RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369862.1

AMIGO1-201, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene AMIGO1, Length 2,229 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-201ENST00000369862 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa26.53■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 ANO9A1A5B4 782 aa26.52■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 RAD21O60216 631 aa26.52■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 ECE2O60344 883 aa26.52■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP26.52■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 UNC13DQ70J99 1090 aa26.52■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 FLAD1Q8NFF5 587 aa26.52■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 MKL1Q969V6 931 aa26.52■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 IDI2Q9BXS1 227 aa26.52■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 RASSF10A6NK89 507 aa26.51■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 PPP1R2P41236 205 aa26.51■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 QRICH1Q2TAL8 776 aa26.51■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 MIIPQ5JXC2 388 aa26.51■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 KRT79Q5XKE5 535 aa26.51■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 SIAH1Q8IUQ4 282 aa26.51■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 TFR2Q9UP52 801 aa26.51■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 USP17L15C9J2P7 530 aa26.51■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 USP17L13C9JLJ4 530 aa26.51■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 USP17L11C9JVI0 530 aa26.51■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 USP17L18D6R9N7 530 aa26.51■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 USP17L22D6RA61 530 aa26.51■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 USP17L17D6RBQ6 530 aa26.51■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 USP17L19D6RCP7 530 aa26.51■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 USP17L20D6RJB6 530 aa26.51■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 KLK7P49862 253 aa26.51■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa26.51■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 USP17L24Q0WX57 530 aa26.51■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 CENPPQ6IPU0 288 aa26.51■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 USP17L6PQ6QN14 398 aa26.51■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 PI4KBQ9UBF8 816 aa26.51■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa26.5■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 SRGAP2O75044 1071 aa26.5■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 CDK17Q00537 523 aa26.5■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC1A4P43007 532 aa26.5■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 FIGNQ5HY92 759 aa26.5■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 LACRTQ9GZZ8 138 aa26.5■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 NYAP2Q9P242 653 aa26.5■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 A0A1W2PQJ5 194 aa26.49■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 SEPT2Q15019 361 aa26.49■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 KANSL2Q9H9L4 492 aa26.49■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 RCCD1A6NED2 376 aa26.49■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 SLFN13Q68D06 897 aa26.49■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 TATDN1Q6P1N9 297 aa26.49■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 DDX12PQ92771 950 aa26.49■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 PHACTR2O75167 634 aa26.48■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 EHHADHQ08426 723 aa26.48■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 DCAF4Q8WV16 495 aa26.48■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 IQCDQ96DY2 449 aa26.48■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 HPCAL4Q9UM19 191 aa26.48■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa26.48■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 CAPZA3Q96KX2 299 aa26.47■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 UIMC1Q96RL1 719 aa26.47■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 ERGIC2Q96RQ1 377 aa26.47■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 TSGA10Q9BZW7 698 aa26.47■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM204AQ9H8W3 233 aa26.47■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 H0YIN7 160 aa26.47■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 CHRNA5P30532 468 aa26.47■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 IQCEQ6IPM2 695 aa26.47■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 STYK1Q6J9G0 422 aa26.47■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 SRLQ86TD4 932 aa26.47■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 GLIS3Q8NEA6 775 aa26.47■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 COG1Q8WTW3 980 aa26.47■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 ZBTB9Q96C00 473 aa26.47■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 MYO1CO00159 1063 aa26.46■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 RNF40O75150 1001 aa26.46■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 SYF2O95926 243 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 IDEP14735 1019 aa26.46■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 PCDHA12Q9UN75 941 aa26.46■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 GDF11O95390 407 aa26.46■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 VAV2P52735 878 aa26.46■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 ICA1Q05084 483 aa26.46■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 KIF5AQ12840 1032 aa26.46■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa26.46■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 CAGE1Q8TC20 777 aa26.46■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 SERPINA10Q9UK55 444 aa26.46■■□□□ 1.83
AMIGO1-201ENST00000369862 AOC3Q16853 763 aa26.45■■□□□ 1.82
AMIGO1-201ENST00000369862 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
AMIGO1-201ENST00000369862 FKBP15Q5T1M5 1219 aa26.45■■□□□ 1.82
AMIGO1-201ENST00000369862 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
AMIGO1-201ENST00000369862 DNAJC19Q96DA6 116 aa26.45■■□□□ 1.82
AMIGO1-201ENST00000369862 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
AMIGO1-201ENST00000369862 TRIM34Q9BYJ4 488 aa26.45■■□□□ 1.82
AMIGO1-201ENST00000369862 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.6 ms