RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516162.1

RNU6-1333P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1333, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1333P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CD38P28907 300 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NKX3-2P78367 333 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FSTL1Q12841 308 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GPR162Q16538 588 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CR1LQ2VPA4 569 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1333P-201ENST00000516162 LAIR1Q6GTX8 287 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1333P-201ENST00000516162 OVOS1Q6IE37 1185 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1333P-201ENST00000516162 REC114Q7Z4M0 266 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1333P-201ENST00000516162 C7orf61Q8IZ16 206 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZSWIM3Q96MP5 696 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1333P-201ENST00000516162 AP5M1Q9H0R1 490 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CNNM2Q9H8M5 875 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1333P-201ENST00000516162 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1333P-201ENST00000516162 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1333P-201ENST00000516162 WWC3Q9ULE0 1092 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1333P-201ENST00000516162 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1333P-201ENST00000516162 IKBKBO14920 756 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SHOXO15266 292 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 IFNGR1P15260 489 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 STAT5AP42229 794 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MPP2Q14168 576 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RCSD1Q6JBY9 416 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TMEM192Q8IY95 271 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 IFNL2Q8IZJ0 200 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RIOX1Q9H6W3 641 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GULP1Q9UBP9 304 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SGSM2O43147 1006 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RHOBTB3O94955 611 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PEX11BO96011 259 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CD3EP07766 207 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PROZP22891 400 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MAPK7Q13164 816 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 EEF1DP3Q658K8 133 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TXNDC2Q86VQ3 553 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SLC6A18Q96N87 628 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CROTQ9UKG9 612 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GCP02774 474 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PF4P02776 101 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SCRN1Q12765 414 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GRM7Q14831 915 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GAREM2Q75VX8 874 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NLRC3Q7RTR2 1065 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ADGRG3Q86Y34 549 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NUDT10Q8NFP7 164 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SEC14L1Q92503 715 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ATG4CQ96DT6 458 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NUDT11Q96G61 164 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TMEM209Q96SK2 561 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CEP72Q9P209 647 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ATE1O95260 518 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MAPK1P28482 360 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GNA15P30679 374 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZNF445P59923 1031 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 Q6ZUG5 572 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GPR150Q8NGU9 434 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RHOVQ96L33 236 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 YIPF4Q9BSR8 244 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FHOD1Q9Y613 1164 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZAR1LA6NP61 321 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 KLHL18O94889 574 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FUCA1P04066 466 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 COL6A1P12109 1028 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CSF2RBP32927 897 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SLC6A11P48066 632 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MILR1Q7Z6M3 343 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FIBCD1Q8N539 461 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 C9orf106Q8NAJ2 232 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 AJUBAQ96IF1 538 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PARPBPQ9NWS1 579 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TNFRSF10CO14798 259 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NPHS1O60500 1241 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GJA4P35212 333 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RAC3P60763 192 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZNF568Q3ZCX4 644 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ANKRD39Q53RE8 183 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MEI1Q5TIA1 1274 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FBXO27Q8NI29 283 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PLEKHO2Q8TD55 490 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1333P-201ENST00000516162 BRF1Q92994 677 aa2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.5 ms