RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565324.5

SMG1-211, Transcript of SMG1, nonsense mediated mRNA decay associated PI3K related kinase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SMG1, Length 12,465 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1-211ENST00000565324 DAB2P98082 770 aa5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 CHST3Q7LGC8 479 aa5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 DCDC2Q9UHG0 476 aa5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 MYO1CO00159 1063 aa5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 GAS7O60861 476 aa5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 CASP8Q14790 479 aa5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 TPTE2Q6XPS3 522 aa5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 ARHGEF25Q86VW2 580 aa5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 TEX2Q8IWB9 1127 aa5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 C19orf60Q96EN9 201 aa5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 TRPM2O94759 1503 aa5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 DR1Q01658 176 aa5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 MAPRE2Q15555 327 aa5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 TRIM67Q6ZTA4 783 aa5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 HORMAD1Q86X24 394 aa5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 SMYD2Q9NRG4 433 aa5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 GID8Q9NWU2 228 aa5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 RGS12O14924 1447 aa5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 FOXP2O15409 715 aa5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 KRT38O76015 456 aa5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 GAP43P17677 238 aa5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 SERPINB1P30740 379 aa5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 TRAPPC10P48553 1259 aa5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 E2F4Q16254 413 aa5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 LZICQ8WZA0 190 aa5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 DYDC2Q96IM9 177 aa5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 ADPGKQ9BRR6 497 aa5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 ZNF711Q9Y462 761 aa5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 ABCC12Q96J65 1359 aa5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 H7C0C1 242 aa5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 SGSM2O43147 1006 aa5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 ATP5OP48047 213 aa5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 NNTQ13423 1086 aa5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 SPOPLQ6IQ16 392 aa5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 EPAS1Q99814 870 aa5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 SLC5A4Q9NY91 659 aa5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 FLT4P35916 1363 aa5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 ZMYM6O95789 1325 aa5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 WDR47O94967 919 aa5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 SLC30A9Q6PML9 568 aa5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 JDP2Q8WYK2 163 aa5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 NCLNQ969V3 563 aa5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 CNBD2Q96M20 576 aa5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 EPB41L5Q9HCM4 733 aa5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 WDR7Q9Y4E6 1490 aa5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 CMA1P23946 247 aa5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 DDIT3P35638 169 aa5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 BLVRAP53004 296 aa5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 SP4Q02446 784 aa5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 KIF19Q2TAC6 998 aa5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 NUGGCQ68CJ6 796 aa5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 NCAPG2Q86XI2 1143 aa5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 DTX3LQ8TDB6 740 aa5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 XAGE3Q8WTP9 111 aa5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 SH3GL2Q99962 352 aa5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 TRPV6Q9H1D0 765 aa5.49□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa5.48□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 XPOTO43592 962 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 CCDC22O60826 627 aa5.48□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 RANBP1P43487 201 aa5.48□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 LIG4P49917 911 aa5.48□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 CYP2J2P51589 502 aa5.48□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 EHHADHQ08426 723 aa5.48□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 SLC44A4Q53GD3 710 aa5.48□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 TRAF7Q6Q0C0 670 aa5.48□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 MAML3Q96JK9 1138 aa5.48□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 DESI2Q9BSY9 194 aa5.48□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 TMEM245Q9H330 911 aa5.48□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 STRIP2Q9ULQ0 834 aa5.48□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 PTPN22Q9Y2R2 807 aa5.48□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 SPDYE2BA6NHP3 402 aa5.48□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 ADCY3O60266 1144 aa5.48□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 TOM1L1O75674 476 aa5.48□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 SPDYE6P0CI01 402 aa5.48□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 CUL3Q13618 768 aa5.48□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 ALCAMQ13740 583 aa5.48□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 TUBGCP3Q96CW5 907 aa5.48□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 EHD2Q9NZN4 543 aa5.48□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 SNX14Q9Y5W7 946 aa5.48□□□□□ -1.53
SMG1-211ENST00000565324 BUB1O43683 1085 aa5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.2 ms