RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513533.1

HOXC-AS2-201, HOXC cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS2, Length 504 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RMDN3Q96TC7 470 aa13.76□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 STK17AQ9UEE5 414 aa13.76□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PTPRFP10586 1907 aa13.75□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NFIBO00712 420 aa13.75□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MAFGO15525 162 aa13.75□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SLC37A4O43826 429 aa13.75□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NLRP12P59046 1061 aa13.75□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HERVK_113P62684 666 aa13.75□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RPS6P62753 249 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TMEM132BQ14DG7 1078 aa13.75□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TREML2Q5T2D2 321 aa13.75□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PCNX4Q63HM2 1172 aa13.75□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RIOX2Q8IUF8 465 aa13.75□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FAM200AQ8TCP9 573 aa13.75□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SNX29Q8TEQ0 813 aa13.75□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa13.75□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 WNK4Q96J92 1243 aa13.75□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NMRK2Q9NPI5 230 aa13.75□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PARP14Q460N5 1801 aa13.75□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LOC285556D6RIA3 1793 aa13.75□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SMTNL1A8MU46 457 aa13.74□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GAS7O60861 476 aa13.74□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 POTEIP0CG38 1075 aa13.74□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 POTEJP0CG39 1038 aa13.74□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 BCRP11274 1271 aa13.74□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZNF165P49910 485 aa13.74□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IL17AQ16552 155 aa13.74□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GNPTABQ3T906 1256 aa13.74□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MUM1L1Q5H9M0 696 aa13.74□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SV2BQ7L1I2 683 aa13.74□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NCAPG2Q86XI2 1143 aa13.74□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 REPS2Q8NFH8 660 aa13.74□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DNERQ8NFT8 737 aa13.74□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CRYGNQ8WXF5 182 aa13.74□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GSDMAQ96QA5 445 aa13.74□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IWS1Q96ST2 819 aa13.74□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MXRA8Q9BRK3 442 aa13.74□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZNF577Q9BSK1 485 aa13.74□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PAGR1Q9BTK6 254 aa13.74□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SPATC1LQ9H0A9 340 aa13.74□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MROH8Q9H579 483 aa13.74□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KCNMB3Q9NPA1 279 aa13.74□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa13.73□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 AFMP43652 599 aa13.73□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HUNKP57058 714 aa13.73□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KARSQ15046 597 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CCL15Q16663 113 aa13.73□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ANO6Q4KMQ2 910 aa13.73□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LRCH2Q5VUJ6 765 aa13.73□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 USP49Q70CQ1 688 aa13.73□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ANKRD23Q86SG2 305 aa13.73□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GAS2L3Q86XJ1 694 aa13.73□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MLKLQ8NB16 471 aa13.73□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TBC1D5Q92609 795 aa13.73□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PAGE5Q96GU1 130 aa13.73□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RIT2Q99578 217 aa13.73□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TEKT3Q9BXF9 490 aa13.73□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RBSNQ9H1K0 784 aa13.73□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PXMP2Q9NR77 195 aa13.73□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TBC1D22BQ9NU19 505 aa13.73□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TUBE1Q9UJT0 475 aa13.73□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TRPM7Q96QT4 1865 aa13.72□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RPTORQ8N122 1335 aa13.72□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FAM86B1E9PN63 330 aa13.72□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MEIS1O00470 390 aa13.72□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FAM86B2P0C5J1 330 aa13.72□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MUTP22033 750 aa13.72□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PPP1R2P41236 205 aa13.72□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 INHBEP58166 350 aa13.72□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PNOCQ13519 176 aa13.72□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 STIM1Q13586 685 aa13.72□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KCTD2Q14681 263 aa13.72□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NCAPH2Q6IBW4 605 aa13.72□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RNF214Q8ND24 703 aa13.72□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa13.72□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NEK9Q8TD19 979 aa13.72□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HAS1Q92839 578 aa13.72□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FUCA2Q9BTY2 467 aa13.72□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 POTEB2H3BUK9 544 aa13.71□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PDHXO00330 501 aa13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms