RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597316.1

TRPM4-208, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily M member 4, humanhuman

TSL 3

Gene TRPM4, Length 780 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM4-208ENST00000597316 A0A0D9SFI3 127 aa20.49■□□□□ 0.87
TRPM4-208ENST00000597316 EFCAB14O75071 495 aa20.49■□□□□ 0.87
TRPM4-208ENST00000597316 GJB5O95377 273 aa20.49■□□□□ 0.87
TRPM4-208ENST00000597316 CXCL10P02778 98 aa20.49■□□□□ 0.87
TRPM4-208ENST00000597316 CKBP12277 381 aa20.49■□□□□ 0.87
TRPM4-208ENST00000597316 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
TRPM4-208ENST00000597316 DEFB103AP81534 67 aa20.49■□□□□ 0.87
TRPM4-208ENST00000597316 IKBKEQ14164 716 aa20.49■□□□□ 0.87
TRPM4-208ENST00000597316 DGKHQ86XP1 1220 aa20.49■□□□□ 0.87
TRPM4-208ENST00000597316 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
TRPM4-208ENST00000597316 GDPD5Q8WTR4 605 aa20.49■□□□□ 0.87
TRPM4-208ENST00000597316 TBC1D5Q92609 795 aa20.49■□□□□ 0.87
TRPM4-208ENST00000597316 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
TRPM4-208ENST00000597316 ESR2Q92731 530 aa20.49■□□□□ 0.87
TRPM4-208ENST00000597316 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
TRPM4-208ENST00000597316 KATNAL1Q9BW62 490 aa20.49■□□□□ 0.87
TRPM4-208ENST00000597316 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
TRPM4-208ENST00000597316 SCN5AQ14524 2016 aa20.49■□□□□ 0.87
TRPM4-208ENST00000597316 ABCB11O95342 1321 aa20.49■□□□□ 0.87
TRPM4-208ENST00000597316 GPR37L1O60883 481 aa20.48■□□□□ 0.87
TRPM4-208ENST00000597316 NBNO60934 754 aa20.48■□□□□ 0.87
TRPM4-208ENST00000597316 PDE1AP54750 535 aa20.48■□□□□ 0.87
TRPM4-208ENST00000597316 CRBNQ96SW2 442 aa20.48■□□□□ 0.87
TRPM4-208ENST00000597316 RMDN3Q96TC7 470 aa20.48■□□□□ 0.87
TRPM4-208ENST00000597316 CPVLQ9H3G5 476 aa20.48■□□□□ 0.87
TRPM4-208ENST00000597316 SUGCTQ9HAC7 445 aa20.48■□□□□ 0.87
TRPM4-208ENST00000597316 HDAC6Q9UBN7 1215 aa20.48■□□□□ 0.87
TRPM4-208ENST00000597316 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
TRPM4-208ENST00000597316 MTUS1Q9ULD2 1270 aa20.48■□□□□ 0.87
TRPM4-208ENST00000597316 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
TRPM4-208ENST00000597316 ERVK-21P61565 698 aa20.47■□□□□ 0.87
TRPM4-208ENST00000597316 PTK7Q13308 1070 aa20.47■□□□□ 0.87
TRPM4-208ENST00000597316 LAMC2Q13753 1193 aa20.47■□□□□ 0.87
TRPM4-208ENST00000597316 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
TRPM4-208ENST00000597316 ARHGEF16Q5VV41 709 aa20.47■□□□□ 0.87
TRPM4-208ENST00000597316 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
TRPM4-208ENST00000597316 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa20.47■□□□□ 0.87
TRPM4-208ENST00000597316 ALG1Q9BT22 464 aa20.47■□□□□ 0.87
TRPM4-208ENST00000597316 PSEN2P49810 448 aa20.46■□□□□ 0.87
TRPM4-208ENST00000597316 CCDC178Q5BJE1 867 aa20.46■□□□□ 0.87
TRPM4-208ENST00000597316 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
TRPM4-208ENST00000597316 ADGRF4Q8IZF3 695 aa20.46■□□□□ 0.87
TRPM4-208ENST00000597316 COL20A1Q9P218 1284 aa20.46■□□□□ 0.87
TRPM4-208ENST00000597316 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
TRPM4-208ENST00000597316 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
TRPM4-208ENST00000597316 LINC01553A4QN01 128 aa20.45■□□□□ 0.86
TRPM4-208ENST00000597316 NT5C2P49902 561 aa20.45■□□□□ 0.86
TRPM4-208ENST00000597316 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
TRPM4-208ENST00000597316 MFSD10Q14728 455 aa20.45■□□□□ 0.86
TRPM4-208ENST00000597316 KIAA0753Q2KHM9 967 aa20.45■□□□□ 0.86
TRPM4-208ENST00000597316 IQCA1Q86XH1 822 aa20.45■□□□□ 0.86
TRPM4-208ENST00000597316 TBC1D10CQ8IV04 446 aa20.45■□□□□ 0.86
TRPM4-208ENST00000597316 PNMA1Q8ND90 353 aa20.45■□□□□ 0.86
TRPM4-208ENST00000597316 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP20.45■□□□□ 0.86
TRPM4-208ENST00000597316 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
TRPM4-208ENST00000597316 KAT14Q9H8E8 782 aa20.45■□□□□ 0.86
TRPM4-208ENST00000597316 MRVI1Q9Y6F6 885 aa20.45■□□□□ 0.86
TRPM4-208ENST00000597316 CCDC171Q6TFL3 1326 aa20.45■□□□□ 0.86
TRPM4-208ENST00000597316 PI4K2BG5E9Z4 385 aa20.44■□□□□ 0.86
TRPM4-208ENST00000597316 ZNF213O14771 459 aa20.44■□□□□ 0.86
TRPM4-208ENST00000597316 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
TRPM4-208ENST00000597316 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
TRPM4-208ENST00000597316 TCTN1Q2MV58 587 aa20.44■□□□□ 0.86
TRPM4-208ENST00000597316 ZNF618Q5T7W0 954 aa20.44■□□□□ 0.86
TRPM4-208ENST00000597316 FAM117BQ6P1L5 589 aa20.44■□□□□ 0.86
TRPM4-208ENST00000597316 FBXO11Q86XK2 927 aa20.44■□□□□ 0.86
TRPM4-208ENST00000597316 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
TRPM4-208ENST00000597316 PPTC7Q8NI37 304 aa20.44■□□□□ 0.86
TRPM4-208ENST00000597316 INSL6Q9Y581 213 aa20.44■□□□□ 0.86
TRPM4-208ENST00000597316 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa20.43■□□□□ 0.86
TRPM4-208ENST00000597316 HAS3O00219 553 aa20.43■□□□□ 0.86
TRPM4-208ENST00000597316 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
TRPM4-208ENST00000597316 PPFIA4O75335 1185 aa20.43■□□□□ 0.86
TRPM4-208ENST00000597316 F2P00734 622 aa20.43■□□□□ 0.86
TRPM4-208ENST00000597316 NR3C2P08235 984 aa20.43■□□□□ 0.86
TRPM4-208ENST00000597316 QRICH1Q2TAL8 776 aa20.43■□□□□ 0.86
TRPM4-208ENST00000597316 ASPRV1Q53RT3 343 aa20.43■□□□□ 0.86
TRPM4-208ENST00000597316 TET1Q8NFU7 2136 aa20.43■□□□□ 0.86
TRPM4-208ENST00000597316 VAT1LQ9HCJ6 419 aa20.43■□□□□ 0.86
TRPM4-208ENST00000597316 CD320Q9NPF0 282 aa20.43■□□□□ 0.86
TRPM4-208ENST00000597316 C11orf16Q9NQ32 467 aa20.43■□□□□ 0.86
TRPM4-208ENST00000597316 LGR5O75473 907 aa20.42■□□□□ 0.86
TRPM4-208ENST00000597316 CFBP00751 764 aa20.42■□□□□ 0.86
TRPM4-208ENST00000597316 ZNF286BP0CG31 522 aa20.42■□□□□ 0.86
TRPM4-208ENST00000597316 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
TRPM4-208ENST00000597316 LEXMQ3ZCV2 418 aa20.42■□□□□ 0.86
TRPM4-208ENST00000597316 TRAF7Q6Q0C0 670 aa20.42■□□□□ 0.86
TRPM4-208ENST00000597316 ANKS1AQ92625 1134 aa20.42■□□□□ 0.86
TRPM4-208ENST00000597316 PXMP2Q9NR77 195 aa20.42■□□□□ 0.86
TRPM4-208ENST00000597316 NEDD4P46934 1319 aa20.42■□□□□ 0.86
TRPM4-208ENST00000597316 FAM86C2PA6NEL3 165 aa20.41■□□□□ 0.86
TRPM4-208ENST00000597316 KDM4AO75164 1064 aa20.41■□□□□ 0.86
TRPM4-208ENST00000597316 KCNA5P22460 613 aa20.41■□□□□ 0.86
TRPM4-208ENST00000597316 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
TRPM4-208ENST00000597316 FAM178BQ8IXR5 827 aa20.41■□□□□ 0.86
TRPM4-208ENST00000597316 GJD3Q8N144 294 aa20.41■□□□□ 0.86
TRPM4-208ENST00000597316 FBXO22Q8NEZ5 403 aa20.41■□□□□ 0.86
TRPM4-208ENST00000597316 RILPL2Q969X0 211 aa20.41■□□□□ 0.86
TRPM4-208ENST00000597316 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
TRPM4-208ENST00000597316 JMJD4Q9H9V9 463 aa20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms