG1-202ENST00000370287 SENP7Q9BQF6 1050 aa17.06■□□□□ 0.32
CSAG1-202ENST00000370287 MXRA8Q9BRK3 442 aa17.06■□□□□ 0.32
CSAG1-202ENST00000370287 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa17.06■□□□□ 0.32
CSAG1-202ENST00000370287 SH3GLB2Q9NR46 395 aa17.06■□□□□ 0.32
CSAG1-202ENST00000370287 STK36Q9NRP7 1315 aa17.05■□□□□ 0.32
CSAG1-202ENST00000370287 CDKL5O76039 1030 aa17.05■□□□□ 0.32
CSAG1-202ENST00000370287 F2P00734 622 aa17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms