RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326277.5

SNX18-201, Transcript of sorting nexin 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNX18, Length 2,063 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18-201ENST00000326277 SHTN1A0MZ66 631 aa25.47■■□□□ 1.67
SNX18-201ENST00000326277 LRRC41Q15345 812 aa25.47■■□□□ 1.67
SNX18-201ENST00000326277 CCDC174Q6PII3 467 aa25.47■■□□□ 1.67
SNX18-201ENST00000326277 CYP26C1Q6V0L0 522 aa25.47■■□□□ 1.67
SNX18-201ENST00000326277 KIFC2Q96AC6 838 aa25.47■■□□□ 1.67
SNX18-201ENST00000326277 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
SNX18-201ENST00000326277 PANK4Q9NVE7 773 aa25.47■■□□□ 1.67
SNX18-201ENST00000326277 A0A0U1RQJ8 604 aa25.46■■□□□ 1.67
SNX18-201ENST00000326277 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
SNX18-201ENST00000326277 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa25.46■■□□□ 1.67
SNX18-201ENST00000326277 CYP2W1Q8TAV3 490 aa25.46■■□□□ 1.67
SNX18-201ENST00000326277 ATRIPQ8WXE1 791 aa25.46■■□□□ 1.67
SNX18-201ENST00000326277 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
SNX18-201ENST00000326277 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
SNX18-201ENST00000326277 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP25.46■■□□□ 1.67
SNX18-201ENST00000326277 V9GYY5 206 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
SNX18-201ENST00000326277 POTEFA5A3E0 1075 aa25.46■■□□□ 1.67
SNX18-201ENST00000326277 POTEIP0CG38 1075 aa25.46■■□□□ 1.67
SNX18-201ENST00000326277 TGFB2P61812 414 aa25.46■■□□□ 1.67
SNX18-201ENST00000326277 TRAF1Q13077 416 aa25.46■■□□□ 1.67
SNX18-201ENST00000326277 HAUS3Q68CZ6 603 aa25.46■■□□□ 1.67
SNX18-201ENST00000326277 CIAPIN1Q6FI81 312 aa25.46■■□□□ 1.67
SNX18-201ENST00000326277 NCAPH2Q6IBW4 605 aa25.46■■□□□ 1.67
SNX18-201ENST00000326277 POTEGQ6S5H5 508 aa25.46■■□□□ 1.67
SNX18-201ENST00000326277 POTEEQ6S8J3 1075 aa25.46■■□□□ 1.67
SNX18-201ENST00000326277 CHURC1Q8WUH1 139 aa25.46■■□□□ 1.67
SNX18-201ENST00000326277 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
SNX18-201ENST00000326277 CAPN11Q9UMQ6 739 aa25.46■■□□□ 1.67
SNX18-201ENST00000326277 MSH4O15457 936 aa25.45■■□□□ 1.66
SNX18-201ENST00000326277 ZBTB7AO95365 584 aa25.45■■□□□ 1.66
SNX18-201ENST00000326277 CYP3A4P08684 503 aa25.45■■□□□ 1.66
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SNX18-201ENST00000326277 GPBP1Q86WP2 473 aa25.45■■□□□ 1.66
SNX18-201ENST00000326277 CATSPER3Q86XQ3 398 aa25.45■■□□□ 1.66
SNX18-201ENST00000326277 TBC1D5Q92609 795 aa25.45■■□□□ 1.66
SNX18-201ENST00000326277 FAM20AQ96MK3 541 aa25.45■■□□□ 1.66
SNX18-201ENST00000326277 MYOZ2Q9NPC6 264 aa25.45■■□□□ 1.66
SNX18-201ENST00000326277 LZTFL1Q9NQ48 299 aa25.45■■□□□ 1.66
SNX18-201ENST00000326277 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
SNX18-201ENST00000326277 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
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SNX18-201ENST00000326277 CASQ1P31415 396 aa25.44■■□□□ 1.66
SNX18-201ENST00000326277 OR8K1Q8NGG5 319 aa25.44■■□□□ 1.66
SNX18-201ENST00000326277 DNAJC7Q99615 494 aa25.44■■□□□ 1.66
SNX18-201ENST00000326277 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa25.44■■□□□ 1.66
SNX18-201ENST00000326277 RASSF10A6NK89 507 aa25.44■■□□□ 1.66
SNX18-201ENST00000326277 CYP11B2P19099 503 aa25.44■■□□□ 1.66
SNX18-201ENST00000326277 KLK7P49862 253 aa25.44■■□□□ 1.66
SNX18-201ENST00000326277 MAP3K10Q02779 954 aa25.44■■□□□ 1.66
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SNX18-201ENST00000326277 FAM26FQ5R3K3 315 aa25.44■■□□□ 1.66
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SNX18-201ENST00000326277 PDCL2Q8N4E4 241 aa25.44■■□□□ 1.66
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SNX18-201ENST00000326277 ZNF76P36508 570 aa25.43■■□□□ 1.66
SNX18-201ENST00000326277 SLC12A3P55017 1021 aa25.43■■□□□ 1.66
SNX18-201ENST00000326277 JDP2Q8WYK2 163 aa25.43■■□□□ 1.66
SNX18-201ENST00000326277 CHP1Q99653 195 aa25.43■■□□□ 1.66
SNX18-201ENST00000326277 TTYH3Q9C0H2 523 aa25.43■■□□□ 1.66
SNX18-201ENST00000326277 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa25.43■■□□□ 1.66
SNX18-201ENST00000326277 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
SNX18-201ENST00000326277 LRRC55Q6ZSA7 311 aa25.43■■□□□ 1.66
SNX18-201ENST00000326277 CCDC65Q8IXS2 484 aa25.43■■□□□ 1.66
SNX18-201ENST00000326277 VAV3Q9UKW4 847 aa25.43■■□□□ 1.66
SNX18-201ENST00000326277 PLA2G6O60733 806 aa25.42■■□□□ 1.66
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SNX18-201ENST00000326277 RPA1P27694 616 aa25.42■■□□□ 1.66
SNX18-201ENST00000326277 ARSHQ5FYA8 562 aa25.42■■□□□ 1.66
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SNX18-201ENST00000326277 FBXO28Q9NVF7 368 aa25.42■■□□□ 1.66
SNX18-201ENST00000326277 TBC1D7Q9P0N9 293 aa25.42■■□□□ 1.66
SNX18-201ENST00000326277 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa25.42■■□□□ 1.66
SNX18-201ENST00000326277 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa25.41■■□□□ 1.66
SNX18-201ENST00000326277 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
SNX18-201ENST00000326277 ASNSP08243 561 aa25.41■■□□□ 1.66
SNX18-201ENST00000326277 POLR2MP0CAP2 368 aa25.41■■□□□ 1.66
SNX18-201ENST00000326277 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
SNX18-201ENST00000326277 PSMC6P62333 389 aa25.41■■□□□ 1.66
SNX18-201ENST00000326277 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa25.41■■□□□ 1.66
SNX18-201ENST00000326277 FAM160B2Q86V87 743 aa25.41■■□□□ 1.66
SNX18-201ENST00000326277 TEX2Q8IWB9 1127 aa25.41■■□□□ 1.66
SNX18-201ENST00000326277 ERGIC2Q96RQ1 377 aa25.41■■□□□ 1.66
SNX18-201ENST00000326277 TSG101Q99816 390 aa25.41■■□□□ 1.66
SNX18-201ENST00000326277 NUP58Q9BVL2 599 aa25.41■■□□□ 1.66
SNX18-201ENST00000326277 MEIS1O00470 390 aa25.41■■□□□ 1.66
SNX18-201ENST00000326277 RASA3Q14644 834 aa25.41■■□□□ 1.66
SNX18-201ENST00000326277 VWA3BQ502W6 1294 aa25.41■■□□□ 1.66
SNX18-201ENST00000326277 FOXR2Q6PJQ5 311 aa25.41■■□□□ 1.66
SNX18-201ENST00000326277 RETREG2Q8NC44 543 aa25.41■■□□□ 1.66
SNX18-201ENST00000326277 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa25.41■■□□□ 1.66
SNX18-201ENST00000326277 FEM1BQ9UK73 627 aa25.41■■□□□ 1.66
SNX18-201ENST00000326277 ELF2Q15723 593 aa25.4■■□□□ 1.66
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