RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548896.1

HECTD4-208, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, human

TSL 4

Gene HECTD4, Length 543 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HECTD4-208	ENST00000548896	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
HECTD4-208	ENST00000548896	FAM89A	Q96GI7	184 aa		10.1	□□□□□ -0.79
HECTD4-208	ENST00000548896	USP44	Q9H0E7	712 aa		10.1	□□□□□ -0.79
HECTD4-208	ENST00000548896	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		10.1	□□□□□ -0.79
HECTD4-208	ENST00000548896	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
HECTD4-208	ENST00000548896	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
HECTD4-208	ENST00000548896	NPHS2	Q9NP85	383 aa		10.1	□□□□□ -0.79
HECTD4-208	ENST00000548896	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		10.09	□□□□□ -0.79
HECTD4-208	ENST00000548896	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		10.09	□□□□□ -0.79
HECTD4-208	ENST00000548896	PSMD14	O00487	310 aa		10.09	□□□□□ -0.79
HECTD4-208	ENST00000548896	EIF1AY	O14602	144 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
HECTD4-208	ENST00000548896	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
HECTD4-208	ENST00000548896	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
HECTD4-208	ENST00000548896	PREP	P48147	710 aa		10.09	□□□□□ -0.79
HECTD4-208	ENST00000548896	CTSW	P56202	376 aa		10.09	□□□□□ -0.79
HECTD4-208	ENST00000548896	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
HECTD4-208	ENST00000548896	GSTM4	Q03013	218 aa		10.09	□□□□□ -0.79
HECTD4-208	ENST00000548896	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
HECTD4-208	ENST00000548896	LRP8	Q14114	963 aa		10.09	□□□□□ -0.79
HECTD4-208	ENST00000548896	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		10.09	□□□□□ -0.79
HECTD4-208	ENST00000548896	DMRTB1	Q96MA1	342 aa		10.09	□□□□□ -0.79
HECTD4-208	ENST00000548896	CSRNP1	Q96S65	589 aa		10.09	□□□□□ -0.79
HECTD4-208	ENST00000548896	MEIS3	Q99687	375 aa		10.09	□□□□□ -0.79
HECTD4-208	ENST00000548896	USP26	Q9BXU7	913 aa		10.09	□□□□□ -0.79
HECTD4-208	ENST00000548896	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		10.09	□□□□□ -0.79
HECTD4-208	ENST00000548896	MAF1	Q9H063	256 aa		10.09	□□□□□ -0.79
HECTD4-208	ENST00000548896	EHD4	Q9H223	541 aa		10.09	□□□□□ -0.79
HECTD4-208	ENST00000548896	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		10.09	□□□□□ -0.79
HECTD4-208	ENST00000548896	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
HECTD4-208	ENST00000548896	PNMA2	Q9UL42	364 aa		10.09	□□□□□ -0.79
HECTD4-208	ENST00000548896	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
HECTD4-208	ENST00000548896	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
HECTD4-208	ENST00000548896	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		10.08	□□□□□ -0.8
HECTD4-208	ENST00000548896	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
HECTD4-208	ENST00000548896	DLGAP3	O95886	979 aa		10.08	□□□□□ -0.8
HECTD4-208	ENST00000548896	IGLV1-40	P01703	118 aa		10.08	□□□□□ -0.8
HECTD4-208	ENST00000548896	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
HECTD4-208	ENST00000548896	IGBP1	P78318	339 aa		10.08	□□□□□ -0.8
HECTD4-208	ENST00000548896	PCDH1	Q08174	1060 aa		10.08	□□□□□ -0.8
HECTD4-208	ENST00000548896	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		10.08	□□□□□ -0.8
HECTD4-208	ENST00000548896	FDX2	Q6P4F2	183 aa		10.08	□□□□□ -0.8
HECTD4-208	ENST00000548896	DPH6	Q7L8W6	267 aa		10.08	□□□□□ -0.8
HECTD4-208	ENST00000548896	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
HECTD4-208	ENST00000548896	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		10.08	□□□□□ -0.8
HECTD4-208	ENST00000548896	CCDC74A	Q96AQ1	378 aa		10.08	□□□□□ -0.8
HECTD4-208	ENST00000548896	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
HECTD4-208	ENST00000548896	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		10.08	□□□□□ -0.8
HECTD4-208	ENST00000548896	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		10.08	□□□□□ -0.8
HECTD4-208	ENST00000548896	POLL	Q9UGP5	575 aa		10.08	□□□□□ -0.8
HECTD4-208	ENST00000548896	GSC2	O15499	205 aa		10.07	□□□□□ -0.8
HECTD4-208	ENST00000548896	SRGAP3	O43295	1099 aa		10.07	□□□□□ -0.8
HECTD4-208	ENST00000548896	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
HECTD4-208	ENST00000548896	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	10.07	□□□□□ -0.8
HECTD4-208	ENST00000548896	BMP3	P12645	472 aa		10.07	□□□□□ -0.8
HECTD4-208	ENST00000548896	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
HECTD4-208	ENST00000548896	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
HECTD4-208	ENST00000548896	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
HECTD4-208	ENST00000548896	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		10.07	□□□□□ -0.8
HECTD4-208	ENST00000548896	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		10.07	□□□□□ -0.8
HECTD4-208	ENST00000548896	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		10.07	□□□□□ -0.8
HECTD4-208	ENST00000548896	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		10.07	□□□□□ -0.8
HECTD4-208	ENST00000548896	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		10.07	□□□□□ -0.8
HECTD4-208	ENST00000548896	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
HECTD4-208	ENST00000548896	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	10.07	□□□□□ -0.8
HECTD4-208	ENST00000548896	TNN	Q9UQP3	1299 aa		10.07	□□□□□ -0.8
HECTD4-208	ENST00000548896	RTL9	Q8NET4	1388 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HECTD4-208	ENST00000548896	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HECTD4-208	ENST00000548896	SHTN1	A0MZ66	631 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HECTD4-208	ENST00000548896	HMX2	A2RU54	273 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HECTD4-208	ENST00000548896	ECE2	O60344	883 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HECTD4-208	ENST00000548896	PAX3	P23760	479 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HECTD4-208	ENST00000548896	TM4SF4	P48230	202 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HECTD4-208	ENST00000548896	MTX1	Q13505	466 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HECTD4-208	ENST00000548896	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HECTD4-208	ENST00000548896	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
HECTD4-208	ENST00000548896	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
HECTD4-208	ENST00000548896	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HECTD4-208	ENST00000548896	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HECTD4-208	ENST00000548896	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
HECTD4-208	ENST00000548896	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
HECTD4-208	ENST00000548896	CXorf38	Q8TB03	319 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HECTD4-208	ENST00000548896	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HECTD4-208	ENST00000548896	PMM1	Q92871	262 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HECTD4-208	ENST00000548896	GCC1	Q96CN9	775 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HECTD4-208	ENST00000548896	SUCLG2	Q96I99	432 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HECTD4-208	ENST00000548896	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HECTD4-208	ENST00000548896	NRSN2	Q9GZP1	204 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HECTD4-208	ENST00000548896	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
HECTD4-208	ENST00000548896	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HECTD4-208	ENST00000548896	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HECTD4-208	ENST00000548896	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HECTD4-208	ENST00000548896	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HECTD4-208	ENST00000548896	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HECTD4-208	ENST00000548896	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HECTD4-208	ENST00000548896	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		10.05	□□□□□ -0.8
HECTD4-208	ENST00000548896	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
HECTD4-208	ENST00000548896	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
HECTD4-208	ENST00000548896	RECK	O95980	971 aa		10.05	□□□□□ -0.8
HECTD4-208	ENST00000548896	CASP7	P55210	303 aa		10.05	□□□□□ -0.8
HECTD4-208	ENST00000548896	ATP8B2	P98198	1209 aa		10.05	□□□□□ -0.8

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