RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000290921.10

CTBP1-201, Transcript of C-terminal binding protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTBP1, Length 2,297 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1-201ENST00000290921 SLC1A4P43007 532 aa27.92■■■□□ 2.06
CTBP1-201ENST00000290921 CALCRLQ16602 461 aa27.92■■■□□ 2.06
CTBP1-201ENST00000290921 LRRC55Q6ZSA7 311 aa27.92■■■□□ 2.06
CTBP1-201ENST00000290921 CCDC155Q8N6L0 562 aa27.92■■■□□ 2.06
CTBP1-201ENST00000290921 UBA5Q9GZZ9 404 aa27.92■■■□□ 2.06
CTBP1-201ENST00000290921 GRIN2DO15399 1336 aa27.91■■■□□ 2.06
CTBP1-201ENST00000290921 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
CTBP1-201ENST00000290921 USP17L5A8MUK1 530 aa27.91■■■□□ 2.06
CTBP1-201ENST00000290921 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP27.91■■■□□ 2.063e-8■□□□□ 8.6
CTBP1-201ENST00000290921 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP27.91■■■□□ 2.06
CTBP1-201ENST00000290921 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
CTBP1-201ENST00000290921 BCAS4Q8TDM0 211 aa27.91■■■□□ 2.06
CTBP1-201ENST00000290921 ARL8AQ96BM9 186 aa27.91■■■□□ 2.06
CTBP1-201ENST00000290921 TANGO6Q9C0B7 1094 aa27.91■■■□□ 2.06
CTBP1-201ENST00000290921 RIOX1Q9H6W3 641 aa27.91■■■□□ 2.06
CTBP1-201ENST00000290921 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa27.9■■■□□ 2.06
CTBP1-201ENST00000290921 EBAG9O00559 213 aa27.9■■■□□ 2.06
CTBP1-201ENST00000290921 NOVP48745 357 aa27.9■■■□□ 2.06
CTBP1-201ENST00000290921 TTMPQ5BVD1 217 aa27.9■■■□□ 2.06
CTBP1-201ENST00000290921 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
CTBP1-201ENST00000290921 MS4A14Q96JA4 679 aa27.9■■■□□ 2.06
CTBP1-201ENST00000290921 EDEM3Q9BZQ6 932 aa27.9■■■□□ 2.06
CTBP1-201ENST00000290921 hCG_1984214I3L0E3 225 aa27.9■■■□□ 2.06
CTBP1-201ENST00000290921 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
CTBP1-201ENST00000290921 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
CTBP1-201ENST00000290921 HGSNATQ68CP4 663 aa27.9■■■□□ 2.06
CTBP1-201ENST00000290921 TADA2BQ86TJ2 420 aa27.9■■■□□ 2.06
CTBP1-201ENST00000290921 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
CTBP1-201ENST00000290921 RABEP2Q9H5N1 569 aa27.9■■■□□ 2.06
CTBP1-201ENST00000290921 KCNMA1Q12791 1236 aa27.89■■■□□ 2.06
CTBP1-201ENST00000290921 LRRC41Q15345 812 aa27.89■■■□□ 2.06
CTBP1-201ENST00000290921 CFAP221Q4G0U5 840 aa27.89■■■□□ 2.06
CTBP1-201ENST00000290921 TSG101Q99816 390 aa27.89■■■□□ 2.06
CTBP1-201ENST00000290921 CD209Q9NNX6 404 aa27.89■■■□□ 2.06
CTBP1-201ENST00000290921 SLC37A4O43826 429 aa27.89■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 PLCG2P16885 1265 aa27.89■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 TMEM266Q2M3C6 531 aa27.89■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 RAD54LQ92698 747 aa27.89■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 TSKSQ9UJT2 592 aa27.89■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 CPP00450 1065 aa27.88■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 RHBDL3P58872 404 aa27.88■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 GLIS3Q8NEA6 775 aa27.88■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 NLRC4Q9NPP4 1024 aa27.88■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 SHTN1A0MZ66 631 aa27.88■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 GPSM2P81274 684 aa27.88■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 NNTQ13423 1086 aa27.88■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 IFT20Q8IY31 132 aa27.88■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 DDX12PQ92771 950 aa27.88■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 ZIM3Q96PE6 472 aa27.88■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa27.87■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 TDP2O95551 362 aa27.87■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 PDHBP11177 359 aa27.87■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 SKOR1P84550 965 aa27.87■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 TMC4Q7Z404 712 aa27.87■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 RIC8AQ9NPQ8 531 aa27.87■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 FAM169AQ9Y6X4 670 aa27.87■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 POTEMA6NI47 508 aa27.87■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 EDIL3O43854 480 aa27.87■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 ADCY7P51828 1080 aa27.87■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 PSMD2Q13200 908 aa27.87■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 MICALL1Q8N3F8 863 aa27.87■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 NUDT12Q9BQG2 462 aa27.87■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 RNF14Q9UBS8 474 aa27.87■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 GLI1P08151 1106 aa27.86■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa27.86■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 SNX29Q8TEQ0 813 aa27.86■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 COA7Q96BR5 231 aa27.86■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 UFL1O94874 794 aa27.85■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 EHHADHQ08426 723 aa27.85■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 KCNK18Q7Z418 384 aa27.85■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 CNBD1Q8NA66 436 aa27.85■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 RAB34Q9BZG1 259 aa27.85■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 GDF3Q9NR23 364 aa27.85■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 CEP72Q9P209 647 aa27.85■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 IL1R1P14778 569 aa27.85■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 CARSP49589 748 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 PDIA5Q14554 519 aa27.85■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 SFMBT2Q5VUG0 894 aa27.85■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 PROM2Q8N271 834 aa27.85■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 NFU1Q9UMS0 254 aa27.85■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 PALMO75781 387 aa27.84■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 KRT79Q5XKE5 535 aa27.84■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 ICE2Q659A1 982 aa27.84■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa27.84■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 MYOCDQ8IZQ8 938 aa27.84■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 LRRC27Q9C0I9 530 aa27.84■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 EPB41L5Q9HCM4 733 aa27.84■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa27.84■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 BTAF1O14981 1849 aa27.84■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 TLR2O60603 784 aa27.84■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 SERPING1P05155 500 aa27.84■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 RFC4P35249 363 aa27.84■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 CCDC40Q4G0X9 1142 aa27.84■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
CTBP1-201ENST00000290921 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms