RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272133.3

CNIH3-201, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNIH3, Length 2,558 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3-201ENST00000272133 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa20.62■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa20.62■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 KLRF2D3W0D1 207 aa20.62■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa20.61■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 KLRC1P26715 233 aa20.61■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 PNMA5Q96PV4 448 aa20.61■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 TMEM47Q9BQJ4 181 aa20.61■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 ABCB11O95342 1321 aa20.61■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 H0YHG0 523 aa20.61■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 PPP1R37O75864 691 aa20.61■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 PPARDQ03181 441 aa20.61■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 LRRC63Q05C16 580 aa20.61■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 MREGQ8N565 214 aa20.61■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 RNF14Q9UBS8 474 aa20.61■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 EHHADHQ08426 723 aa20.6■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 ITPK1Q13572 414 aa20.6■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 PTGISQ16647 500 aa20.6■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa20.6■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 NOL4O94818 638 aa20.6■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa20.6■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa20.59■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa20.59■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 POTEMA6NI47 508 aa20.59■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 RAD51CO43502 376 aa20.59■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 ARID5AQ03989 594 aa20.59■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 FAM83BQ5T0W9 1011 aa20.59■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 SFMBT2Q5VUG0 894 aa20.59■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 CD302Q8IX05 232 aa20.59■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 GPATCH11Q8N954 259 aa20.59■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 PACSIN1Q9BY11 444 aa20.59■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 TMEM260Q9NX78 707 aa20.59■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 FSBPO95073 299 aa20.59■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 NAB2Q15742 525 aa20.59■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 MAATS1Q7Z4T9 603 aa20.59■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 KLHL7Q8IXQ5 586 aa20.59■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 TBC1D5Q92609 795 aa20.59■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa20.59■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 KANSL2Q9H9L4 492 aa20.59■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 C6orf50Q9HD87 102 aa20.59■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 PLAAQ9Y263 795 aa20.59■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 HPDP32754 393 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 MDH1P40925 334 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 CEP85LQ5SZL2 805 aa20.58■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 MEI1Q5TIA1 1274 aa20.58■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 KCNK18Q7Z418 384 aa20.58■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa20.58■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 DDX12PQ92771 950 aa20.58■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 CCT8L2Q96SF2 557 aa20.58■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 NUDT12Q9BQG2 462 aa20.58■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 VAT1LQ9HCJ6 419 aa20.58■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 CEP72Q9P209 647 aa20.58■□□□□ 0.89
CNIH3-201ENST00000272133 SERPING1P05155 500 aa20.58■□□□□ 0.88
CNIH3-201ENST00000272133 USP8P40818 1118 aa20.58■□□□□ 0.88
CNIH3-201ENST00000272133 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
CNIH3-201ENST00000272133 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
CNIH3-201ENST00000272133 EMC10Q5UCC4 262 aa20.58■□□□□ 0.88
CNIH3-201ENST00000272133 TXNRD3Q86VQ6 643 aa20.58■□□□□ 0.88
CNIH3-201ENST00000272133 NLRP14Q86W24 1093 aa20.58■□□□□ 0.88
CNIH3-201ENST00000272133 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
CNIH3-201ENST00000272133 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
CNIH3-201ENST00000272133 STK17AQ9UEE5 414 aa20.58■□□□□ 0.88
CNIH3-201ENST00000272133 A0A087X0T9 212 aa20.57■□□□□ 0.88
CNIH3-201ENST00000272133 FAM228BP0C875 321 aa20.57■□□□□ 0.88
CNIH3-201ENST00000272133 GNA11P29992 359 aa20.57■□□□□ 0.88
CNIH3-201ENST00000272133 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
CNIH3-201ENST00000272133 USP17L2Q6R6M4 530 aa20.57■□□□□ 0.88
CNIH3-201ENST00000272133 CCDC91Q7Z6B0 441 aa20.57■□□□□ 0.88
CNIH3-201ENST00000272133 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
CNIH3-201ENST00000272133 WHAMMQ8TF30 809 aa20.57■□□□□ 0.88
CNIH3-201ENST00000272133 CABS1Q96KC9 395 aa20.57■□□□□ 0.88
CNIH3-201ENST00000272133 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP20.57■□□□□ 0.88
CNIH3-201ENST00000272133 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
CNIH3-201ENST00000272133 EDEM3Q9BZQ6 932 aa20.57■□□□□ 0.88
CNIH3-201ENST00000272133 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa20.57■□□□□ 0.88
CNIH3-201ENST00000272133 GRID2IPA4D2P6 1211 aa20.57■□□□□ 0.88
CNIH3-201ENST00000272133 SLC37A4O43826 429 aa20.57■□□□□ 0.88
CNIH3-201ENST00000272133 SIK1P57059 783 aa20.57■□□□□ 0.88
CNIH3-201ENST00000272133 CALCRLQ16602 461 aa20.57■□□□□ 0.88
CNIH3-201ENST00000272133 KIAA0753Q2KHM9 967 aa20.57■□□□□ 0.88
CNIH3-201ENST00000272133 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
CNIH3-201ENST00000272133 MTMR9Q96QG7 549 aa20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.9 ms