RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 EHMT1Q9H9B1 1298 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 BTBD7Q9P203 1132 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 STK17AQ9UEE5 414 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 EML1O00423 815 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 MYL1P05976 194 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 MCM6Q14566 821 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 OTOP1Q7RTM1 612 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 RAD54LQ92698 747 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 C7orf25Q9BPX7 421 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 MXRA8Q9BRK3 442 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 PGM5Q15124 567 aa10.48□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 PCNX4Q63HM2 1172 aa10.48□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 CATSPER3Q86XQ3 398 aa10.48□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF408Q9H9D4 720 aa10.48□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 POTEB3A0JP26 581 aa10.48□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 MYL5Q02045 173 aa10.48□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 KMT5BQ4FZB7 885 aa10.48□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 POTEBQ6S5H4 581 aa10.48□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 RMDN3Q96TC7 470 aa10.48□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 WDR11Q9BZH6 1224 aa10.48□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 PXMP2Q9NR77 195 aa10.48□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa10.48□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 MYMKA6NI61 221 aa10.48□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF75DP51815 510 aa10.48□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 PLS1Q14651 629 aa10.48□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 NCAPH2Q6IBW4 605 aa10.48□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 B3GNT9Q6UX72 402 aa10.48□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa10.48□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 PDCD2LQ9BRP1 358 aa10.48□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 CYP39A1Q9NYL5 469 aa10.48□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa10.48□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 KIAA1024Q9UPX6 916 aa10.48□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 GDAQ9Y2T3 454 aa10.48□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa10.48□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 ATP1A3P13637 1013 aa10.47□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 KCNB1Q14721 858 aa10.47□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 GPAT2Q6NUI2 795 aa10.47□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 TRIM5Q9C035 493 aa10.47□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 KCNH7Q9NS40 1196 aa10.47□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 FANCLQ9NW38 375 aa10.47□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 POTEFA5A3E0 1075 aa10.47□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 SMTNL1A8MU46 457 aa10.47□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 E9PMD0 336 aa10.47□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 RHOBTB3O94955 611 aa10.47□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 BCRP11274 1271 aa10.47□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 RPA1P27694 616 aa10.47□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 SETQ01105 290 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 PPP2R5CQ13362 524 aa10.47□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 LRCH2Q5VUJ6 765 aa10.47□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 POTEGQ6S5H5 508 aa10.47□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 SV2BQ7L1I2 683 aa10.47□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF577Q9BSK1 485 aa10.47□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa10.47□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 ACAD9Q9H845 621 aa10.47□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa10.47□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 CNMDO75829 334 aa10.47□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 TKFCQ3LXA3 575 aa10.47□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 NT5C3AQ9H0P0 336 aa10.47□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 DACH1Q9UI36 760 aa10.47□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 DHX15O43143 795 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC26A4O43511 780 aa10.46□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 PSMC6P62333 389 aa10.46□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 HERVK_113P62684 666 aa10.46□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 NIPA1Q7RTP0 329 aa10.46□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 HSD17B14Q9BPX1 270 aa10.46□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 TXNRD2Q9NNW7 524 aa10.46□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 NMRK2Q9NPI5 230 aa10.46□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 JADE2Q9NQC1 790 aa10.46□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 RMND1Q9NWS8 449 aa10.46□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 PRCPP42785 496 aa10.46□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 HAUS3Q68CZ6 603 aa10.46□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 KLHL10Q6JEL2 608 aa10.46□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 CNNM4Q6P4Q7 775 aa10.46□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC10A4Q96EP9 437 aa10.46□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 RGL1Q9NZL6 768 aa10.46□□□□□ -0.73
RABGEF1-201ENST00000284957 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa10.46□□□□□ -0.74
RABGEF1-201ENST00000284957 ASTN1O14525 1302 aa10.46□□□□□ -0.74
RABGEF1-201ENST00000284957 SOCS7O14512 581 aa10.46□□□□□ -0.74
RABGEF1-201ENST00000284957 GAS7O60861 476 aa10.46□□□□□ -0.74
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF18P17022 549 aa10.46□□□□□ -0.74
RABGEF1-201ENST00000284957 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.74
RABGEF1-201ENST00000284957 AMPD3Q01432 767 aa10.46□□□□□ -0.74
RABGEF1-201ENST00000284957 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.74
RABGEF1-201ENST00000284957 ARHGEF16Q5VV41 709 aa10.46□□□□□ -0.74
RABGEF1-201ENST00000284957 VSIG10LQ86VR7 867 aa10.46□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms