RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285679.10

USP25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 3,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-201ENST00000285679 MEGF6O75095 1541 aa16.79■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa16.79■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa16.79■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 RAD51CO43502 376 aa16.79■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 PDHBP11177 359 aa16.79■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 ANKRD42Q8N9B4 389 aa16.79■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa16.79■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 GJA10Q969M2 543 aa16.79■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 KLRC1P26715 233 aa16.79■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 PRDX5P30044 214 aa16.79■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 NEK8Q86SG6 692 aa16.79■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 MLXIPLQ9NP71 852 aa16.79■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 GMNCA6NCL1 334 aa16.79■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 SCP2P22307 547 aa16.79■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 IL17AQ16552 155 aa16.79■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 TTI2Q6NXR4 508 aa16.79■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 MMGT1Q8N4V1 131 aa16.79■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 MDM1Q8TC05 714 aa16.79■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 DAPK3O43293 454 aa16.78■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 KIF4AO95239 1232 aa16.78■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 ADAMTS2O95450 1211 aa16.78■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 GCKP35557 465 aa16.78■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 PLTPP55058 493 aa16.78■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 PTGISQ16647 500 aa16.78■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 FBXL5Q9UKA1 691 aa16.78■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa16.78■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 YY1AP1Q9H869 796 aa16.78■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 SLC40A1Q9NP59 571 aa16.78■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP16.78■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 LRRC10BA6NIK2 292 aa16.78■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 FAM83BQ5T0W9 1011 aa16.78■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 WDR17Q8IZU2 1322 aa16.78■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 GJC1P36383 396 aa16.77■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa16.77■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 COA7Q96BR5 231 aa16.77■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 CYFIP2Q96F07 1278 aa16.77■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa16.77■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 ADAMTS3O15072 1205 aa16.77■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 PACSIN1Q9BY11 444 aa16.77■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 TMEM260Q9NX78 707 aa16.77■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 LMO7Q8WWI1 1683 aa16.77■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa16.77■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 MYO1EQ12965 1108 aa16.77■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 FAM26FQ5R3K3 315 aa16.77■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 KRT25Q7Z3Z0 450 aa16.77■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 TEX11Q8IYF3 940 aa16.77■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 CCDC63Q8NA47 563 aa16.77■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 CETN3O15182 167 aa16.76■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 ADAM9Q13443 819 aa16.76■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 SEC23AQ15436 765 aa16.76■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 TRIM68Q6AZZ1 485 aa16.76■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 OTUD6AQ7L8S5 288 aa16.76■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 RDH13Q8NBN7 331 aa16.76■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 WHAMMQ8TF30 809 aa16.76■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 CEP83Q9Y592 693 aa16.76■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 ZNF263O14978 683 aa16.76■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 RHOBTB3O94955 611 aa16.76■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 PARP9Q8IXQ6 854 aa16.76■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 PLAGL2Q9UPG8 496 aa16.76■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 COPB2P35606 906 aa16.76■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 DDX12PQ92771 950 aa16.76■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 ELF1P32519 619 aa16.75■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 ZNF76P36508 570 aa16.75■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 VPS41P49754 854 aa16.75■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 ARHGAP44Q17R89 818 aa16.75■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 HVCN1Q96D96 273 aa16.75■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 PANK4Q9NVE7 773 aa16.75■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 ANKRD62A6NC57 917 aa16.75■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 ZNF233A6NK53 670 aa16.75■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 DIXDC1Q155Q3 683 aa16.75■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 TLR10Q9BXR5 811 aa16.75■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 ABCC6O95255 1503 aa16.75■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 SPDYE3A6NKU9 549 aa16.75■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 MECOMQ03112 1051 aa16.75■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 CCDC38Q502W7 563 aa16.75■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 BCS1LQ9Y276 419 aa16.75■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 PTPN22Q9Y2R2 807 aa16.75■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 PPP1R2P41236 205 aa16.74■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms