RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621629.4

FAM58A-208, Transcript of Cyclin-related protein FAM58A, human

TSL 5

Gene FAM58A, Length 1,220 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM58A-208	ENST00000621629	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	33.46	■■■□□ 2.95
FAM58A-208	ENST00000621629	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		33.46	■■■□□ 2.95
FAM58A-208	ENST00000621629	CASC1	Q6TDU7	716 aa		33.46	■■■□□ 2.95
FAM58A-208	ENST00000621629	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		33.46	■■■□□ 2.95
FAM58A-208	ENST00000621629	CDX2	Q99626	313 aa	Predicted RBP	33.46	■■■□□ 2.95
FAM58A-208	ENST00000621629	SCN5A	Q14524	2016 aa		33.46	■■■□□ 2.95
FAM58A-208	ENST00000621629	DDAH1	O94760	285 aa		33.45	■■■□□ 2.95
FAM58A-208	ENST00000621629	MCM5	P33992	734 aa		33.45	■■■□□ 2.95
FAM58A-208	ENST00000621629	PGM5	Q15124	567 aa		33.45	■■■□□ 2.95
FAM58A-208	ENST00000621629	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		33.45	■■■□□ 2.95
FAM58A-208	ENST00000621629	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		33.45	■■■□□ 2.95
FAM58A-208	ENST00000621629	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		33.45	■■■□□ 2.95
FAM58A-208	ENST00000621629	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	33.44	■■■□□ 2.94
FAM58A-208	ENST00000621629	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		33.44	■■■□□ 2.94
FAM58A-208	ENST00000621629	POLR2M	P0CAP2	368 aa		33.44	■■■□□ 2.94
FAM58A-208	ENST00000621629	TRAF1	Q13077	416 aa		33.44	■■■□□ 2.94
FAM58A-208	ENST00000621629	HERVK_113	Q902F9	699 aa		33.44	■■■□□ 2.94
FAM58A-208	ENST00000621629	KAT2B	Q92831	832 aa		33.44	■■■□□ 2.94
FAM58A-208	ENST00000621629	SCLY	Q96I15	445 aa		33.44	■■■□□ 2.94
FAM58A-208	ENST00000621629	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		33.44	■■■□□ 2.94
FAM58A-208	ENST00000621629	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	33.43	■■■□□ 2.94
FAM58A-208	ENST00000621629	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		33.43	■■■□□ 2.94
FAM58A-208	ENST00000621629	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	33.43	■■■□□ 2.94
FAM58A-208	ENST00000621629	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		33.43	■■■□□ 2.94
FAM58A-208	ENST00000621629	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	33.43	■■■□□ 2.94
FAM58A-208	ENST00000621629	TMEM87B	Q96K49	555 aa		33.43	■■■□□ 2.94
FAM58A-208	ENST00000621629	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	33.43	■■■□□ 2.94
FAM58A-208	ENST00000621629	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		33.43	■■■□□ 2.94
FAM58A-208	ENST00000621629	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		33.42	■■■□□ 2.94
FAM58A-208	ENST00000621629	DNAJB2	P25686	324 aa		33.42	■■■□□ 2.94
FAM58A-208	ENST00000621629	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	33.42	■■■□□ 2.94
FAM58A-208	ENST00000621629	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		33.42	■■■□□ 2.94
FAM58A-208	ENST00000621629	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	33.42	■■■□□ 2.94
FAM58A-208	ENST00000621629	FGB	P02675	491 aa		33.41	■■■□□ 2.94
FAM58A-208	ENST00000621629	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	33.41	■■■□□ 2.94
FAM58A-208	ENST00000621629	GBF1	Q92538	1859 aa		33.4	■■■□□ 2.94
FAM58A-208	ENST00000621629	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		33.4	■■■□□ 2.94
FAM58A-208	ENST00000621629	SMARCA1	P28370	1054 aa		33.4	■■■□□ 2.94
FAM58A-208	ENST00000621629	TMTC2	Q8N394	836 aa		33.4	■■■□□ 2.94
FAM58A-208	ENST00000621629	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	33.4	■■■□□ 2.94
FAM58A-208	ENST00000621629	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		33.4	■■■□□ 2.94
FAM58A-208	ENST00000621629	EYS	Q5T1H1	3165 aa		33.4	■■■□□ 2.94
FAM58A-208	ENST00000621629	RXRA	P19793	462 aa		33.39	■■■□□ 2.94
FAM58A-208	ENST00000621629	KIF5B	P33176	963 aa		33.39	■■■□□ 2.94
FAM58A-208	ENST00000621629	PBX2	P40425	430 aa		33.39	■■■□□ 2.94
FAM58A-208	ENST00000621629	LIFR	P42702	1097 aa		33.39	■■■□□ 2.94
FAM58A-208	ENST00000621629	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		33.39	■■■□□ 2.94
FAM58A-208	ENST00000621629	TET1	Q8NFU7	2136 aa		33.39	■■■□□ 2.94
FAM58A-208	ENST00000621629	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	33.39	■■■□□ 2.94
FAM58A-208	ENST00000621629	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		33.39	■■■□□ 2.94
FAM58A-208	ENST00000621629	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		33.39	■■■□□ 2.94
FAM58A-208	ENST00000621629	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		33.38	■■■□□ 2.93
FAM58A-208	ENST00000621629	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	33.38	■■■□□ 2.93
FAM58A-208	ENST00000621629	SP2	Q02086	613 aa		33.38	■■■□□ 2.93
FAM58A-208	ENST00000621629	LAMC2	Q13753	1193 aa		33.38	■■■□□ 2.93
FAM58A-208	ENST00000621629	DGKD	Q16760	1214 aa		33.38	■■■□□ 2.93
FAM58A-208	ENST00000621629	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		33.38	■■■□□ 2.93
FAM58A-208	ENST00000621629	PPTC7	Q8NI37	304 aa		33.38	■■■□□ 2.93
FAM58A-208	ENST00000621629	MYLIP	Q8WY64	445 aa		33.38	■■■□□ 2.93
FAM58A-208	ENST00000621629	PBX4	Q9BYU1	374 aa		33.38	■■■□□ 2.93
FAM58A-208	ENST00000621629	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		33.37	■■■□□ 2.93
FAM58A-208	ENST00000621629	CCDC69	A6NI79	296 aa		33.37	■■■□□ 2.93
FAM58A-208	ENST00000621629	CCND2	P30279	289 aa		33.37	■■■□□ 2.93
FAM58A-208	ENST00000621629	CHMP4BP1	P59074	171 aa		33.37	■■■□□ 2.93
FAM58A-208	ENST00000621629	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		33.37	■■■□□ 2.93
FAM58A-208	ENST00000621629	SESTD1	Q86VW0	696 aa		33.37	■■■□□ 2.93
FAM58A-208	ENST00000621629	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		33.37	■■■□□ 2.93
FAM58A-208	ENST00000621629	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	33.37	■■■□□ 2.93
FAM58A-208	ENST00000621629	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	33.37	■■■□□ 2.93
FAM58A-208	ENST00000621629	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	33.37	■■■□□ 2.93
FAM58A-208	ENST00000621629	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		33.37	■■■□□ 2.93
FAM58A-208	ENST00000621629	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		33.37	■■■□□ 2.93
FAM58A-208	ENST00000621629	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	33.36	■■■□□ 2.93
FAM58A-208	ENST00000621629	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	33.36	■■■□□ 2.93
FAM58A-208	ENST00000621629	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	33.36	■■■□□ 2.93
FAM58A-208	ENST00000621629	TIFA	Q96CG3	184 aa		33.36	■■■□□ 2.93
FAM58A-208	ENST00000621629	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		33.35	■■■□□ 2.93
FAM58A-208	ENST00000621629	SORBS3	O60504	671 aa		33.35	■■■□□ 2.93
FAM58A-208	ENST00000621629	GNAQ	P50148	359 aa		33.35	■■■□□ 2.93
FAM58A-208	ENST00000621629	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	33.35	■■■□□ 2.93
FAM58A-208	ENST00000621629	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	33.35	■■■□□ 2.93
FAM58A-208	ENST00000621629	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		33.35	■■■□□ 2.93
FAM58A-208	ENST00000621629	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		33.34	■■■□□ 2.93
FAM58A-208	ENST00000621629	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	33.34	■■■□□ 2.93
FAM58A-208	ENST00000621629	GRIN2C	Q14957	1233 aa		33.34	■■■□□ 2.93
FAM58A-208	ENST00000621629	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		33.34	■■■□□ 2.93
FAM58A-208	ENST00000621629	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		33.34	■■■□□ 2.93
FAM58A-208	ENST00000621629	HAS3	O00219	553 aa		33.33	■■■□□ 2.93
FAM58A-208	ENST00000621629	PITPNM1	O00562	1244 aa		33.33	■■■□□ 2.93
FAM58A-208	ENST00000621629	MEIS2	O14770	477 aa		33.33	■■■□□ 2.93
FAM58A-208	ENST00000621629	GGPS1	O95749	300 aa		33.33	■■■□□ 2.93
FAM58A-208	ENST00000621629	F2	P00734	622 aa		33.33	■■■□□ 2.93
FAM58A-208	ENST00000621629	ZNF286B	P0CG31	522 aa		33.33	■■■□□ 2.93
FAM58A-208	ENST00000621629	TGFB3	P10600	412 aa		33.33	■■■□□ 2.93
FAM58A-208	ENST00000621629	PSEN2	P49810	448 aa		33.33	■■■□□ 2.93
FAM58A-208	ENST00000621629	PTGIS	Q16647	500 aa		33.33	■■■□□ 2.93
FAM58A-208	ENST00000621629	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		33.33	■■■□□ 2.93
FAM58A-208	ENST00000621629	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		33.33	■■■□□ 2.93
FAM58A-208	ENST00000621629	RASEF	Q8IZ41	740 aa		33.33	■■■□□ 2.93
FAM58A-208	ENST00000621629	ZNF576	Q9H609	170 aa		33.33	■■■□□ 2.93

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