RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560962.5

USP3-AS1-208, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 1,807 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-208ENST00000560962 PLCG1P19174 1290 aa20.07■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 MORC3Q14149 939 aa20.07■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMEM132BQ14DG7 1078 aa20.07■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 MUM1L1Q5H9M0 696 aa20.07■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 LRRC15Q8TF66 581 aa20.07■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 BPIFA3Q9BQP9 254 aa20.07■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 RAB34Q9BZG1 259 aa20.07■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF408Q9H9D4 720 aa20.07■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF76P36508 570 aa20.06■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 CUL4BQ13620 913 aa20.06■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 PDIA5Q14554 519 aa20.06■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 GADL1Q6ZQY3 521 aa20.06■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 TRERF1Q96PN7 1200 aa20.06■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 KCNMB3Q9NPA1 279 aa20.06■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 NMRK2Q9NPI5 230 aa20.06■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 HOMER2Q9NSB8 354 aa20.06■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 PCDHA12Q9UN75 941 aa20.06■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM86B1E9PN63 330 aa20.06■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM86B2P0C5J1 330 aa20.06■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 UBXN2AP68543 259 aa20.06■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLC10A4Q96EP9 437 aa20.06■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 CALML4Q96GE6 196 aa20.06■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 TEX13BQ9BXU2 312 aa20.06■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 RIPK3Q9Y572 518 aa20.06■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 TBX3O15119 743 aa20.05■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 MOGSQ13724 837 aa20.05■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 TRIML1Q8N9V2 468 aa20.05■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 CYP2W1Q8TAV3 490 aa20.05■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 LENG9Q96B70 501 aa20.05■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 RNF146Q9NTX7 359 aa20.05■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa20.05■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa20.05■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 GJA5P36382 358 aa20.04■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 TKFCQ3LXA3 575 aa20.04■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 LBX2Q6XYB7 198 aa20.04■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 NUDT12Q9BQG2 462 aa20.04■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 MAF1Q9H063 256 aa20.04■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 COL20A1Q9P218 1284 aa20.04■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 RPTORQ8N122 1335 aa20.04■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 GRB10Q13322 594 aa20.04■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 KRT79Q5XKE5 535 aa20.04■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLFN12Q8IYM2 578 aa20.04■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 MB21D1Q8N884 522 aa20.04■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 ETNPPLQ8TBG4 499 aa20.04■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 SNX29Q8TEQ0 813 aa20.04■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 PNMA5Q96PV4 448 aa20.04■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 GSDMAQ96QA5 445 aa20.04■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 FRMPD4Q14CM0 1322 aa20.03■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 A0A0G2JMZ2 1700 aa20.03■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa20.03■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 SMTNL1A8MU46 457 aa20.03■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 RPS6P62753 249 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 MLKLQ8NB16 471 aa20.03■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa20.03■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 TRIM5Q9C035 493 aa20.03■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 STAT3P40763 770 aa20.02■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 SNAPC2Q13487 334 aa20.02■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 NCAPHQ15003 741 aa20.02■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 POTEEQ6S8J3 1075 aa20.02■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 RNF207Q6ZRF8 634 aa20.02■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM20AQ96MK3 541 aa20.02■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 CUEDC2Q9H467 287 aa20.02■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 KBTBD4Q9NVX7 518 aa20.02■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 MSH4O15457 936 aa20.02■□□□□ 0.79
USP3-AS1-208ENST00000560962 CELF2O95319 508 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.79
USP3-AS1-208ENST00000560962 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.79
USP3-AS1-208ENST00000560962 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.79
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLC30A10Q6XR72 485 aa20.02■□□□□ 0.79
USP3-AS1-208ENST00000560962 C2orf69Q8N8R5 385 aa20.02■□□□□ 0.79
USP3-AS1-208ENST00000560962 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.79
USP3-AS1-208ENST00000560962 RPN1P04843 607 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
USP3-AS1-208ENST00000560962 PTMAP06454 111 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
USP3-AS1-208ENST00000560962 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP20.01■□□□□ 0.79
USP3-AS1-208ENST00000560962 DACH1Q9UI36 760 aa20.01■□□□□ 0.79
USP3-AS1-208ENST00000560962 IKBKBO14920 756 aa20■□□□□ 0.79
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF75DP51815 510 aa20■□□□□ 0.79
USP3-AS1-208ENST00000560962 MYL5Q02045 173 aa20■□□□□ 0.79
USP3-AS1-208ENST00000560962 PLS1Q14651 629 aa20■□□□□ 0.79
USP3-AS1-208ENST00000560962 ECM1Q16610 540 aa20■□□□□ 0.79
USP3-AS1-208ENST00000560962 CEP55Q53EZ4 464 aa20■□□□□ 0.79
USP3-AS1-208ENST00000560962 GPAT2Q6NUI2 795 aa20■□□□□ 0.79
USP3-AS1-208ENST00000560962 NSMFQ6X4W1 530 aa20■□□□□ 0.79
USP3-AS1-208ENST00000560962 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
USP3-AS1-208ENST00000560962 ACAD9Q9H845 621 aa20■□□□□ 0.79
USP3-AS1-208ENST00000560962 MAGEF1Q9HAY2 307 aa20■□□□□ 0.79
USP3-AS1-208ENST00000560962 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa20■□□□□ 0.79
USP3-AS1-208ENST00000560962 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
USP3-AS1-208ENST00000560962 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
USP3-AS1-208ENST00000560962 HERVK_113P62684 666 aa19.99■□□□□ 0.79
USP3-AS1-208ENST00000560962 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms