RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546997.1

BRF1-208, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, humanhuman

TSL 2

Gene BRF1, Length 1,999 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1-208ENST00000546997 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP18.53■□□□□ 0.56
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BRF1-208ENST00000546997 TMEM260Q9NX78 707 aa18.53■□□□□ 0.56
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BRF1-208ENST00000546997 ERICH4A6NGS2 130 aa18.52■□□□□ 0.56
BRF1-208ENST00000546997 ATP2B1P20020 1258 aa18.52■□□□□ 0.56
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BRF1-208ENST00000546997 USP17L13C9JLJ4 530 aa18.51■□□□□ 0.55
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BRF1-208ENST00000546997 CEP131Q9UPN4 1083 aa18.51■□□□□ 0.55
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BRF1-208ENST00000546997 INF2Q27J81 1249 aa18.5■□□□□ 0.55
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BRF1-208ENST00000546997 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
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BRF1-208ENST00000546997 SNAPC2Q13487 334 aa18.48■□□□□ 0.55
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BRF1-208ENST00000546997 MNS1Q8NEH6 495 aa18.48■□□□□ 0.55
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BRF1-208ENST00000546997 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
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BRF1-208ENST00000546997 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
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BRF1-208ENST00000546997 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
BRF1-208ENST00000546997 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa18.47■□□□□ 0.55
BRF1-208ENST00000546997 ZSCAN12O43309 604 aa18.46■□□□□ 0.55
BRF1-208ENST00000546997 PEX10O60683 326 aa18.46■□□□□ 0.55
BRF1-208ENST00000546997 ZBED4O75132 1171 aa18.46■□□□□ 0.55
BRF1-208ENST00000546997 TRAPPC10P48553 1259 aa18.46■□□□□ 0.55
BRF1-208ENST00000546997 NLRP12P59046 1061 aa18.46■□□□□ 0.55
BRF1-208ENST00000546997 ZNF174Q15697 407 aa18.46■□□□□ 0.55
BRF1-208ENST00000546997 KRBA2Q6ZNG9 492 aa18.46■□□□□ 0.55
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