RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550244.1

ZDHHC17-210, Transcript of zinc finger DHHC-type containing 17, humanhuman

TSL 3

Gene ZDHHC17, Length 1,188 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC17-210ENST00000550244 LINC00116Q8NCU8 138 aa6.7□□□□□ -1.34
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ZDHHC17-210ENST00000550244 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
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ZDHHC17-210ENST00000550244 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa6.69□□□□□ -1.34
ZDHHC17-210ENST00000550244 HOMER1Q86YM7 354 aa6.69□□□□□ -1.34
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ZDHHC17-210ENST00000550244 HECW1Q76N89 1606 aa6.68□□□□□ -1.34
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ZDHHC17-210ENST00000550244 CFAP74Q9C0B2 1584 aa6.67□□□□□ -1.34
ZDHHC17-210ENST00000550244 TBX1O43435 398 aa6.67□□□□□ -1.34
ZDHHC17-210ENST00000550244 CDC45O75419 566 aa6.67□□□□□ -1.34
ZDHHC17-210ENST00000550244 VAV1P15498 845 aa6.67□□□□□ -1.34
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ZDHHC17-210ENST00000550244 PDE6BP35913 854 aa6.67□□□□□ -1.34
ZDHHC17-210ENST00000550244 SYNPOQ8N3V7 929 aa6.67□□□□□ -1.34
ZDHHC17-210ENST00000550244 USHBP1Q8N6Y0 703 aa6.67□□□□□ -1.34
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ZDHHC17-210ENST00000550244 C19orf44Q9H6X5 657 aa6.67□□□□□ -1.34
ZDHHC17-210ENST00000550244 CYP26B1Q9NR63 512 aa6.67□□□□□ -1.34
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ZDHHC17-210ENST00000550244 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa6.67□□□□□ -1.34
ZDHHC17-210ENST00000550244 ABCA9Q8IUA7 1624 aa6.67□□□□□ -1.34
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ZDHHC17-210ENST00000550244 SCG5P05408 212 aa6.66□□□□□ -1.34
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ZDHHC17-210ENST00000550244 AKNAQ7Z591 1439 aa6.66□□□□□ -1.34
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ZDHHC17-210ENST00000550244 CLSTN1O94985 981 aa6.65□□□□□ -1.34
ZDHHC17-210ENST00000550244 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
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ZDHHC17-210ENST00000550244 GRIA2P42262 883 aa6.65□□□□□ -1.34
ZDHHC17-210ENST00000550244 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
ZDHHC17-210ENST00000550244 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
ZDHHC17-210ENST00000550244 TEKQ02763 1124 aa6.65□□□□□ -1.34
ZDHHC17-210ENST00000550244 CRB2Q5IJ48 1285 aa6.65□□□□□ -1.34
ZDHHC17-210ENST00000550244 NSMFQ6X4W1 530 aa6.65□□□□□ -1.34
ZDHHC17-210ENST00000550244 C16orf86Q6ZW13 317 aa6.65□□□□□ -1.34
ZDHHC17-210ENST00000550244 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
ZDHHC17-210ENST00000550244 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
ZDHHC17-210ENST00000550244 SP110Q9HB58 689 aa6.65□□□□□ -1.34
ZDHHC17-210ENST00000550244 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
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