RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320031.12

ITGA3-202, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ITGA3, Length 4,888 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-202ENST00000320031 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa18.07■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 DAAM2Q86T65 1068 aa18.07■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 ANAPC4Q9UJX5 808 aa18.07■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 ALCAMQ13740 583 aa18.07■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa18.07■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa18.07■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 KRT31Q15323 416 aa18.07■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 CROCCP2Q86T23 111 aa18.07■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 PPM1KQ8N3J5 372 aa18.07■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 KIF1AQ12756 1690 aa18.07■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 ABCB4P21439 1286 aa18.07■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 FAM83BQ5T0W9 1011 aa18.07■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 SUGCTQ9HAC7 445 aa18.07■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 FAM196BA6NMK8 535 aa18.06■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 OSBPP22059 807 aa18.06■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 CCDC170Q8IYT3 715 aa18.06■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 ADGRF4Q8IZF3 695 aa18.06■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa18.06■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 PHF20Q9BVI0 1012 aa18.06■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa18.06■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 EBAG9O00559 213 aa18.06■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 PDE6CP51160 858 aa18.06■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 HHIPL2Q6UWX4 724 aa18.06■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 STAG2Q8N3U4 1231 aa18.06■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 SELENOSQ9BQE4 189 aa18.06■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 GDAQ9Y2T3 454 aa18.06■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 M0QZ92 97 aa18.06■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 DLATP10515 647 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 OAS2P29728 719 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 QRICH1Q2TAL8 776 aa18.06■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 NDST4Q9H3R1 872 aa18.06■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 MTMR4Q9NYA4 1195 aa18.06■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 CDC23Q9UJX2 597 aa18.06■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 IFT172Q9UG01 1749 aa18.06■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 TNNC2P02585 160 aa18.06■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 TMOD1P28289 359 aa18.06■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 ARHGAP4P98171 946 aa18.06■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 ZSCAN26Q16670 478 aa18.06■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 BCL9O00512 1426 aa18.06■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 USP17L15C9J2P7 530 aa18.05■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 USP17L13C9JLJ4 530 aa18.05■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 USP17L11C9JVI0 530 aa18.05■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 USP17L18D6R9N7 530 aa18.05■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 USP17L22D6RA61 530 aa18.05■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 USP17L17D6RBQ6 530 aa18.05■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 USP17L19D6RCP7 530 aa18.05■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 USP17L20D6RJB6 530 aa18.05■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 LMNB1P20700 586 aa18.05■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 USP17L24Q0WX57 530 aa18.05■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 USP17L6PQ6QN14 398 aa18.05■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 CEP170P1Q96L14 293 aa18.05■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 BHMT2Q9H2M3 363 aa18.05■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 ATP5DP30049 168 aa18.05■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 IREB2P48200 963 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 GOLGA8FQ08AF8 430 aa18.05■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa18.05■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 EXOC8Q8IYI6 725 aa18.05■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 MAP3K14Q99558 947 aa18.05■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 PLCD4Q9BRC7 762 aa18.05■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 ADPGKQ9BRR6 497 aa18.05■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 A6NNZ2 444 aa18.05■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 RGL2O15211 777 aa18.05■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 FGFR2P21802 821 aa18.05■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 SNAP25P60880 206 aa18.05■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 TFDP1Q14186 410 aa18.05■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 TUBB8Q3ZCM7 444 aa18.05■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 ZBTB9Q96C00 473 aa18.05■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 KMT5AQ9NQR1 393 aa18.05■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 ABCB11O95342 1321 aa18.05■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 POTEMA6NI47 508 aa18.05■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 BPIFB4P59827 614 aa18.05■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 HACE1Q8IYU2 909 aa18.05■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 RAB17Q9H0T7 212 aa18.05■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 KCNK3O14649 394 aa18.04■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 SORBS3O60504 671 aa18.04■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 MFAP3P55082 362 aa18.04■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 C16orf86Q6ZW13 317 aa18.04■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 NT5C1BQ96P26 610 aa18.04■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 GOLGA6BA6NDN3 693 aa18.04■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 SMIM23A6NLE4 172 aa18.04■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 BUB1O43683 1085 aa18.04■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 MB21D1Q8N884 522 aa18.04■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 RUFY4Q6ZNE9 571 aa18.04■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 RNF207Q6ZRF8 634 aa18.04■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 ARMC9Q7Z3E5 817 aa18.04■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 AFAP1L1Q8TED9 768 aa18.04■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 RAD54LQ92698 747 aa18.04■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 FAM81BQ96LP2 452 aa18.04■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 ASIC3Q9UHC3 531 aa18.04■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 USTQ9Y2C2 406 aa18.04■□□□□ 0.48
ITGA3-202ENST00000320031 FDPSP14324 419 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms