RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502974.1

CXCL3-202, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

TSL 2

Gene CXCL3, Length 630 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-202ENST00000502974 USP17L6PQ6QN14 398 aa28.75■■■□□ 2.19
CXCL3-202ENST00000502974 SEPT14Q6ZU15 432 aa28.75■■■□□ 2.19
CXCL3-202ENST00000502974 OR6J1Q8NGC5 347 aa28.75■■■□□ 2.19
CXCL3-202ENST00000502974 PSTPIP2Q9H939 334 aa28.75■■■□□ 2.19
CXCL3-202ENST00000502974 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
CXCL3-202ENST00000502974 MROH7Q68CQ1 1323 aa28.74■■■□□ 2.19
CXCL3-202ENST00000502974 LTBP2Q14767 1821 aa28.74■■■□□ 2.19
CXCL3-202ENST00000502974 MEIS2O14770 477 aa28.74■■■□□ 2.19
CXCL3-202ENST00000502974 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP28.74■■■□□ 2.19
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CXCL3-202ENST00000502974 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP28.74■■■□□ 2.19
CXCL3-202ENST00000502974 TTLL4Q14679 1199 aa28.74■■■□□ 2.19
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CXCL3-202ENST00000502974 IL31RAQ8NI17 732 aa28.74■■■□□ 2.19
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CXCL3-202ENST00000502974 PIK3CDO00329 1044 aa28.73■■■□□ 2.19
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CXCL3-202ENST00000502974 CABYRO75952 493 aa28.73■■■□□ 2.19
CXCL3-202ENST00000502974 TXNP10599 105 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
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CXCL3-202ENST00000502974 CPT1AP50416 773 aa28.72■■■□□ 2.19
CXCL3-202ENST00000502974 STK3Q13188 491 aa28.72■■■□□ 2.19
CXCL3-202ENST00000502974 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
CXCL3-202ENST00000502974 PHKBQ93100 1093 aa28.72■■■□□ 2.19
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CXCL3-202ENST00000502974 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
CXCL3-202ENST00000502974 TOX2Q96NM4 488 aa28.72■■■□□ 2.19
CXCL3-202ENST00000502974 hCG_1984214I3L0E3 225 aa28.71■■■□□ 2.19
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CXCL3-202ENST00000502974 PPFIA3O75145 1194 aa28.71■■■□□ 2.19
CXCL3-202ENST00000502974 ARIH2O95376 493 aa28.71■■■□□ 2.19
CXCL3-202ENST00000502974 SLC34A2O95436 690 aa28.71■■■□□ 2.19
CXCL3-202ENST00000502974 UBE2SQ16763 222 aa28.71■■■□□ 2.19
CXCL3-202ENST00000502974 TYW1BQ6NUM6 668 aa28.71■■■□□ 2.19
CXCL3-202ENST00000502974 PPP1R18Q6NYC8 613 aa28.71■■■□□ 2.19
CXCL3-202ENST00000502974 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa28.71■■■□□ 2.19
CXCL3-202ENST00000502974 VSIG10LQ86VR7 867 aa28.71■■■□□ 2.19
CXCL3-202ENST00000502974 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
CXCL3-202ENST00000502974 COPS5Q92905 334 aa28.71■■■□□ 2.19
CXCL3-202ENST00000502974 FRMPD4Q14CM0 1322 aa28.7■■■□□ 2.19
CXCL3-202ENST00000502974 ARVCFO00192 962 aa28.7■■■□□ 2.18
CXCL3-202ENST00000502974 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.18
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CXCL3-202ENST00000502974 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
CXCL3-202ENST00000502974 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
CXCL3-202ENST00000502974 TMEM39AQ9NV64 488 aa28.7■■■□□ 2.18
CXCL3-202ENST00000502974 BARHL2Q9NY43 387 aa28.7■■■□□ 2.18
CXCL3-202ENST00000502974 TRIM43BA6NCK2 446 aa28.69■■■□□ 2.18
CXCL3-202ENST00000502974 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
CXCL3-202ENST00000502974 SCG2P13521 617 aa28.69■■■□□ 2.18
CXCL3-202ENST00000502974 LY6KQ17RY6 165 aa28.69■■■□□ 2.18
CXCL3-202ENST00000502974 CCDC62Q6P9F0 684 aa28.69■■■□□ 2.18
CXCL3-202ENST00000502974 TDHQ8IZJ6 230 aa28.69■■■□□ 2.18
CXCL3-202ENST00000502974 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
CXCL3-202ENST00000502974 SLC26A6Q9BXS9 759 aa28.69■■■□□ 2.18
CXCL3-202ENST00000502974 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
CXCL3-202ENST00000502974 POLR3EQ9NVU0 708 aa28.69■■■□□ 2.18
CXCL3-202ENST00000502974 IFNAR1P17181 557 aa28.68■■■□□ 2.18
CXCL3-202ENST00000502974 CDK7P50613 346 aa28.68■■■□□ 2.18
CXCL3-202ENST00000502974 FAAP100Q0VG06 881 aa28.68■■■□□ 2.18
CXCL3-202ENST00000502974 MRVI1Q9Y6F6 885 aa28.68■■■□□ 2.18
CXCL3-202ENST00000502974 CPLX1O14810 134 aa28.67■■■□□ 2.18
CXCL3-202ENST00000502974 KIAA0355O15063 1070 aa28.67■■■□□ 2.18
CXCL3-202ENST00000502974 TLR3O15455 904 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
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CXCL3-202ENST00000502974 RAG1P15918 1043 aa28.67■■■□□ 2.18
CXCL3-202ENST00000502974 ADCY7P51828 1080 aa28.67■■■□□ 2.18
CXCL3-202ENST00000502974 AK2P54819 239 aa28.67■■■□□ 2.18
CXCL3-202ENST00000502974 ITGA7Q13683 1181 aa28.67■■■□□ 2.18
CXCL3-202ENST00000502974 BADQ92934 168 aa28.67■■■□□ 2.18
CXCL3-202ENST00000502974 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
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CXCL3-202ENST00000502974 SMCO2A6NFE2 343 aa28.66■■■□□ 2.18
CXCL3-202ENST00000502974 SPDYE3A6NKU9 549 aa28.66■■■□□ 2.18
CXCL3-202ENST00000502974 RGS20O76081 388 aa28.66■■■□□ 2.18
CXCL3-202ENST00000502974 NEK4P51957 841 aa28.66■■■□□ 2.18
CXCL3-202ENST00000502974 ANKRD1Q15327 319 aa28.66■■■□□ 2.18
CXCL3-202ENST00000502974 PKN1Q16512 942 aa28.66■■■□□ 2.18
CXCL3-202ENST00000502974 TPCN1Q9ULQ1 816 aa28.66■■■□□ 2.18
CXCL3-202ENST00000502974 GH1P01241 217 aa28.65■■■□□ 2.18
CXCL3-202ENST00000502974 PSMC6P62333 389 aa28.65■■■□□ 2.18
CXCL3-202ENST00000502974 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
CXCL3-202ENST00000502974 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa28.65■■■□□ 2.18
CXCL3-202ENST00000502974 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
CXCL3-202ENST00000502974 PURAQ00577 322 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
CXCL3-202ENST00000502974 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
CXCL3-202ENST00000502974 FAM126BQ8IXS8 530 aa28.64■■■□□ 2.18
CXCL3-202ENST00000502974 TRIM22Q8IYM9 498 aa28.64■■■□□ 2.18
CXCL3-202ENST00000502974 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
CXCL3-202ENST00000502974 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
CXCL3-202ENST00000502974 RTEL1Q9NZ71 1219 aa28.64■■■□□ 2.18
CXCL3-202ENST00000502974 PCDHA6Q9UN73 950 aa28.64■■■□□ 2.18
CXCL3-202ENST00000502974 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa28.64■■■□□ 2.18
CXCL3-202ENST00000502974 MYH7BA7E2Y1 1941 aa28.64■■■□□ 2.18
CXCL3-202ENST00000502974 A6NJR5 290 aa28.63■■■□□ 2.17
CXCL3-202ENST00000502974 KPNA6O60684 536 aa28.63■■■□□ 2.17
CXCL3-202ENST00000502974 STAM2O75886 525 aa28.63■■■□□ 2.17
CXCL3-202ENST00000502974 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
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