RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552897.5

TPCN1-222, Transcript of two pore segment channel 1, human

TSL 4

Gene TPCN1, Length 596 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPCN1-222	ENST00000552897	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
TPCN1-222	ENST00000552897	ADCY7	P51828	1080 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TPCN1-222	ENST00000552897	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
TPCN1-222	ENST00000552897	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
TPCN1-222	ENST00000552897	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TPCN1-222	ENST00000552897	DPF3	Q92784	378 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TPCN1-222	ENST00000552897	HTATIP2	Q9BUP3	242 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TPCN1-222	ENST00000552897	TMEM260	Q9NX78	707 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TPCN1-222	ENST00000552897	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TPCN1-222	ENST00000552897		Q9Y3F1	56 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TPCN1-222	ENST00000552897	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TPCN1-222	ENST00000552897	ALPK3	Q96L96	1907 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TPCN1-222	ENST00000552897	CCND2	P30279	289 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TPCN1-222	ENST00000552897	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
TPCN1-222	ENST00000552897	ST3GAL1	Q11201	340 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TPCN1-222	ENST00000552897	LY6K	Q17RY6	165 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TPCN1-222	ENST00000552897	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TPCN1-222	ENST00000552897	PGBD1	Q96JS3	809 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TPCN1-222	ENST00000552897	AIFM3	Q96NN9	605 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TPCN1-222	ENST00000552897	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
TPCN1-222	ENST00000552897	BACH2	Q9BYV9	841 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TPCN1-222	ENST00000552897	ACLY	P53396	1101 aa		27.76	■■■□□ 2.03
TPCN1-222	ENST00000552897	TTLL4	Q14679	1199 aa		27.76	■■■□□ 2.03
TPCN1-222	ENST00000552897	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		27.76	■■■□□ 2.03
TPCN1-222	ENST00000552897	SPC25	Q9HBM1	224 aa		27.76	■■■□□ 2.03
TPCN1-222	ENST00000552897	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		27.76	■■■□□ 2.03
TPCN1-222	ENST00000552897	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		27.76	■■■□□ 2.03
TPCN1-222	ENST00000552897	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	27.76	■■■□□ 2.03
TPCN1-222	ENST00000552897	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	27.75	■■■□□ 2.03
TPCN1-222	ENST00000552897	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	27.75	■■■□□ 2.03
TPCN1-222	ENST00000552897	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		27.75	■■■□□ 2.03
TPCN1-222	ENST00000552897	GTF3C6	Q969F1	213 aa		27.75	■■■□□ 2.03
TPCN1-222	ENST00000552897	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		27.75	■■■□□ 2.03
TPCN1-222	ENST00000552897		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	27.74	■■■□□ 2.03
TPCN1-222	ENST00000552897		A0A1W2PQY0	241 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TPCN1-222	ENST00000552897	ESYT2	A0FGR8	921 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TPCN1-222	ENST00000552897	ASGR1	P07306	291 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TPCN1-222	ENST00000552897	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TPCN1-222	ENST00000552897	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	27.74	■■■□□ 2.03
TPCN1-222	ENST00000552897	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TPCN1-222	ENST00000552897	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TPCN1-222	ENST00000552897	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TPCN1-222	ENST00000552897	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TPCN1-222	ENST00000552897	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		27.73	■■■□□ 2.03
TPCN1-222	ENST00000552897	DEXI	O95424	95 aa		27.73	■■■□□ 2.03
TPCN1-222	ENST00000552897	SP2	Q02086	613 aa		27.73	■■■□□ 2.03
TPCN1-222	ENST00000552897	SEMA3F	Q13275	785 aa		27.73	■■■□□ 2.03
TPCN1-222	ENST00000552897	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	27.73	■■■□□ 2.03
TPCN1-222	ENST00000552897	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		27.73	■■■□□ 2.03
TPCN1-222	ENST00000552897	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		27.73	■■■□□ 2.03
TPCN1-222	ENST00000552897	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		27.72	■■■□□ 2.03
TPCN1-222	ENST00000552897	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	27.72	■■■□□ 2.03
TPCN1-222	ENST00000552897	ARHGAP1	Q07960	439 aa		27.72	■■■□□ 2.03
TPCN1-222	ENST00000552897	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		27.72	■■■□□ 2.03
TPCN1-222	ENST00000552897	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	27.72	■■■□□ 2.03
TPCN1-222	ENST00000552897	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	27.72	■■■□□ 2.03
TPCN1-222	ENST00000552897	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		27.72	■■■□□ 2.03
TPCN1-222	ENST00000552897	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		27.72	■■■□□ 2.03
TPCN1-222	ENST00000552897	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		27.72	■■■□□ 2.03
TPCN1-222	ENST00000552897	EVI5	O60447	810 aa		27.71	■■■□□ 2.03
TPCN1-222	ENST00000552897	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	27.71	■■■□□ 2.03
TPCN1-222	ENST00000552897	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		27.71	■■■□□ 2.03
TPCN1-222	ENST00000552897	ANO3	Q9BYT9	981 aa		27.71	■■■□□ 2.03
TPCN1-222	ENST00000552897	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		27.71	■■■□□ 2.03
TPCN1-222	ENST00000552897	C6orf50	Q9HD87	102 aa		27.71	■■■□□ 2.03
TPCN1-222	ENST00000552897	CEP290	O15078	2479 aa		27.7	■■■□□ 2.03
TPCN1-222	ENST00000552897	CDKL5	O76039	1030 aa		27.7	■■■□□ 2.02
TPCN1-222	ENST00000552897	SNX17	Q15036	470 aa		27.7	■■■□□ 2.02
TPCN1-222	ENST00000552897	RABEP1	Q15276	862 aa		27.7	■■■□□ 2.02
TPCN1-222	ENST00000552897	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		27.7	■■■□□ 2.02
TPCN1-222	ENST00000552897	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		27.7	■■■□□ 2.02
TPCN1-222	ENST00000552897	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		27.7	■■■□□ 2.02
TPCN1-222	ENST00000552897	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		27.7	■■■□□ 2.02
TPCN1-222	ENST00000552897	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	27.7	■■■□□ 2.02
TPCN1-222	ENST00000552897	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		27.7	■■■□□ 2.02
TPCN1-222	ENST00000552897	STK36	Q9NRP7	1315 aa		27.69	■■■□□ 2.02
TPCN1-222	ENST00000552897	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		27.69	■■■□□ 2.02
TPCN1-222	ENST00000552897	SORBS3	O60504	671 aa		27.69	■■■□□ 2.02
TPCN1-222	ENST00000552897	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
TPCN1-222	ENST00000552897	GH1	P01241	217 aa		27.69	■■■□□ 2.02
TPCN1-222	ENST00000552897	ITGB5	P18084	799 aa		27.69	■■■□□ 2.02
TPCN1-222	ENST00000552897	ICAM3	P32942	547 aa		27.69	■■■□□ 2.02
TPCN1-222	ENST00000552897	RTP1	P59025	263 aa		27.69	■■■□□ 2.02
TPCN1-222	ENST00000552897	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	27.69	■■■□□ 2.02
TPCN1-222	ENST00000552897	AFG1L	Q8WV93	481 aa		27.69	■■■□□ 2.02
TPCN1-222	ENST00000552897	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		27.69	■■■□□ 2.02
TPCN1-222	ENST00000552897	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		27.69	■■■□□ 2.02
TPCN1-222	ENST00000552897		A6NJR5	290 aa		27.68	■■■□□ 2.02
TPCN1-222	ENST00000552897		H0YGN5	161 aa		27.68	■■■□□ 2.02
TPCN1-222	ENST00000552897	JAK2	O60674	1132 aa		27.68	■■■□□ 2.02
TPCN1-222	ENST00000552897	STAM2	O75886	525 aa		27.68	■■■□□ 2.02
TPCN1-222	ENST00000552897	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	27.68	■■■□□ 2.02
TPCN1-222	ENST00000552897	AP3B2	Q13367	1082 aa		27.68	■■■□□ 2.02
TPCN1-222	ENST00000552897	NPY5R	Q15761	445 aa		27.68	■■■□□ 2.02
TPCN1-222	ENST00000552897	TRIM60	Q495X7	471 aa		27.68	■■■□□ 2.02
TPCN1-222	ENST00000552897	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		27.68	■■■□□ 2.02
TPCN1-222	ENST00000552897	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	27.68	■■■□□ 2.02
TPCN1-222	ENST00000552897	GNA11	P29992	359 aa		27.67	■■■□□ 2.02
TPCN1-222	ENST00000552897	NLRP5	P59047	1200 aa		27.67	■■■□□ 2.02
TPCN1-222	ENST00000552897	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		27.67	■■■□□ 2.02

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