RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259365.8

TMOD1-201, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,343 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-201ENST00000259365 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa14.79□□□□□ -0.04
TMOD1-201ENST00000259365 OR2W6PQ8NHA6 318 aa14.79□□□□□ -0.04
TMOD1-201ENST00000259365 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
TMOD1-201ENST00000259365 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
TMOD1-201ENST00000259365 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa14.79□□□□□ -0.04
TMOD1-201ENST00000259365 FAM153BP0C7A2 387 aa14.79□□□□□ -0.04
TMOD1-201ENST00000259365 PCP11498 1178 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF76P36508 570 aa14.79□□□□□ -0.04
TMOD1-201ENST00000259365 MAN2A1Q16706 1144 aa14.79□□□□□ -0.04
TMOD1-201ENST00000259365 FAM153CQ494X1 144 aa14.79□□□□□ -0.04
TMOD1-201ENST00000259365 PRR16Q569H4 304 aa14.79□□□□□ -0.04
TMOD1-201ENST00000259365 FAM26FQ5R3K3 315 aa14.79□□□□□ -0.04
TMOD1-201ENST00000259365 FAM196AQ6ZSG2 479 aa14.79□□□□□ -0.04
TMOD1-201ENST00000259365 GOPCQ9HD26 462 aa14.79□□□□□ -0.04
TMOD1-201ENST00000259365 FAM153AQ9UHL3 310 aa14.79□□□□□ -0.04
TMOD1-201ENST00000259365 ABCB4P21439 1286 aa14.79□□□□□ -0.04
TMOD1-201ENST00000259365 GPSM2P81274 684 aa14.79□□□□□ -0.04
TMOD1-201ENST00000259365 ECM1Q16610 540 aa14.79□□□□□ -0.04
TMOD1-201ENST00000259365 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
TMOD1-201ENST00000259365 CREG2Q8IUH2 290 aa14.79□□□□□ -0.04
TMOD1-201ENST00000259365 CCDC170Q8IYT3 715 aa14.79□□□□□ -0.04
TMOD1-201ENST00000259365 IKZF4Q9H2S9 585 aa14.79□□□□□ -0.04
TMOD1-201ENST00000259365 BCAS3Q9H6U6 928 aa14.79□□□□□ -0.04
TMOD1-201ENST00000259365 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
TMOD1-201ENST00000259365 GUCY1A3Q02108 690 aa14.78□□□□□ -0.04
TMOD1-201ENST00000259365 FAM83BQ5T0W9 1011 aa14.78□□□□□ -0.04
TMOD1-201ENST00000259365 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
TMOD1-201ENST00000259365 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
TMOD1-201ENST00000259365 SPICE1Q8N0Z3 855 aa14.78□□□□□ -0.04
TMOD1-201ENST00000259365 PSTPIP2Q9H939 334 aa14.78□□□□□ -0.04
TMOD1-201ENST00000259365 POTEFA5A3E0 1075 aa14.78□□□□□ -0.04
TMOD1-201ENST00000259365 POTEIP0CG38 1075 aa14.78□□□□□ -0.04
TMOD1-201ENST00000259365 KLRC1P26715 233 aa14.78□□□□□ -0.04
TMOD1-201ENST00000259365 USP8P40818 1118 aa14.78□□□□□ -0.04
TMOD1-201ENST00000259365 POTEGQ6S5H5 508 aa14.78□□□□□ -0.04
TMOD1-201ENST00000259365 POTEEQ6S8J3 1075 aa14.78□□□□□ -0.04
TMOD1-201ENST00000259365 CLEC4GQ6UXB4 293 aa14.78□□□□□ -0.04
TMOD1-201ENST00000259365 SH2D4AQ9H788 454 aa14.78□□□□□ -0.04
TMOD1-201ENST00000259365 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa14.78□□□□□ -0.04
TMOD1-201ENST00000259365 FAM184BQ9ULE4 1060 aa14.78□□□□□ -0.04
TMOD1-201ENST00000259365 USP54Q70EL1 1684 aa14.78□□□□□ -0.04
TMOD1-201ENST00000259365 ALS2Q96Q42 1657 aa14.78□□□□□ -0.04
TMOD1-201ENST00000259365 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
TMOD1-201ENST00000259365 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
TMOD1-201ENST00000259365 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
TMOD1-201ENST00000259365 GLI1P08151 1106 aa14.77□□□□□ -0.04
TMOD1-201ENST00000259365 CFAP221Q4G0U5 840 aa14.77□□□□□ -0.04
TMOD1-201ENST00000259365 TRAPPC3LQ5T215 181 aa14.77□□□□□ -0.04
TMOD1-201ENST00000259365 PNMA5Q96PV4 448 aa14.77□□□□□ -0.04
TMOD1-201ENST00000259365 ZMYND12Q9H0C1 365 aa14.77□□□□□ -0.04
TMOD1-201ENST00000259365 DPH5Q9H2P9 285 aa14.77□□□□□ -0.04
TMOD1-201ENST00000259365 CD209Q9NNX6 404 aa14.77□□□□□ -0.04
TMOD1-201ENST00000259365 COL18A1P39060 1754 aa14.77□□□□□ -0.04
TMOD1-201ENST00000259365 SBK1Q52WX2 424 aa14.77□□□□□ -0.04
TMOD1-201ENST00000259365 CEP85LQ5SZL2 805 aa14.77□□□□□ -0.04
TMOD1-201ENST00000259365 WDR93Q6P2C0 686 aa14.77□□□□□ -0.04
TMOD1-201ENST00000259365 GJB7Q6PEY0 223 aa14.77□□□□□ -0.04
TMOD1-201ENST00000259365 KSR1Q8IVT5 923 aa14.77□□□□□ -0.04
TMOD1-201ENST00000259365 TSGA10Q9BZW7 698 aa14.77□□□□□ -0.04
TMOD1-201ENST00000259365 STIM2Q9P246 746 aa14.77□□□□□ -0.04
TMOD1-201ENST00000259365 MYH13Q9UKX3 1938 aa14.77□□□□□ -0.05
TMOD1-201ENST00000259365 TLDC2A0PJX2 215 aa14.77□□□□□ -0.05
TMOD1-201ENST00000259365 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa14.77□□□□□ -0.05
TMOD1-201ENST00000259365 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
TMOD1-201ENST00000259365 IRAK1P51617 712 aa14.77□□□□□ -0.05
TMOD1-201ENST00000259365 SEC24CP53992 1094 aa14.77□□□□□ -0.05
TMOD1-201ENST00000259365 NNTQ13423 1086 aa14.77□□□□□ -0.05
TMOD1-201ENST00000259365 SH3GLB2Q9NR46 395 aa14.77□□□□□ -0.05
TMOD1-201ENST00000259365 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
TMOD1-201ENST00000259365 PLAGL2Q9UPG8 496 aa14.77□□□□□ -0.05
TMOD1-201ENST00000259365 A0A087X0T9 212 aa14.76□□□□□ -0.05
TMOD1-201ENST00000259365 FAM228BP0C875 321 aa14.76□□□□□ -0.05
TMOD1-201ENST00000259365 SLC9A1P19634 815 aa14.76□□□□□ -0.05
TMOD1-201ENST00000259365 TUBB4BP68371 445 aa14.76□□□□□ -0.05
TMOD1-201ENST00000259365 COASYQ13057 564 aa14.76□□□□□ -0.05
TMOD1-201ENST00000259365 GPATCH11Q8N954 259 aa14.76□□□□□ -0.05
TMOD1-201ENST00000259365 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
TMOD1-201ENST00000259365 C7orf25Q9BPX7 421 aa14.76□□□□□ -0.05
TMOD1-201ENST00000259365 USP40Q9NVE5 1235 aa14.76□□□□□ -0.05
TMOD1-201ENST00000259365 GGA1Q9UJY5 639 aa14.76□□□□□ -0.05
TMOD1-201ENST00000259365 SPEF2Q9C093 1822 aa14.76□□□□□ -0.05
TMOD1-201ENST00000259365 TUBBP07437 444 aa14.76□□□□□ -0.05
TMOD1-201ENST00000259365 COPB2P35606 906 aa14.76□□□□□ -0.05
TMOD1-201ENST00000259365 MUM1L1Q5H9M0 696 aa14.76□□□□□ -0.05
TMOD1-201ENST00000259365 UNC13DQ70J99 1090 aa14.76□□□□□ -0.05
TMOD1-201ENST00000259365 ADGRF4Q8IZF3 695 aa14.76□□□□□ -0.05
TMOD1-201ENST00000259365 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa14.76□□□□□ -0.05
TMOD1-201ENST00000259365 SLIT2O94813 1529 aa14.76□□□□□ -0.05
TMOD1-201ENST00000259365 MYH7P12883 1935 aa14.76□□□□□ -0.05
TMOD1-201ENST00000259365 AGPSO00116 658 aa14.76□□□□□ -0.05
TMOD1-201ENST00000259365 NR2F2P24468 414 aa14.76□□□□□ -0.05
TMOD1-201ENST00000259365 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
TMOD1-201ENST00000259365 RAD54LQ92698 747 aa14.76□□□□□ -0.05
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP14.76□□□□□ -0.054e-7■□□□□ 10.8
TMOD1-201ENST00000259365 AK8Q96MA6 479 aa14.76□□□□□ -0.05
TMOD1-201ENST00000259365 CCDC113Q9H0I3 377 aa14.76□□□□□ -0.05
TMOD1-201ENST00000259365 FLT1P17948 1338 aa14.75□□□□□ -0.05
TMOD1-201ENST00000259365 KIAA0754O94854 1291 aa14.75□□□□□ -0.05
TMOD1-201ENST00000259365 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
TMOD1-201ENST00000259365 ASIC2Q16515 512 aa14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms