RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592582.5

SEH1L-210, Transcript of SEH1 like nucleoporin, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SEH1L, Length 4,072 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1L-210ENST00000592582 A0A087WWV3 80 aa6.59□□□□□ -1.35
SEH1L-210ENST00000592582 A0A0G2JLW4 131 aa6.59□□□□□ -1.35
SEH1L-210ENST00000592582 LRRD1A4D1F6 860 aa6.59□□□□□ -1.35
SEH1L-210ENST00000592582 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SEH1L-210ENST00000592582 SMIM24O75264 130 aa6.59□□□□□ -1.35
SEH1L-210ENST00000592582 KIF4AO95239 1232 aa6.59□□□□□ -1.35
SEH1L-210ENST00000592582 TRAPPC10P48553 1259 aa6.59□□□□□ -1.35
SEH1L-210ENST00000592582 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SEH1L-210ENST00000592582 PSMD2Q13200 908 aa6.59□□□□□ -1.35
SEH1L-210ENST00000592582 POSTNQ15063 836 aa6.59□□□□□ -1.35
SEH1L-210ENST00000592582 SLC30A9Q6PML9 568 aa6.59□□□□□ -1.35
SEH1L-210ENST00000592582 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SEH1L-210ENST00000592582 KAT2BQ92831 832 aa6.59□□□□□ -1.35
SEH1L-210ENST00000592582 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa6.59□□□□□ -1.35
SEH1L-210ENST00000592582 ALS2CR12Q96Q35 445 aa6.59□□□□□ -1.35
SEH1L-210ENST00000592582 TSC22D3Q99576 134 aa6.59□□□□□ -1.35
SEH1L-210ENST00000592582 MYL10Q9BUA6 226 aa6.59□□□□□ -1.35
SEH1L-210ENST00000592582 SLC40A1Q9NP59 571 aa6.59□□□□□ -1.35
SEH1L-210ENST00000592582 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SEH1L-210ENST00000592582 N4BP3O15049 544 aa6.59□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 PTPREP23469 700 aa6.59□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 CCDC122Q5T0U0 273 aa6.59□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 EMBQ6PCB8 327 aa6.59□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 ZNF804AQ7Z570 1209 aa6.59□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 IFT20Q8IY31 132 aa6.59□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 MAGEC3Q8TD91 643 aa6.59□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 STK32AQ8WU08 396 aa6.59□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 LZTS2Q9BRK4 669 aa6.59□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 EPN3Q9H201 632 aa6.59□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 SUGCTQ9HAC7 445 aa6.59□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 KIF9Q9HAQ2 790 aa6.59□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 CABP5Q9NP86 173 aa6.59□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 BTBD18B2RXH4 712 aa6.58□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 TACC1O75410 805 aa6.58□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 CDC27P30260 824 aa6.58□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 ATP1A2P50993 1020 aa6.58□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 GOLGA8FQ08AF8 430 aa6.58□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa6.58□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 PPP1R7Q15435 360 aa6.58□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa6.58□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 KIFC2Q96AC6 838 aa6.58□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 IFT74Q96LB3 600 aa6.58□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa6.58□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 VCXQ9H320 206 aa6.58□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa6.58□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 TUBE1Q9UJT0 475 aa6.58□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 GGA2Q9UJY4 613 aa6.58□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 RFC4P35249 363 aa6.58□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 GYG1P46976 350 aa6.58□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 ATP11AP98196 1134 aa6.58□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 PDCLQ13371 301 aa6.58□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 SLC10A5Q5PT55 438 aa6.58□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 SOGA3Q5TF21 947 aa6.58□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 RUFY4Q6ZNE9 571 aa6.58□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 DTNBP1Q96EV8 351 aa6.58□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 SLC4A9Q96Q91 983 aa6.58□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 HINFPQ9BQA5 517 aa6.58□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa6.58□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa6.58□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa6.58□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa6.58□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa6.58□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 KIF28PB7ZC32 967 aa6.58□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 PRKAB2O43741 272 aa6.58□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 LDHBP07195 334 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 PAK2Q13177 524 aa6.58□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 DBN1Q16643 649 aa6.58□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 ERFEQ4G0M1 354 aa6.58□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 GALNT17Q6IS24 598 aa6.58□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 CYB5D1Q6P9G0 228 aa6.58□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 CCDC13Q8IYE1 715 aa6.58□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 CCDC63Q8NA47 563 aa6.58□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 CCDC26Q8TAB7 109 aa6.58□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 PSMD1Q99460 953 aa6.58□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 TSGA10Q9BZW7 698 aa6.58□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 LEMD3Q9Y2U8 911 aa6.58□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 V9GY48 417 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 ORC4O43929 436 aa6.57□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 RPS6KA4O75676 772 aa6.57□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
SEH1L-210ENST00000592582 MXRA7P84157 204 aa6.57□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms