RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546891.5

CS-205, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 911 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-205ENST00000546891 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 STRIP1Q5VSL9 837 aa10.88□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 STYK1Q6J9G0 422 aa10.88□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa10.88□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 TMEM179Q6ZVK1 233 aa10.88□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 MYOCDQ8IZQ8 938 aa10.88□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 CERS5Q8N5B7 392 aa10.88□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 KIAA0895Q8NCT3 520 aa10.88□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 ERMNQ8TAM6 284 aa10.88□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 JAKMIP2Q96AA8 810 aa10.88□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 CEP63Q96MT8 703 aa10.88□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 MBOAT7Q96N66 472 aa10.88□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 ZMYND15Q9H091 742 aa10.88□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 ACBD3Q9H3P7 528 aa10.88□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 ZNF446Q9NWS9 450 aa10.88□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 MYO6Q9UM54 1294 aa10.88□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 FHOD1Q9Y613 1164 aa10.88□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 F8W031 263 aaPredicted RBP10.87□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 PLSCR1O15162 318 aa10.87□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 COBLO75128 1261 aa10.87□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 TRIM37O94972 964 aa10.87□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 EHHADHQ08426 723 aa10.87□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 MCM6Q14566 821 aa10.87□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP10.87□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 FAM26FQ5R3K3 315 aa10.87□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 CCDC122Q5T0U0 273 aa10.87□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 SLFN13Q68D06 897 aa10.87□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa10.87□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 SLC51AQ86UW1 340 aa10.87□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa10.87□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 LRRC15Q8TF66 581 aa10.87□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 PARD6BQ9BYG5 372 aa10.87□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 NDST4Q9H3R1 872 aa10.87□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 SERPINA10Q9UK55 444 aa10.87□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 RAB21Q9UL25 225 aa10.87□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 PCDHA12Q9UN75 941 aa10.87□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 MYH8P13535 1937 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 ENTPD3O75355 529 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 FCER1AP12319 257 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 SLC1A4P43007 532 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 VAV2P52735 878 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 EIF6P56537 245 aaKnown RBP10.86□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP10.86□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 AMPD2Q01433 879 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 ATP2B2Q01814 1243 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 KIF5AQ12840 1032 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 MAP9Q49MG5 647 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 GRIPAP1Q4V328 841 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 MIIPQ5JXC2 388 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 CCDC70Q6NSX1 233 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 DEFB132Q7Z7B7 95 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 SUPT20HQ8NEM7 779 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 TRIM58Q8NG06 486 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 RUBCNQ92622 972 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 DDX12PQ92771 950 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 GMCL1Q96IK5 515 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 CCDC42Q96M95 316 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 CHP1Q99653 195 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 AMNQ9BXJ7 453 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 ANO3Q9BYT9 981 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 SEMA6BQ9H3T3 888 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP10.86□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 SLC39A2Q9NP94 309 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 KCNMB3Q9NPA1 279 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 FAM184BQ9ULE4 1060 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 POTEMA6NI47 508 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 USP17L10C9JJH3 530 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 TACC1O75410 805 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 IDEP14735 1019 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 MARSP56192 900 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 HERVK_113P62684 666 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 ICA1Q05084 483 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 COASYQ13057 564 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 TERF2Q15554 542 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP10.85□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 UBE2SQ16763 222 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 DOK7Q18PE1 504 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 QRICH1Q2TAL8 776 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 Q4G0T1 1027 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 TATDN1Q6P1N9 297 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 WDR59Q6PJI9 974 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP10.85□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 HDXQ7Z353 690 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 CCDC155Q8N6L0 562 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP10.85□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 CNKSR1Q969H4 720 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 AKT1S1Q96B36 256 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 FAM20AQ96MK3 541 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-205ENST00000546891 ALS2CR12Q96Q35 445 aa10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms