RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-212ENST00000591041 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-212ENST00000591041 B4DLN1 442 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-212ENST00000591041 STAT3P40763 770 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-212ENST00000591041 BPIFA3Q9BQP9 254 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF408Q9H9D4 720 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-212ENST00000591041 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-212ENST00000591041 OTOFQ9HC10 1997 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-212ENST00000591041 IRF6O14896 467 aa25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-212ENST00000591041 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC173Q0VFZ6 552 aa25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-212ENST00000591041 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-212ENST00000591041 CLEC4DQ8WXI8 215 aa25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-212ENST00000591041 PAGE5Q96GU1 130 aa25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-212ENST00000591041 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-212ENST00000591041 KCNMB3Q9NPA1 279 aa25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-212ENST00000591041 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 PNOCQ13519 176 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 CEP55Q53EZ4 464 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 NT5DC1Q5TFE4 455 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 LBX2Q6XYB7 198 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 USP49Q70CQ1 688 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 MLKLQ8NB16 471 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 SNX29Q8TEQ0 813 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 WDR11Q9BZH6 1224 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 HOMER2Q9NSB8 354 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 MYH7BA7E2Y1 1941 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC25A27O95847 323 aa25.44■■□□□ 1.66
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CAPNS1-212ENST00000591041 POTEJP0CG39 1038 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 CETPP11597 493 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 PLS1Q14651 629 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 KARSQ15046 597 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 PLA2G4DQ86XP0 818 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 REPS2Q8NFH8 660 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 DNAJC25Q9H1X3 360 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 LOC285556D6RIA3 1793 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 PFASO15067 1338 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 STAM2O75886 525 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 BCRP11274 1271 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 GTF2A2P52657 109 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 DGKZQ13574 1117 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 E2F4Q16254 413 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 ARHGEF16Q5VV41 709 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 PCNX4Q63HM2 1172 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 NSMFQ6X4W1 530 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 CLMNQ96JQ2 1002 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 RPTORQ8N122 1335 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 NFIBO00712 420 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 AFMP43652 599 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 SV2BQ7L1I2 683 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 HAS1Q92839 578 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 CCND2P30279 289 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 PPP1R2P41236 205 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 RPS6P62753 249 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM132BQ14DG7 1078 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 PDXDC2PQ6P474 469 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 ETNPPLQ8TBG4 499 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 MXRA8Q9BRK3 442 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 CBX8Q9HC52 389 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 PARP14Q460N5 1801 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 FRMPD4Q14CM0 1322 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 FOXN1O15353 648 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 PLCG1P19174 1290 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 MUTP22033 750 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 DLK2Q6UY11 383 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 NLRX1Q86UT6 975 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 RIOX2Q8IUF8 465 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 CDHR1Q96JP9 859 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 RMDN3Q96TC7 470 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 RIT2Q99578 217 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 MEIS1O00470 390 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 BIN1O00499 593 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 MAFGO15525 162 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 STIM1Q13586 685 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 MUM1L1Q5H9M0 696 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 TREML2Q5T2D2 321 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 MOB2Q70IA6 237 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 SPATA20Q8TB22 786 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 TBC1D5Q92609 795 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF577Q9BSK1 485 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 TEKT3Q9BXF9 490 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A087X0B3 334 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM86B1E9PN63 330 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 MSH4O15457 936 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 EDIL3O43854 480 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-212ENST00000591041 GAS7O60861 476 aa25.38■■□□□ 1.65
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