RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 CFAP73A6NFT4 308 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 TOMM70O94826 608 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 RPN1P04843 607 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 SYTL2Q9HCH5 934 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 KDM5CP41229 1560 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM191CA6NGB0 347 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 H3BRJ5 948 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 MBD4O95243 580 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
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PTPRT-209ENST00000612229 E2F5Q15329 346 aa7.54□□□□□ -1.2
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PTPRT-209ENST00000612229 ARMC2Q8NEN0 867 aa7.54□□□□□ -1.2
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PTPRT-209ENST00000612229 ING2Q9H160 280 aa7.54□□□□□ -1.2
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PTPRT-209ENST00000612229 WASHC5Q12768 1159 aa7.53□□□□□ -1.2
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PTPRT-209ENST00000612229 FMO2Q99518 471 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 POLKQ9UBT6 870 aa7.53□□□□□ -1.2
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PTPRT-209ENST00000612229 AP2B1P63010 937 aa7.53□□□□□ -1.2
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PTPRT-209ENST00000612229 NNTQ13423 1086 aa7.53□□□□□ -1.2
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PTPRT-209ENST00000612229 RCN2Q14257 317 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 CHMP6Q96FZ7 201 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
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PTPRT-209ENST00000612229 IFNB1P01574 187 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 CHGBP05060 677 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 RSPH10BP0C881 870 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
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PTPRT-209ENST00000612229 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa7.53□□□□□ -1.2
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PTPRT-209ENST00000612229 MED23Q9ULK4 1368 aa7.53□□□□□ -1.2
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PTPRT-209ENST00000612229 MYSM1Q5VVJ2 828 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 HOXC8P31273 242 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 CARSP49589 748 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
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PTPRT-209ENST00000612229 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
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PTPRT-209ENST00000612229 C10orf88Q9H8K7 445 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 C1orf112Q9NSG2 853 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 PLCH2O75038 1416 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 BIRC5O15392 142 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 ME3Q16798 604 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 SBNO1A3KN83 1393 aa7.52□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 ADCY9O60503 1353 aa7.52□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 HSPA2P54652 639 aa7.52□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 PICALMQ13492 652 aa7.52□□□□□ -1.2
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PTPRT-209ENST00000612229 KRT82Q9NSB4 513 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 FANCLQ9NW38 375 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 XPOTO43592 962 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 CASP8Q14790 479 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 HDDC2Q7Z4H3 204 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 MIGA1Q8NAN2 632 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP7.52□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 CD109Q6YHK3 1445 aa7.52□□□□□ -1.21
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