RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583667.1

GGA3-217, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 4

Gene GGA3, Length 531 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-217	ENST00000583667	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	KBTBD13	C9JR72	458 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	KIAA0355	O15063	1070 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	SPTLC2	O15270	562 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	NDUFB10	O96000	172 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	RAG1	P15918	1043 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	GNA11	P29992	359 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	SLC1A4	P43007	532 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	NHLH1	Q02575	133 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	BLID	Q8IZY5	108 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	OXER1	Q8TDS5	423 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	FERMT2	Q96AC1	680 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	CLIC4	Q9Y696	253 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	DOCK1	Q14185	1865 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	FSD2	A1L4K1	749 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	ZBTB5	O15062	677 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	TLL1	O43897	1013 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	CLTB	P09497	229 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	BMP3	P12645	472 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	HERVK_113	P62684	666 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	ERVK-9	P63128	1117 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	ERVK-24	P63145	666 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	TRAF1	Q13077	416 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	NR5A1	Q13285	461 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	STK38	Q15208	465 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	BICD2	Q8TD16	824 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	PIGS	Q96S52	555 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	C6orf50	Q9HD87	102 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	MYO9B	Q13459	2157 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	CMA1	P23946	247 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	CYP2C19	P33261	490 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	ATP2B2	Q01814	1243 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	WDR18	Q9BV38	432 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	VCPKMT	Q9H867	229 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	GOPC	Q9HD26	462 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	MYH4	Q9Y623	1939 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	PRR33	A8MZF0	331 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	CUTA	O60888	179 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	IGHA2	P01877	340 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	CCDC96	Q2M329	555 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	RASIP1	Q5U651	963 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	MCTP2	Q6DN12	878 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	ACER1	Q8TDN7	264 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	SMCO2	A6NFE2	343 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	CYBA	P13498	195 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	LIG1	P18858	919 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	PTPRE	P23469	700 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	ME1	P48163	572 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	NAPA	P54920	295 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	KCTD1	Q719H9	257 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	HERVK_113	Q902F9	699 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	CPVL	Q9H3G5	476 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-217	ENST00000583667	MTMR7	Q9Y216	660 aa		13.59	□□□□□ -0.23

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