RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621218.4

PLP1-223, Transcript of proteolipid protein 1, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PLP1, Length 3,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PLP1-223	ENST00000621218	NMT2	O60551	498 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	MYZAP	P0CAP1	466 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	EZR	P15311	586 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	KLHL7	Q8IXQ5	586 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	ESR2	Q92731	530 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	RTL9	Q8NET4	1388 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	C5orf60	A6NFR6	353 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218		F8W031	263 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	MYB	P10242	640 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	FGFR2	P21802	821 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	TRAPPC10	P48553	1259 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	PDE4D	Q08499	809 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	NDST4	Q9H3R1	872 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	10.16	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	KLRC1	P26715	233 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	CCNH	P51946	323 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	ELF3	P78545	371 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	10.15	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	CHRNA2	Q15822	529 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	VWA3B	Q502W6	1294 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	TATDN2	Q93075	761 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	CLSTN1	O94985	981 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	ATP6V1G2	O95670	118 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	SCG2	P13521	617 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	CTSW	P56202	376 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	EHHADH	Q08426	723 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	10.15	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	HVCN1	Q96D96	273 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		10.15	□□□□□ -0.79
PLP1-223	ENST00000621218	PPIP5K2	O43314	1243 aa		10.15	□□□□□ -0.79
PLP1-223	ENST00000621218	CTNNA1	P35221	906 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.79
PLP1-223	ENST00000621218	NAA25	Q14CX7	972 aa		10.15	□□□□□ -0.79
PLP1-223	ENST00000621218	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		10.15	□□□□□ -0.79
PLP1-223	ENST00000621218	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		10.15	□□□□□ -0.79
PLP1-223	ENST00000621218	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		10.15	□□□□□ -0.79
PLP1-223	ENST00000621218	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		10.15	□□□□□ -0.79
PLP1-223	ENST00000621218	RNF10	Q8N5U6	811 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.79
PLP1-223	ENST00000621218	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		10.15	□□□□□ -0.79
PLP1-223	ENST00000621218	MDM1	Q8TC05	714 aa		10.15	□□□□□ -0.79
PLP1-223	ENST00000621218	TRIM9	Q9C026	710 aa		10.15	□□□□□ -0.79
PLP1-223	ENST00000621218	NOD2	Q9HC29	1040 aa		10.15	□□□□□ -0.79
PLP1-223	ENST00000621218	TMEM59L	Q9UK28	342 aa		10.15	□□□□□ -0.79
PLP1-223	ENST00000621218	NOVA2	Q9UNW9	492 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.79
PLP1-223	ENST00000621218	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PLP1-223	ENST00000621218	BICDL2	A1A5D9	508 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PLP1-223	ENST00000621218	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PLP1-223	ENST00000621218	TLR2	O60603	784 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PLP1-223	ENST00000621218	GNAT2	P19087	354 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PLP1-223	ENST00000621218	PLCG1	P19174	1290 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PLP1-223	ENST00000621218	UBA7	P41226	1012 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PLP1-223	ENST00000621218	PPP2R2A	P63151	447 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PLP1-223	ENST00000621218	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PLP1-223	ENST00000621218	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PLP1-223	ENST00000621218	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PLP1-223	ENST00000621218	USP38	Q8NB14	1042 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PLP1-223	ENST00000621218	C3orf20	Q8ND61	904 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PLP1-223	ENST00000621218	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PLP1-223	ENST00000621218	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PLP1-223	ENST00000621218	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PLP1-223	ENST00000621218	ISCU	Q9H1K1	167 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PLP1-223	ENST00000621218	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PLP1-223	ENST00000621218	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PLP1-223	ENST00000621218	RNF14	Q9UBS8	474 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PLP1-223	ENST00000621218	DRD4	P21917	467 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PLP1-223	ENST00000621218	BRD2	P25440	801 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PLP1-223	ENST00000621218	BCAM	P50895	628 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PLP1-223	ENST00000621218	INHBE	P58166	350 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PLP1-223	ENST00000621218	MAGOH	P61326	146 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PLP1-223	ENST00000621218	ODF2	Q5BJF6	829 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PLP1-223	ENST00000621218	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PLP1-223	ENST00000621218	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	10.14	□□□□□ -0.79
PLP1-223	ENST00000621218	MAGOHB	Q96A72	148 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PLP1-223	ENST00000621218	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PLP1-223	ENST00000621218	GOLPH3	Q9H4A6	298 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PLP1-223	ENST00000621218	BAIAP2L1	Q9UHR4	511 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PLP1-223	ENST00000621218	L3MBTL1	Q9Y468	752 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PLP1-223	ENST00000621218	FLT1	P17948	1338 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PLP1-223	ENST00000621218	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PLP1-223	ENST00000621218		A0A1B0GUA9	196 aa		10.13	□□□□□ -0.79

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