RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 REC114Q7Z4M0 266 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
PTPRM-204ENST00000577468 JAMLQ86YT9 394 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRM-204ENST00000577468 DRC7Q8IY82 874 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRM-204ENST00000577468 CHST13Q8NET6 341 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRM-204ENST00000577468 FAM210AQ96ND0 272 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRM-204ENST00000577468 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
PTPRM-204ENST00000577468 PDLIM7Q9NR12 457 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRM-204ENST00000577468 AP5S1Q9NUS5 200 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRM-204ENST00000577468 GMIPQ9P107 970 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRM-204ENST00000577468 NTMQ9P121 344 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRM-204ENST00000577468 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
PTPRM-204ENST00000577468 SMC3Q9UQE7 1217 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRM-204ENST00000577468 SCINQ9Y6U3 715 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRM-204ENST00000577468 VGLL3A8MV65 326 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 F8W031 263 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 FZD7O75084 574 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 HMMRO75330 724 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 CLEC3AO75596 197 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 ASGR2P07307 311 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 MAN1A1P33908 653 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 CTSKP43235 329 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 CDCP2Q5VXM1 449 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 BICRALQ6AI39 1079 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 CCDC174Q6PII3 467 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 CRIP3Q6Q6R5 217 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 TTLL7Q6ZT98 887 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 TTC30BQ8N4P2 665 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 NAT16Q8N8M0 369 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 GIPC2Q8TF65 315 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 ITFG2Q969R8 447 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 RHOVQ96L33 236 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 MINPP1Q9UNW1 487 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 USP31Q70CQ4 1352 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 GSNP06396 782 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 CD53P19397 219 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 FLT3P36888 993 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 CORO7P57737 925 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 EVA1CP58658 441 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 KIAA2012Q0VF49 1180 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 PWP1Q13610 501 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 PLEKHG6Q3KR16 790 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 CCDC184Q52MB2 194 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 RTP2Q5QGT7 225 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 RELL1Q8IUW5 271 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 ZFPM1Q8IX07 1006 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 Q8N1X5 172 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 NLGN2Q8NFZ4 835 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 RSPH1Q8WYR4 309 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 CFAP53Q96M91 514 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM74Q96NL1 305 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 BRINP2Q9C0B6 783 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 IFT122Q9HBG6 1241 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 SPC25Q9HBM1 224 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 GFOD1Q9NXC2 390 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 ROBO2Q9HCK4 1378 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 MEIS1O00470 390 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 TIMM44O43615 452 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 PRC1O43663 620 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 ATE1O95260 518 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 S100BP04271 92 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 CASQ1P31415 396 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 SNAP47Q5SQN1 464 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 CYP2R1Q6VVX0 501 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 SPRED1Q7Z699 444 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 ZSCAN30Q86W11 494 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 NT5DC4Q86YG4 428 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 HSCBQ8IWL3 235 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 LGI4Q8N135 537 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 CPA5Q8WXQ8 436 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 ALG3Q92685 438 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 MAP7D2Q96T17 732 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 RSRP1Q9BUV0 290 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 CXorf56Q9H5V9 222 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 CNNM2Q9H8M5 875 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-204ENST00000577468 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa3.69□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms