RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622362.1

FAM200B-223, Transcript of family with sequence similarity 200 member B, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM200B, Length 4,377 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM200B-223	ENST00000622362	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		12.76	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	OR52Z1	P0C646	297 aa		12.75	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	REST	Q13127	1097 aa		12.75	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	ZC3H18	Q86VM9	953 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	ARMC2	Q8NEN0	867 aa		12.75	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		12.75	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	AP1M1	Q9BXS5	423 aa		12.75	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	WDR91	A4D1P6	747 aa		12.75	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	12.75	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	ESRRG	P62508	458 aa		12.75	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	PPARA	Q07869	468 aa		12.75	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		12.75	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	NHEJ1	Q9H9Q4	299 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	KIAA0232	Q92628	1395 aa		12.75	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	RNF8	O76064	485 aa		12.75	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	SCG2	P13521	617 aa		12.75	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	MSH2	P43246	934 aa		12.75	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	SNX1	Q13596	522 aa		12.75	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		12.75	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	AIFM3	Q96NN9	605 aa		12.75	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		12.75	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	MAD1L1	Q9Y6D9	718 aa		12.75	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	KDR	P35968	1356 aa		12.75	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	TMEM232	C9JQI7	657 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	MAP3K7	O43318	606 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	CYP2C19	P33261	490 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	BFSP1	Q12934	665 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	KCNV2	Q8TDN2	545 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	RAB20	Q9NX57	234 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	THEG	Q9P2T0	379 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	MYO1F	O00160	1098 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	CFB	P00751	764 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	INHBA	P08476	426 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	PDE6A	P16499	860 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	CA4	P22748	312 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	ST5	P78524	1137 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	TMED2	Q15363	201 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	USH1G	Q495M9	461 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	RNF34	Q969K3	372 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	GINS2	Q9Y248	185 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	PLAA	Q9Y263	795 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	ESYT3	A0FGR9	886 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	RIMBP2	O15034	1052 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	MFAP3L	O75121	409 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	TADA3	O75528	432 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	APOE	P02649	317 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	HIPK4	Q8NE63	616 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	PANK4	Q9NVE7	773 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	USP6	P35125	1406 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	MME	P08473	750 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	STRN3	Q13033	797 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	SLMAP	Q14BN4	828 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	LRRC41	Q15345	812 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	FAM47E	Q6ZV65	393 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	P2RX5	Q93086	422 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	SAT1	P21673	171 aa		12.73	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		12.73	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	PGBD1	Q96JS3	809 aa		12.73	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	12.73	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		12.73	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	KIF11	P52732	1056 aa		12.73	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	ASPH	Q12797	758 aa		12.73	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	NEK8	Q86SG6	692 aa		12.73	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		12.73	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	PNMA1	Q8ND90	353 aa		12.73	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	12.73	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	HAUS1	Q96CS2	278 aa		12.73	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	GPC4	O75487	556 aa		12.73	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	ACSL3	O95573	720 aa		12.73	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	KRT19	P08727	400 aa		12.73	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	12.73	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	SLC8A3	P57103	927 aa		12.73	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	12.73	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	MMEL1	Q495T6	779 aa		12.73	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	KRT80	Q6KB66	452 aa		12.73	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		12.73	□□□□□ -0.37
FAM200B-223	ENST00000622362	BBOF1	Q8ND07	529 aa		12.73	□□□□□ -0.37

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