RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531995.1

PUF60-218, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 3

Gene PUF60, Length 631 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-218ENST00000531995 MFSD5Q6N075 450 aa21.51■■□□□ 1.03
PUF60-218ENST00000531995 CCDC82Q8N4S0 544 aa21.51■■□□□ 1.03
PUF60-218ENST00000531995 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
PUF60-218ENST00000531995 NFIBO00712 420 aa21.5■■□□□ 1.03
PUF60-218ENST00000531995 TLR3O15455 904 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
PUF60-218ENST00000531995 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
PUF60-218ENST00000531995 LARGE1O95461 756 aa21.5■■□□□ 1.03
PUF60-218ENST00000531995 ACRP10323 421 aa21.5■■□□□ 1.03
PUF60-218ENST00000531995 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP21.5■■□□□ 1.033e-6■■□□□ 12.6
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PUF60-218ENST00000531995 SLC30A10Q6XR72 485 aa21.5■■□□□ 1.03
PUF60-218ENST00000531995 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa21.5■■□□□ 1.03
PUF60-218ENST00000531995 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa21.49■■□□□ 1.03
PUF60-218ENST00000531995 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa21.49■■□□□ 1.03
PUF60-218ENST00000531995 CYP2C18P33260 490 aa21.49■■□□□ 1.03
PUF60-218ENST00000531995 PSMC6P62333 389 aa21.49■■□□□ 1.03
PUF60-218ENST00000531995 RABEP1Q15276 862 aa21.49■■□□□ 1.03
PUF60-218ENST00000531995 ME3Q16798 604 aa21.49■■□□□ 1.03
PUF60-218ENST00000531995 FBXO11Q86XK2 927 aa21.49■■□□□ 1.03
PUF60-218ENST00000531995 HOMER1Q86YM7 354 aa21.49■■□□□ 1.03
PUF60-218ENST00000531995 PIBF1Q8WXW3 757 aa21.49■■□□□ 1.03
PUF60-218ENST00000531995 AP5M1Q9H0R1 490 aa21.49■■□□□ 1.03
PUF60-218ENST00000531995 UMODL1Q5DID0 1318 aa21.49■■□□□ 1.03
PUF60-218ENST00000531995 PTPDC1A2A3K4 754 aa21.48■■□□□ 1.03
PUF60-218ENST00000531995 OPLAHO14841 1288 aa21.48■■□□□ 1.03
PUF60-218ENST00000531995 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
PUF60-218ENST00000531995 PFKFB2O60825 505 aa21.48■■□□□ 1.03
PUF60-218ENST00000531995 NKX3-2P78367 333 aa21.48■■□□□ 1.03
PUF60-218ENST00000531995 SCRN1Q12765 414 aa21.48■■□□□ 1.03
PUF60-218ENST00000531995 STK3Q13188 491 aa21.48■■□□□ 1.03
PUF60-218ENST00000531995 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
PUF60-218ENST00000531995 USH1GQ495M9 461 aa21.48■■□□□ 1.03
PUF60-218ENST00000531995 TAPT1Q6NXT6 567 aa21.48■■□□□ 1.03
PUF60-218ENST00000531995 C16orf59Q7L2K0 433 aa21.48■■□□□ 1.03
PUF60-218ENST00000531995 TBC1D5Q92609 795 aa21.48■■□□□ 1.03
PUF60-218ENST00000531995 MYH6P13533 1939 aa21.48■■□□□ 1.03
PUF60-218ENST00000531995 CHD7Q9P2D1 2997 aa21.48■■□□□ 1.03
PUF60-218ENST00000531995 TMEM265A0A087WTH1 108 aa21.47■■□□□ 1.03
PUF60-218ENST00000531995 GRXCR1A8MXD5 290 aa21.47■■□□□ 1.03
PUF60-218ENST00000531995 CD4P01730 458 aa21.47■■□□□ 1.03
PUF60-218ENST00000531995 PBX2P40425 430 aa21.47■■□□□ 1.03
PUF60-218ENST00000531995 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
PUF60-218ENST00000531995 GRIN2CQ14957 1233 aa21.47■■□□□ 1.03
PUF60-218ENST00000531995 TMEM240Q5SV17 173 aa21.47■■□□□ 1.03
PUF60-218ENST00000531995 TMEM199Q8N511 208 aa21.47■■□□□ 1.03
PUF60-218ENST00000531995 TIFAQ96CG3 184 aa21.47■■□□□ 1.03
PUF60-218ENST00000531995 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
PUF60-218ENST00000531995 AMNQ9BXJ7 453 aa21.47■■□□□ 1.03
PUF60-218ENST00000531995 VTA1Q9NP79 307 aa21.47■■□□□ 1.03
PUF60-218ENST00000531995 PNMA2Q9UL42 364 aa21.47■■□□□ 1.03
PUF60-218ENST00000531995 V9GY48 417 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
PUF60-218ENST00000531995 GRIN2DO15399 1336 aa21.47■■□□□ 1.03
PUF60-218ENST00000531995 TANC1Q9C0D5 1861 aa21.46■■□□□ 1.03
PUF60-218ENST00000531995 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
PUF60-218ENST00000531995 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa21.46■■□□□ 1.03
PUF60-218ENST00000531995 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
PUF60-218ENST00000531995 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
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PUF60-218ENST00000531995 CALML3P27482 149 aa21.46■■□□□ 1.03
PUF60-218ENST00000531995 ST3GAL1Q11201 340 aa21.46■■□□□ 1.03
PUF60-218ENST00000531995 ITGA7Q13683 1181 aa21.46■■□□□ 1.03
PUF60-218ENST00000531995 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
PUF60-218ENST00000531995 NECAB1Q8N987 351 aa21.46■■□□□ 1.03
PUF60-218ENST00000531995 HIPK3Q9H422 1215 aa21.46■■□□□ 1.03
PUF60-218ENST00000531995 ABCB11O95342 1321 aa21.46■■□□□ 1.03
PUF60-218ENST00000531995 SCN5AQ14524 2016 aa21.45■■□□□ 1.02
PUF60-218ENST00000531995 B4GALT4O60513 344 aa21.45■■□□□ 1.02
PUF60-218ENST00000531995 DTNBO60941 627 aa21.45■■□□□ 1.02
PUF60-218ENST00000531995 ZNF365Q70YC5 407 aa21.45■■□□□ 1.02
PUF60-218ENST00000531995 PHKBQ93100 1093 aa21.45■■□□□ 1.02
PUF60-218ENST00000531995 PBX4Q9BYU1 374 aa21.45■■□□□ 1.02
PUF60-218ENST00000531995 TRPV6Q9H1D0 765 aa21.45■■□□□ 1.02
PUF60-218ENST00000531995 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa21.45■■□□□ 1.02
PUF60-218ENST00000531995 ZEB2O60315 1214 aa21.44■■□□□ 1.02
PUF60-218ENST00000531995 PPFIA3O75145 1194 aa21.44■■□□□ 1.02
PUF60-218ENST00000531995 CABYRO75952 493 aa21.44■■□□□ 1.02
PUF60-218ENST00000531995 CTDNEP1O95476 244 aa21.44■■□□□ 1.02
PUF60-218ENST00000531995 CCL23P55773 120 aa21.44■■□□□ 1.02
PUF60-218ENST00000531995 PKN1Q16512 942 aa21.44■■□□□ 1.02
PUF60-218ENST00000531995 SLC43A3Q8NBI5 491 aa21.44■■□□□ 1.02
PUF60-218ENST00000531995 RGS22Q8NE09 1264 aa21.44■■□□□ 1.02
PUF60-218ENST00000531995 MORC4Q8TE76 937 aa21.44■■□□□ 1.02
PUF60-218ENST00000531995 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
PUF60-218ENST00000531995 ZNF576Q9H609 170 aa21.44■■□□□ 1.02
PUF60-218ENST00000531995 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
PUF60-218ENST00000531995 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa21.44■■□□□ 1.02
PUF60-218ENST00000531995 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
PUF60-218ENST00000531995 RASIP1Q5U651 963 aa21.43■■□□□ 1.02
PUF60-218ENST00000531995 IQSEC1Q6DN90 963 aa21.43■■□□□ 1.02
PUF60-218ENST00000531995 TYW1BQ6NUM6 668 aa21.43■■□□□ 1.02
PUF60-218ENST00000531995 USP38Q8NB14 1042 aa21.43■■□□□ 1.02
PUF60-218ENST00000531995 WNT8AQ9H1J5 351 aa21.43■■□□□ 1.02
PUF60-218ENST00000531995 IL23AQ9NPF7 189 aa21.43■■□□□ 1.02
PUF60-218ENST00000531995 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
PUF60-218ENST00000531995 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
PUF60-218ENST00000531995 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa21.43■■□□□ 1.02
PUF60-218ENST00000531995 GHRHRQ02643 423 aa21.42■■□□□ 1.02
PUF60-218ENST00000531995 DUSP28Q4G0W2 176 aa21.42■■□□□ 1.02
PUF60-218ENST00000531995 RNF207Q6ZRF8 634 aa21.42■■□□□ 1.02
PUF60-218ENST00000531995 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa21.42■■□□□ 1.02
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