RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 UBXN2AP68543 259 aa8.71□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP8.71□□□□□ -1.019e-8■■■□□ 15.4
TRPS1-208ENST00000519076 IGSF22Q8N9C0 903 aa8.71□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 DPF2Q92785 391 aa8.71□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 CTAGE1Q96RT6 745 aa8.71□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 TAOK3Q9H2K8 898 aa8.71□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 JMJD4Q9H9V9 463 aa8.71□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 TBC1D7Q9P0N9 293 aa8.71□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 WNK3Q9BYP7 1800 aa8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 A0A087X0B3 334 aa8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 TMCO5BA8MYB1 307 aa8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 RPS6KA3P51812 740 aa8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 UBXN1Q04323 297 aa8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 SPAG1Q07617 926 aa8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 CIAPIN1Q6FI81 312 aa8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 EFCAB13Q8IY85 973 aa8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 ANKS1AQ92625 1134 aa8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 GJA10Q969M2 543 aa8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 SHISA4Q96DD7 197 aa8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 IMPACTQ9P2X3 320 aa8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 LRP5O75197 1615 aa8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 LAD1O00515 517 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 NDUFB10O96000 172 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 SPATA1Q5VX52 437 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 NCAPH2Q6IBW4 605 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 ARMC2Q8NEN0 867 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM39BQ9GZU3 492 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 SLC39A2Q9NP94 309 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 SAMM50Q9Y512 469 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 CYP4A11Q02928 519 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 GRIK3Q13003 919 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 LEKR1Q6ZMV7 388 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 URI1O94763 535 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 CDC25BP30305 580 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 STAT2P52630 851 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 MCM6Q14566 821 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 TBC1D25Q3MII6 688 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 SYDE2Q5VT97 1194 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 NME8Q8N427 588 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
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TRPS1-208ENST00000519076 ZNRF3Q9ULT6 936 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 NHSQ6T4R5 1651 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 IRS2Q9Y4H2 1338 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 ZSCAN12O43309 604 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 CORO7P57737 925 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 MORC3Q14149 939 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 NPY5RQ15761 445 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 SLC5A9Q2M3M2 681 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 FAM83BQ5T0W9 1011 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 GBP6Q6ZN66 633 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 ERMNQ8TAM6 284 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 AK8Q96MA6 479 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 BPIFA3Q9BQP9 254 aa8.69□□□□□ -1.02
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TRPS1-208ENST00000519076 GLT8D2Q9H1C3 349 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 SH2D4AQ9H788 454 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 hCG_1984214I3L0E3 225 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 OATP04181 439 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 ELF1P32519 619 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 ECE1P42892 770 aa8.69□□□□□ -1.02
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TRPS1-208ENST00000519076 NEDD9Q14511 834 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 FKBP15Q5T1M5 1219 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 GPIHBP1Q8IV16 184 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 CHURC1Q8WUH1 139 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 ANO3Q9BYT9 981 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 PSD3Q9NYI0 1048 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 SUN2Q9UH99 717 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 KIAA1024Q9UPX6 916 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 DUOX1Q9NRD9 1551 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-208ENST00000519076 MYO3BQ8WXR4 1341 aa8.69□□□□□ -1.02
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