RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293861.7

SNRNP25-201, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U11/U12 subunit 25, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene SNRNP25, Length 1,905 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25-201ENST00000293861 FDX1P10109 184 aa24■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 TNNT1P13805 278 aa24■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 VCAM1P19320 739 aa24■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF76P36508 570 aa24■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 CENPPQ6IPU0 288 aa24■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 FOXR2Q6PJQ5 311 aa24■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 DYMQ7RTS9 669 aa24■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 KCTD17Q8N5Z5 321 aa24■■□□□ 1.43
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SNRNP25-201ENST00000293861 EMILIN3Q9NT22 766 aa24■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 KIAA1024Q9UPX6 916 aa24■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 PHIPQ8WWQ0 1821 aa23.99■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 CCP110O43303 1012 aa23.99■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 PTPRAP18433 802 aa23.99■■□□□ 1.43
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SNRNP25-201ENST00000293861 BACE1P56817 501 aa23.99■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 GHRHRQ02643 423 aa23.99■■□□□ 1.43
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SNRNP25-201ENST00000293861 TANGO6Q9C0B7 1094 aa23.99■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa23.99■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
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SNRNP25-201ENST00000293861 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa23.99■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 POTEB3A0JP26 581 aa23.98■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 POTECB2RU33 542 aa23.98■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 MED24O75448 989 aa23.98■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 STAT3P40763 770 aa23.98■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 HSD17B4P51659 736 aa23.98■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa23.98■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 ANKRD40Q6AI12 368 aa23.98■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 POTEBQ6S5H4 581 aa23.98■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa23.98■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF280CQ8ND82 737 aa23.98■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 MYRIPQ8NFW9 859 aa23.98■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 SLC39A2Q9NP94 309 aa23.98■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 TAB2Q9NYJ8 693 aa23.98■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa23.98■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 E9PMD0 336 aa23.98■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 PLA2G4BP0C869 781 aa23.98■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 SPP2Q13103 211 aa23.98■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 PTPN14Q15678 1187 aa23.98■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 PPFIBP1Q86W92 1011 aa23.98■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 FAM114A1Q8IWE2 563 aa23.98■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 SAMD3Q8N6K7 520 aa23.98■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 KLRG1Q96E93 195 aa23.98■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 AGBL1Q96MI9 1066 aa23.98■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 VPS16Q9H269 839 aa23.98■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP23.98■■□□□ 1.434e-7■■■■□ 23
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SNRNP25-201ENST00000293861 FLOT1O75955 427 aa23.97■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 GOLGA8FQ08AF8 430 aa23.97■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa23.97■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 CATSPER3Q86XQ3 398 aa23.97■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 MCF2L2Q86YR7 1114 aa23.97■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 CYP2W1Q8TAV3 490 aa23.97■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 C12orf42Q96LP6 360 aa23.97■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 SSC5DA1L4H1 1573 aa23.97■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 ADKP55263 362 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 TRIM14Q14142 442 aa23.96■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa23.96■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 NCAPH2Q6IBW4 605 aa23.96■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 SEMA6BQ9H3T3 888 aa23.96■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa23.96■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 LGALS16A8MUM7 142 aa23.96■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa23.96■■□□□ 1.43
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SNRNP25-201ENST00000293861 HPS3Q969F9 1004 aa23.96■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 CCDC51Q96ER9 411 aa23.96■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa23.96■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 UIMC1Q96RL1 719 aa23.96■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
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SNRNP25-201ENST00000293861 UQCRHLA0A096LP55 91 aa23.95■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 C19orf81C9J6K1 198 aa23.95■■□□□ 1.42
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SNRNP25-201ENST00000293861 RBL2Q08999 1139 aa23.95■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 COASYQ13057 564 aa23.95■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 CLEC4DQ8WXI8 215 aa23.95■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 RNF181Q9P0P0 153 aa23.95■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa23.95■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 RLFQ13129 1914 aa23.95■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 A0A1W2PQC6 194 aa23.94■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 ZBED4O75132 1171 aa23.94■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 DDNO94850 711 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
SNRNP25-201ENST00000293861 LRRC63Q05C16 580 aa23.94■■□□□ 1.42
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